Последовательно-параллельный метод суммирования: различия между версиями

Материал из Алговики
Перейти к навигации Перейти к поиску
[непроверенная версия][непроверенная версия]
(Перенесено из Последовательно-параллельный_метод-0.2.1.docx.)
 
м (формула, иллюстрация)
Строка 48: Строка 48:
 
Опишем граф алгоритма в виде рисунка. В данном случае выполнено суммирование 30 элементов массива.
 
Опишем граф алгоритма в виде рисунка. В данном случае выполнено суммирование 30 элементов массива.
  
{| align="left"
+
[[file:series-parallel summation graph.png|center|thumb|400px]]
    | [[file:series-parallel summation graph.png|thumb|400px]]
 
|}
 
  
 
=== Описание ресурса параллелизма алгоритма ===
 
=== Описание ресурса параллелизма алгоритма ===
Строка 58: Строка 56:
 
* <math>p - 1</math> ярусов суммирования (одна последовательная ветвь).
 
* <math>p - 1</math> ярусов суммирования (одна последовательная ветвь).
 
   
 
   
Таким образом, в параллельном варианте критический путь алгоритма (и соответствующая ему высота ЯПФ) будет зависеть от произведённого разбиения массива на части. В оптимальном случае (<math>p = \sqrt{n}</math>)  высота ЯПФ будет равна <math>2 \sqrt{n} - 2</math>.
+
Таким образом, в параллельном варианте критический путь алгоритма (и соответствующая ему высота ЯПФ) будет зависеть от произведённого разбиения массива на части. В оптимальном случае (<math>p = \sqrt{n}</math>)  высота ЯПФ будет равна <math>2 \sqrt{n} - 2</math>.
  
 
При классификации по высоте ЯПФ, таким образом, последовательно-параллельный метод относится к алгоритмам со сложностью ''корень квадратный''. При классификации по ширине ЯПФ его сложность будет такой же — ''корень квадратный''.
 
При классификации по высоте ЯПФ, таким образом, последовательно-параллельный метод относится к алгоритмам со сложностью ''корень квадратный''. При классификации по ширине ЯПФ его сложность будет такой же — ''корень квадратный''.
Строка 68: Строка 66:
 
Дополнительные ограничения: отсутствуют.
 
Дополнительные ограничения: отсутствуют.
  
Объём входных данных: <nowiki/><math>N \frac{n (n - 1)}{2}</math>.
+
Объём входных данных: <nowiki/><math>N</math>.
  
 
Выходные данные: сумма элементов массива.
 
Выходные данные: сумма элементов массива.

Версия 21:01, 15 июня 2014

Содержание

1 Описание свойств и структуры алгоритма

1.1 Словесное описание алгоритма

Последовательно-параллельный метод используется в качестве блочной реализации вычисления длинных последовательностей ассоциативных операций (например, массового суммирования). Получил распространение благодаря следующим особенностям: а) реализует приём получения двойных циклов из одинарных; б) в последовательной архитектуре компьютеров позволял для ряда операций уменьшать влияние округления на результат. Здесь будем описывать его версию для суммирования чисел.

1.2 Математическое описание

Исходные данные: одномерный массив N чисел.

Вычисляемые данные: сумма элементов массива.

Формулы метода: число N разлагается в выражение типа N = (p - 1) k + q, где p — количество процессоров, k = \lceil \frac{N}{p} \rceil, q = N - k (p - 1).

После этого на i-м процессоре (i \lt p) последовательно вычисляется сумма элементов массива, начиная с (i - 1) k + 1-го, до i k-го.

S_i = \sum_{j = 1}^k x_{k (i - 1) + j}

На p-м процессоре последовательно вычисляется сумма элементов массива, начиная с (p - 1) k + 1-го до (p - 1) k + q-го.

S_p = \sum_{j = 1}^q x_{k (p - 1) + j}

По окончании этого процесса процессоры обмениваются данными и на одном из них (либо на всех одновременно, если результат нужен далее на всех процессорах) получившиеся суммы суммируются последовательно друг с другом.

\sum_{i = 1}^p S_i

1.3 Вычислительное ядро алгоритма

Вычислительное ядро последовательно-параллельного метода суммирования можно составить из множественных (всего p) вычислений сумм элементов массива:

S_i = \sum_{j = 1}^k x_{k (i - 1) + j}

и ещё одного вычисления суммы элементов частичных сумм

\sum_{i = 1}^p S_i

1.4 Макроструктура алгоритма

Как уже записано в описании ядра алгоритма, основную часть метода составляют множественные (всего p + 1) вычисления сумм

S_i = \sum_{j = 1}^k x_{k (i - 1) + j}
\sum_{i = 1}^p S_i

1.5 Описание схемы реализации последовательного алгоритма

Формулы метода описаны выше. Последовательность исполнения суммирования может быть разная — как по возрастанию, так и по убыванию индексов. Обычно без особых причин порядок не меняют, используя естественный (возрастание индексов).

1.6 Последовательная сложность алгоритма

Для вычисления суммы массива, состоящего из N элементов, при любых разложениях N суть алгоритма сводится к простому переставлению скобок в формуле суммирования, и количество операций неизменно и равно N - 1. Поэтому алгоритм должен быть отнесён к алгоритмам линейной сложности по количеству последовательных операций.

1.7 Информационный граф

Опишем граф алгоритма в виде рисунка. В данном случае выполнено суммирование 30 элементов массива.

Series-parallel summation graph.png

1.8 Описание ресурса параллелизма алгоритма

Для суммирования массива порядка n последовательно-параллельным методом в параллельном варианте требуется последовательно выполнить следующие ярусы:

  • k - 1 ярусов суммирования по частям массива (p ветвей),
  • p - 1 ярусов суммирования (одна последовательная ветвь).

Таким образом, в параллельном варианте критический путь алгоритма (и соответствующая ему высота ЯПФ) будет зависеть от произведённого разбиения массива на части. В оптимальном случае (p = \sqrt{n}) высота ЯПФ будет равна 2 \sqrt{n} - 2.

При классификации по высоте ЯПФ, таким образом, последовательно-параллельный метод относится к алгоритмам со сложностью корень квадратный. При классификации по ширине ЯПФ его сложность будет такой же — корень квадратный.

1.9 Описание входных и выходных данных

Входные данные: массив \vec{x} (элементы x_i).

Дополнительные ограничения: отсутствуют.

Объём входных данных: N.

Выходные данные: сумма элементов массива.

Объём выходных данных: один скаляр.

1.10 Свойства алгоритма

Соотношение последовательной и параллельной сложности в случае неограниченных ресурсов, как хорошо видно, является корнем квадратным (отношение линейной к корню квадратному). При этом вычислительная мощность алгоритма, как отношение числа операций к суммарному объему входных и выходных данных — всего-навсего 1 (входных и выходных данных столько же, сколько операций). При этом алгоритм не вполне полностью детерминирован, суммирование может быть проведено в разном порядке. Использование другого порядка выполнения ассоциативных операций может дать, с учётом особенностей входных данных, уменьшение влияния ошибок округления на результат. Дуги информационного графа локальны.

2 Программная реализация

2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма

В простейшем (без перестановок суммирования) варианте на Фортране можно записать так:

	DO  I = 1, P
		S (I) = X(K*(I-1)+1)
		IF (I.LQ.P) THEN
			DO J = 2,K
				S(I)=S(I)+X(K*(I-1)+J)
		             END DO
		ELSE
			DO J = 2,Q
				S(I)=S(I)+X(K*(I-1)+J)
		             END DO
		END IF
	END DO
	SUM = S(1)
	DO I = 2, P
		SUM = SUM + S(I)
	END DO

Можно записать и аналогичные схемы, где суммирование будет проводиться в обратном порядке. Подчеркнём, что граф алгоритма обеих схем — один и тот же!

2.2 Описание локальности данных и вычислений

2.2.1 Описание локальности алгоритма

2.2.2 Описание локальности реализации алгоритма

2.2.2.1 Описание структуры обращений в память и качественная оценка локальности
2.2.2.2 Количественная оценка локальности
2.2.2.3 Анализ на основе теста Apex-Map

2.3 Возможные способы и особенности реализации параллельного алгоритма

2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации

2.4.1 Описание масштабируемости алгоритма

2.4.2 Описание масштабируемости реализации алгоритма

2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма

2.6 Выводы для классов архитектур

2.7 Существующие реализации алгоритма

В чистом виде алгоритм последовательно-параллельного метода для суммирования массива встречается редко, в основном встречаются его модификации, например для случаев вычисления скалярного произведения (вместо элементов массива будут фигурировать произведения элементов двух массивов), равномерной нормы (вместо элементов массива — их модули) и т. п. В случае вычисления скалярного произведения в одном из частных случаев подобный приём применён в библиотеке BLAS (там одна из размерностей равна 5), но, видимо, не для распараллеливания, а для оптимизации работы с регистрами процессора. Между тем, разбиения массивов на группы для вычислений частных сумм могут быть полезны и для лучшего использования кэша на отдельных узлах.