Участник:Sergey Lavrushkin/EM-алгоритм кластеризации: различия между версиями
Строка 96: | Строка 96: | ||
=== Макроструктура алгоритма === | === Макроструктура алгоритма === | ||
− | Как записано в описании ядра алгоритма, основную часть метода составляют множественные вычисления скрытых переменных <math>y_{ij}</math> на E-шаге и обновление параметров | + | Как записано в описании ядра алгоритма, основную часть метода составляют множественные вычисления скрытых переменных <math>y_{ij}</math> на E-шаге и обновление вектора параметров <math>(w_1, ..., w_k; \mu_1, ..., \mu_k; \Sigma_1, ..., \Sigma_k)</math> на M-шаге. |
+ | Также стоит выделить вычисление определителя и обратной матрицы ковариационных матриц <math>\Sigma_j</math> в начале E-шага. | ||
=== Схема реализации последовательного алгоритма === | === Схема реализации последовательного алгоритма === |
Версия 16:09, 14 октября 2016
Автор статьи: Сергей Лаврушкин (группа 620)
Содержание
- 1 Свойства и структура алгоритма
- 1.1 Общее описание алгоритма
- 1.2 Математическое описание алгоритма
- 1.3 Вычислительное ядро алгоритма
- 1.4 Макроструктура алгоритма
- 1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
- 1.6 Последовательная сложность алгоритма
- 1.7 Информационный граф
- 1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
- 1.9 Входные и выходные данные алгоритма
- 1.10 Свойства алгоритма
- 2 Программная реализация алгоритма
- 3 Литература
1 Свойства и структура алгоритма
1.1 Общее описание алгоритма
1.1.1 EM-алгоритм
EM-алгоритм (англ. expectation-maximization) - алгоритм, используемый в математической статистике для нахождения оценок максимального правдоподобия параметров вероятностных моделей, в случае, когда модель зависит от некоторых скрытых переменных. Каждая итерация алгоритма состоит из двух шагов. На E-шаге (expectation) вычисляется ожидаемое значение функции правдоподобия, при этом скрытые переменные рассматриваются как наблюдаемые. На M-шаге (maximization) вычисляется оценка максимального правдоподобия, таким образом увеличивается ожидаемое правдоподобие, вычисляемое на E-шаге. Затем это значение используется для E-шага на следующей итерации. Алгоритм выполняется до сходимости.
Как правило, ЕМ-алгоритм применяется для решения задач двух типов:
- К первому типу можно отнести задачи, связанные с анализом действительно неполных данных, когда некоторые статистические данные отсутствуют в силу каких-либо причин.
- Ко второму типу задач можно отнести те задачи, в которых функция правдоподобия имеет вид, не допускающий удобных аналитических методов исследования, но допускающий серьезные упрощения, если в задачу ввести дополнительные «ненаблюдаемые» (скрытые, латентные) переменные. Примерами прикладных задач второго типа являются задачи распознавания образов, реконструкции изображений. Математическую суть данных задач составляют задачи кластерного анализа, классификации и разделения смесей вероятностных распределений.
Алгоритм основан на методике итеративного вычисления оценок максимального правдоподобия, предложенной в 1977 г. (A. P. Demster, N. M. Laird, D. B. Rubin. Maximum Likelihood from Incomplete Data via the EM Algorithm).
1.1.2 Кластеризация с помощью EM-алгоритма
Кластеризация — задача разбиения заданной выборки объектов (ситуаций) на непересекающиеся подмножества, называемые кластерами, так, чтобы каждый кластер состоял из схожих объектов, а объекты разных кластеров существенно отличались. В основе идеи применения EM-алгоритма для кластеризации лежит предположение, что исследуемое множество данных может быть смоделировано с помощью линейной комбинации многомерных нормальных распределений, а целью является оценка параметров распределения, которые максимизируют логарифмическую функцию правдоподобия, используемую в качестве меры качества модели. К оцениваемым параметрам относятся математические ожидания и ковариационные матрицы. Предполагается, что любое наблюдение принадлежит ко всем кластерам, но с разной вероятностью. Задача заключается в "подгонке" распределений смеси к данным, а затем в определении вероятностей принадлежности наблюдения к каждому кластеру. Наблюдение должно быть отнесено к тому кластеру, для которого данная вероятность выше.
Алгоритм EM основан на вычислении расстояний. Он может рассматриваться как обобщение кластеризации на основе анализа смеси вероятностных распределений. В процессе работы алгоритма происходит итеративное улучшение решения, а остановка осуществляется в момент, когда достигается требуемый уровень точности модели. Мерой в данном случае является монотонно увеличивающаяся статистическая величина, называемая логарифмическим правдоподобием.
1.2 Математическое описание алгоритма
Исходные данные:
- k — число кластеров,
- X =\{x_{1}, x_{2}, ..., x_{n}\} — множество из n наблюдений q-мерного пространства.
Вычисляемые данные:
- (w, \theta) = (w_1, ..., w_k; \mu_1, ..., \mu_k; \Sigma_1, ..., \Sigma_k) — параметры смеси гауссовых распределений,
- Y — матрица размера n \times k с вероятностями членства в кластерах.
1.2.1 Постановка задачи разделения смеси гауссовых распределений
Пусть w_1, ..., w_k — априорные вероятности кластеров, p_1(x), ..., p_k(x) — плотности распределения кластеров. Тогда плотность распределения вектора признаков x сразу по всем кластерам равна:
- \begin{align} p(x) = \sum_{j=1}^{k}w_jp_j(x) \end{align}
Необходимо на основе выборки оценить параметры модели w_1, ..., w_k, p_1(x), ..., p_k(x). Это позволит оценивать вероятность принадлежности к кластеру и, таким образом, решить задачу кластеризации. Такая задача называется задачей разделения смеси распределений:
- \begin{align} p(x) = \sum_{j=1}^{k}w_jp_j(x),\quad p_j(x) = \phi(\theta_j; x), \end{align}
где \theta_j — параметры распределения p_j(x). В случае смести гауссовых распределений предполагается, что все компоненты имеют многомерное нормальное распределение. То есть в случае q-мерного пространства признаков p_j(x) имеют следующий вид:
- \begin{align} & p_j(x) = \frac{1}{\Big(2\pi\Big)^{\frac{q}{2}}\sqrt{|\Sigma_j|}}\exp{\bigg\{-\frac{\delta^2}{2}\bigg\} },\\ & \delta^2 = \Big( x - \mu_j \Big)^T \Sigma_j^{-1} \Big( x - \mu_j \Big), \end{align}
где:
- \Sigma_j — ковариационная матрица размером q \times q,
- \mu_j — q-мерный вектор математических ожиданий,
- \delta^2 — квадратичное расстояние Махаланобиса.
В случае смеси гауссовых распределений получаем, что \theta_j = (\mu_j, \Sigma_j). То есть для решения задачи разделения смеси гауссовых распределений необходимо оценить вектор параметров (w, \theta) = (w_1, ..., w_k; \mu_1, ..., \mu_k; \Sigma_1, ..., \Sigma_k). Согласно принципу максимизации правдоподобия:
- \begin{align} w, \theta = \underset{w, \theta}{\operatorname{argmax}} \sum_{i=1}^{n}\ln{p(x_i)} = \underset{w, \theta}{\operatorname{argmax}} \sum_{i=1}^{n}\ln{\sum_{j=1}^{k}w_jp_j(x_i)} \end{align}
Таким образом, имеет место задача максимизации суммы логарифмов сумм, решение которой представляет большую трудность. В таком случае полезным оказывается итеративный метод решения — EM-алгоритм.
1.2.2 EM-алгоритм
Оптимальные параметры задачи разделения смеси гауссовых распределений отыскиваются последовательно с помощью итерационного EM-алгоритма. Основная идея – вводится вспомогательный вектор скрытых переменных. Это позволяет свести сложную оптимизационную задачу к последовательности итераций по пересчету коэффициентов (скрытых переменных по текущему приближению вектора параметров - E-шаг) и максимизации правдоподобия (с целью найти следующее приближение вектора - М-шаг).
EM-алгоритм заключается в следующем:
- В начале работы алгоритма задаются параметры начального приближения. Наиболее общим способом инициализации является присвоение элементам матрицы математических ожиданий случайных значений \mu_j \leftarrow Random , начальные ковариационные матрицы определяются как единчиные \Sigma_j \leftarrow I, веса кластеров задаются одинаковыми w_i \leftarrow \frac{1}{k}. Также в качестве начальных параметров можно использовать результат работы алгоритма K-means. (Данная эвристика применяется, так как K-means требуется намного меньше итераций до достижения стабилизации, в то время как каждый шаг EM требует больших вычислительных затрат).
- Далее итеративно выполняется следующая пара процедур:
- E-шаг: используя текущее значение вектора параметров (w, \theta) = (w_1, ..., w_k; \mu_1, ..., \mu_k; \Sigma_1, ..., \Sigma_k), вычисляем значение вектора скрытых переменных y:
- \begin{align} & y_{ij} = \frac{w_j p_j(x_i)}{\sum_{l=1}^{k}w_lp_l(x_i)} \end{align}
- М-шаг: переоценка вектора параметров, используя текущее значение вектора скрытых переменных:
- \begin{align} & n_j = \sum_{i = 1}^{n}y_{ij}, \\ & \mu_j^{new} = \frac{1}{n_j} \sum_{i = 1}^{n}y_{ij}x_i, \\ & \Sigma_j^{new} = \frac{1}{n_j} \sum_{i = 1}^{n}y_{ij}(x_i - \mu_j^{new})(x_i - \mu_j^{new})^T,\\ & w_j^{new} = \frac{n_j}{n}. \end{align}
- E-шаг: используя текущее значение вектора параметров (w, \theta) = (w_1, ..., w_k; \mu_1, ..., \mu_k; \Sigma_1, ..., \Sigma_k), вычисляем значение вектора скрытых переменных y:
Итерации происходят до сходимости (норма разности векторов скрытых переменных или изменение логарифмического правдоподобия на каждой итерации не будет превышать заданную константу) или достижения максимального числа итераций.
1.3 Вычислительное ядро алгоритма
В вычислительное ядро EM-алгоритма входят:
- Вычисление скрытых переменных y_{ij} на E-шаге (всего их nk).
- Переоценка вектора параметров (w_1, ..., w_k; \mu_1, ..., \mu_k; \Sigma_1, ..., \Sigma_k) на M-шаге, используя текущие значения скрытых переменных y_{ij}.
1.4 Макроструктура алгоритма
Как записано в описании ядра алгоритма, основную часть метода составляют множественные вычисления скрытых переменных y_{ij} на E-шаге и обновление вектора параметров (w_1, ..., w_k; \mu_1, ..., \mu_k; \Sigma_1, ..., \Sigma_k) на M-шаге. Также стоит выделить вычисление определителя и обратной матрицы ковариационных матриц \Sigma_j в начале E-шага.
1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
Последовательная реализация алгоритма EM может быть проиллюстрирована с помощью следующего псевдокода:
- Инициализация: установка начальных значений \mu, \, \Sigma_j \, (j = \overline{1, k}), \, w.
- Пока изменение логарифмического правдоподобия \Delta llh \geq \epsilon и не достигнуто максимальное число итераций m, выполнять шаги E и M.
Шаг E
def E-step: Инициализировать нулевыми значениями [math]\mu^{'}, \, \Sigma_j^{'} \, (j = \overline{1, k}), \, w^{'}, \, llh[/math] for [math]j = \overline{1, k}[/math]: Вычислить определитель и обратную матрицу матрицы [math]\Sigma_j[/math] for [math]i = \overline{1, n}[/math]: [math]sump_i = 0[/math] for [math]j = \overline{1, k}[/math]: [math]\delta_{ij} = \big( x_i - \mu_j \big)^T \Sigma_j^{-1} \big( x_i - \mu_j \big)[/math] [math]gij = \frac{w_j}{{2 \pi}^\frac{q}{2}|\Sigma_j|}\exp{\big\{-\frac{\delta^2}{2}\big\} }[/math] [math]sump_i \mathrel{+}= g_{ij}[/math] [math]y_i = \frac{g_i}{sump_i}[/math] [math]llh \mathrel{+}= \ln(sump_i)[/math] [math]\mu^{'} \mathrel{+}= x_iy_i^T[/math] [math]w^{'} \mathrel{+}= y_i[/math]
Шаг M
def M-step: for [math]j = \overline{1, k}[/math]: [math]\mu_j = \frac{\mu_j^{'}}{w_j^{'}}[/math] for [math]i = \overline{1, n}[/math]: [math]\Sigma_j^{'} \mathrel{+}= (x_i - \mu_j)y_{ij}(x_i - \mu_j)^T[/math] [math]\Sigma_j = \frac{\Sigma_j^{'}}{w_j^{'}}[/math] [math]w = \frac{w^{'}}{n}[/math]
Логаририфмическое правдоподобие вычисляется как:
- \begin{align} llh=\sum_{i=1}^{n}\ln{(sump_i)} \end{align}
Матрицы \mu^{'}, \, \Sigma_j^{'} \, (j = \overline{1, k}), \, w^{'} являются временными и используются только для вычислений.
1.6 Последовательная сложность алгоритма
В случае диагональности матриц ковариации определитель матрицы и ее обращение может быть вычислено за время O(q), а алгоритм имеет сложность O(mkqn). В случае недиагональной матрицы сложность алгоритма составит O(mkq^2n), то есть будет квадратично возрастать с увеличением размерности данных.
1.7 Информационный граф
1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
1.9 Входные и выходные данные алгоритма
Входные данные: k — число кластеров; X =\{x_{1}, x_{2}, ..., x_{n}\} — множество из n наблюдений q-мерного пространства.
Объем входных данных: nq + 1
Выходные данные: (w, \theta) = (w_1, ..., w_k; \mu_1, ..., \mu_k; \Sigma_1, ..., \Sigma_k) — параметры смеси гауссовых распределений; Y — матрица размера n \times k с вероятностями членства в кластерах.
Объем выходных данных: k(n + q^2 + q + 1)
1.10 Свойства алгоритма
1.10.1 Достоинства и недостатки алгоритма
Среди достоинств EM-алгоритма можно выделить следующие:
- Мощная статистическая основа.
- Линейное увеличение сложности при росте объема данных.
- Устойчивость к шумам и пропускам в данных.
- Возможность построения желаемого числа кластеров.
- Быстрая сходимость при удачной инициализации.
К недостаткам EM-алгоритма можно отнести следующее:
- Алгоритм неустойчив по начальным данным (то есть тем, которые инициализируют вектор параметров на первой итерации), так как он находит локальный экстремум, значение которого может оказаться гораздо ниже, чем глобальный максимум. В зависимости от выбора начального приближения алгоритм может сходиться к разным точкам. Также может сильно варьироваться скорость сходимости.
- Алгоритм не позволяет определять количество k компонент смеси. Эта величина является структурным параметром алгоритма.
- Предположение о нормальности всех измерений данных не всегда выполняется.
2 Программная реализация алгоритма
2.1 Масштабируемость реализации алгоритма
2.2 Существующие реализации алгоритма
3 Литература
- A. Dempster, N. Laird and D. Rubin. Maximum likelihood estimation from incomplete data. – Journal of the Royal Statistical Society, Series B, 1977, vol. 39, p. 1-38.