EM Алгоритм для пуассон трехточечного распределения: различия между версиями
[непроверенная версия] | [непроверенная версия] |
Строка 206: | Строка 206: | ||
=== Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма === | === Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма === | ||
+ | Исследование проводилось на суперкомпьютере "Ломоносов". | ||
+ | {| class="wikitable" | ||
+ | |- | ||
+ | ! Компилятор C++ | ||
+ | |- | ||
+ | |impi 5.1.0 | ||
+ | |- | ||
+ | |} | ||
+ | |||
=== Выводы для классов архитектур === | === Выводы для классов архитектур === | ||
Версия 20:03, 3 декабря 2017
Содержание
- 1 Свойства и структура алгоритмов
- 2 Последовательная сложность алгоритма
- 3 Информационный граф
- 4 Программная реализация алгоритма
- 4.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
- 4.2 Локальность данных и вычислений
- 4.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
- 4.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
- 4.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
- 4.6 Выводы для классов архитектур
- 4.7 Существующие реализации алгоритма
- 5 Литература
1 Свойства и структура алгоритмов
1.1 Общее описание алгоритма
EM-алгоритм (англ. expectation-maximization) - алгоритм итерационного типа для численного решения задачи поиска экстремума целевой функции в разнообразных задачах оптимизации. В частности, алгоритм используется в математической статистике для нахождения оценок максимального правдоподобия параметров вероятностных моделей, в случае, когда модель зависит от некоторых скрытых переменных. Каждая итерация алгоритма состоит из двух шагов. На E-шаге (expectation) вычисляется ожидаемое значение функции правдоподобия, при этом скрытые переменные рассматриваются как наблюдаемые. На M-шаге (maximization) вычисляется оценка максимального правдоподобия, таким образом увеличивается ожидаемое правдоподобие, вычисляемое на E-шаге. Затем это значение используется для E-шага на следующей итерации. Алгоритм выполняется до сходимости.
Как правило, ЕМ-алгоритм применяется для решения задач двух типов.
• К первому типу можно отнести задачи, связанные с анализом действительно неполных данных, когда некоторые статистические данные отсутствуют в силу каких-либо причин.
• Ко второму типу задач можно отнести статистические задачи, в которых функция правдоподобия имеет вид, не допускающий удобных аналитических методов исследования, но допускающий серьезные упрощения, если в задачу ввести дополнительные «ненаблюдаемые» (скрытые, латентные) переменные. Примерами прикладных задач второго типа являются задачи распознавания образов, реконструкции изображений. Математическую суть данных задач составляют задачи кластерного анализа, классификации и разделения смесей вероятностных распределений.
1.2 Математическое описание алгоритма
Задача отыскания наиболее правдопободных оценок параметров смесей вероятностных распределений является одним из самых популярных приложений ЕМ-алгоритма.
Базовым предположением в рамках данной задачи является то, что плотность наблюдаемой случайной величины Χ имеет вид:
где k\geqslant 1 - известное натуральное число, ψ_{1}, ..., ψ_{k} - известные плотности распределения, неизвестный параметр θ имеет вид θ=(p_{1}, ..., p_{k}, t_{1},..., t_{k}), причем p_{i}\geqslant 0, i = 1, ..., k, p_{1}+...+p_{k}=1, t_{i}, i=1,...,k, - вообще говоря, многомерные параметры. Плотности ψ_{1}, ..., ψ_{k} будем называть компонентами смеси, параметры p_{1}, ..., p_{k} будем называть весами соответствующих компонент.
Задачей разделения смеси принято называть задачу статистического оценивания параметров θ=(p_{1}, ..., p_{k}, t_{1},..., t_{k}), по известным реализациям случайно величины Χ. Оценивание параметров смешанных пуассоновских моделей сводится к оцениванию смешивающего распределения. Традиционно с этой целью используется классический ЕМ алгоритм. В случае Пуассон трехточечного распределения случайной величины Χ функция плотности относительно считающей меры имеет вид:
где λ - трехточечная случайная величина, то есть принимает значения λ_{1}, λ_{2}, λ_{3} с вероятностями p_{1}, p_{2}, p_{3} соответственно.
Итерационный ЕМ-алгоритм для оценивания неизвестных параметров p_1,p_2,p_3,λ1,λ_2,λ_3 определяется следующим образом. Дана выборка X_1, ..., X_n независимых одинаково распределенных случайных величин таких, что
где p_j \geqslant 0, λ_j \gt 0, j = \{1, 2, 3\} - неизвестные параметры, p_1+p_2+p_3=1
Пусть p^{(m)}_1, p^{(m)}_2 , p^{(m)}_3, λ_1^{(m)}, λ_2^{(m)}, λ_3^{(m)} – оценки этих параметров, полученные на m-й итерации.
Таким образом ЕМ алгоритм для случая пуассон-трехточечного распределения состоит из следующих шагов:
1 шаг алгоритма - вычисление условного математического ожидания:
2 шаг алгоритма - оценивание неизвестных параметров:
1.3 Вычислительное ядро алгоритма
Основные вычисления связаны с поиском параметров пуассон-трехточечного распределения.
1.4 Макроструктура алгоритма
К исходным данным из пуассон-трехточечного распределения применяется ЕМ алгоритм для разделения смеси.
Проводится несколько итераций запуска ЕМ алгоритма на данных.
После каждой итерации получаем параметры распределения. Считаем функцию правдоподобия.
Если ее значение больше, чем в другой итерации, то параметры смеси заменяются на новые.
1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
Здесь приведены основные моменты алгоритма.
// Плотность пуассоновского распределения
double poisson_pdf(int x, double lambda_)
{
return pow(lambda_,x) * exp(-lambda_) / factorial(x);
}
// Функция правдоподобия для пуассон-трехточечного распределения
double likelihood(vector<int> &X, double *lambda_, double *p)
{
double summation = 0.0;
for (int n = 0, length_ext = X.size(); n < length_ext; ++n)
{
double temp = 0.0;
for (int k = 0; k < 3; ++k)
temp += p[k] * poisson_pdf(X[n], lambda_[k]);
summation += log(temp);
}
return summation;
}
//Вычисление начального приближения для EM алгоритма
double p[3], lambda_[3];
double minim = -100000.0;
double sum = 0.0;
for (int i = 0; i < K; ++i)
{
p[i] = rand() % 13371337 + 1;
sum += p[i];
}
for (int i = 0; i < K; ++i)
p[i] /= sum;
for (int i = 0; i < K; ++i)
{
sum = 0.0;
int j, l = 0;
if (i == 0)
j = 0;
else
j = int(N*p[i-1]);
for (int q = j; q < int(N*p[i]); ++q)
sum += X[q];
l += 1;
lambda_[i] = sum/l;
}
double likely = likelihood(X, lambda_, p);
double like = minim;
if (likely > minim)
like = likely;
// ЕМ алгоритм
while (1)
{
//E-шаг
for (int i = 0; i < N; ++i)
{
double denominator = 0.0;
for (int j = 0; j < K; ++j)
denominator += p[j] * poisson_pdf(X[i], lambda_[j]);
for (int k = 0; k < K; ++k)
gamma[i][k] = p[k] * poisson_pdf(X[i], lambda_[k]) / denominator;
}
//M-шаг
for (int k = 0; k < K; ++k)
{
double Nk = 0.0;
for (int n = 0; n < N; ++n)
Nk += gamma[n][k];
//Вычисляем среднее
lambda_[k] = 0.0;
for (int n = 0; n < N; ++n)
lambda_[k] += gamma[n][k] * X[n];
lambda_[k] /= Nk;
//Вычисляем коэффициенты смешивания
p[k] = Nk / N;
}
double new_like = likelihood(X, lambda_, p);
double diff = new_like - like;
if (isnan(diff))
break;
if (abs(diff) < 0.0000000001)
break;
like = new_like;
}
2 Последовательная сложность алгоритма
Вычислим последовательную сложность алгоритма, основываясь на начальных данных и количестве повторов итераций запуска ЕМ алгоритма.
w - количество итераций запуска ЕМ алгоритма
h - количество данных
На каждой итерации ищутся параметры смеси: k\cdot O(h), где k - некоторая константа, которая зависит от начального приближения параметров и влияет на скорость сходимости ЕМ алгоритма, для каждой итерации может быть разной.
В итоге получаем O(k \cdot w \cdot h) операций.
3 Информационный граф
Зеленые вершины - вычисление параметров ЕМ алгоритма.
Желтые вершины - вычисление функции правдоподобия.
3.1 Ресурс параллелизма алгоритма
Из информационного графа видно, что вычисление параметров ЕМ алгоритма и функции правдоподобия на разных итерациях происходит независимо от других, затем они завершаются и первый процесс записывает результат в файл. Пусть N_p \geqslant 2 - количество процессов. Всем процессам, кроме первого поручим выполнить часть итераций запуска ЕМ алгоритма (каждый процесс выполнит \Big[\frac{w}{N_p - 1}\Big] итераций). Первому процессу поручим принять работу и записать результат в файл.
Время работы: O\Big(\frac{k \cdot w \cdot h}{N_p}\Big).
3.2 Входные и выходные данные алгоритма
На вход алгоритму подаются данные из пуассон-трехточечного распределения.
На выходе получаем параметры смеси.
3.3 Свойства алгоритма
4 Программная реализация алгоритма
4.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
4.2 Локальность данных и вычислений
4.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
4.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
4.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
Исследование проводилось на суперкомпьютере "Ломоносов".
Компилятор C++ |
---|
impi 5.1.0 |
4.6 Выводы для классов архитектур
4.7 Существующие реализации алгоритма
5 Литература
↑ В.Ю. Королев "Вероятностно-статистические методы декомпозиции волатильности хаотических процессов".
↑ В. Ю. Королев, А. Ю. Корчагин, А. И. Зейфман "Теорема Пуассона для схемы испытаний Бернулли со случайной вероятностью успеха и дискретный аналог распределения Вейбулла".
↑ http://www.machinelearning.ru/wiki/index.php?title=EM-алгоритм