Участник:Smirnov.maxim/BIRCH: различия между версиями

Материал из Алговики
Перейти к навигации Перейти к поиску
Строка 124: Строка 124:
  
 
== Сам алгоритм ==
 
== Сам алгоритм ==
 +
 +
Рисунок 1 представляет обзор алгоритма BIRCH. Главной задачей фазы 1 является сканирование всех данных и построение в памяти исходного CF дерева, используя заданное количество памяти. Это дерево старается отразить информацию о кластеризации данных настолько хорошо, насколько это позволяют ограничения по памяти. Тогда как плотно распределённые данные хорошо группируются в подкластеры, более разрозненные данные удаляются. После Фазы 1 вспомогательные вычисления в дальнейших фазах будут:
 +
 +
1) быстрее, потому что (а) больше не нужны операции ввода-вывода, (b) проблема кластеризации начальных данных упрощается до проблемы кластеризации подкластеров в листьевых записях;
 +
 +
2) точнее, потому что (а) большинство данных с низкой плотностью удалены, (b) оставшиеся данные распределены оптимально в соответствии с доступным количеством памяти
 +
 +
3) менее чувствительны к порядку, потому что листьевые записи исходного дерева
 +
 +
 +
 +
=== Фаза 1 ===
 +
 +
Рисунок 2 детализирует Фазу 1. Она начинается с определения порогового значения, сканирования данных и добавления данных в дерево. Если память заканчивается до окончания сканирования данных, увеличивается пороговое значение и строится новое, меньшее CF дерево при помощи повторной вставки листьевых записей в старое дерево. После того как старые листьевые записи добавлены повторно, сканирование данных (и вставка в новое дерево) продолжается с той точки, где процесс был приостановлен.
 +
 +
=== Уменьшаемость ===
 +
 +
Пусть <math>t_i</math> - это CF дерево с пороговым значением <math>T_i</math>. Его высота равна <math>h</math>, а размер (количество узлов) равен <math>S_i</math>. Задавая <math>T_{i+1}\geq T_i</math>, мы хотим использовать все листьевые записи <math>t_i</math> для построения нового CF дерева <math>t_{i+1}</math> с пороговым значением <math>T_{i+1}</math> так, чтобы размер <math>t_{i+1}</math> был не больше чем <math>S_i</math>. Далее описан алгоритм повторного построения, а также последовательность теорем уменьшаемости.
 +
 +
Предположим, что внутри каждого CF дерева <math>t_i</math> все соседние записи пронумерованы от <math>0</math> до <math>n_k-1</math>, где <math>n_k</math> - это число записей в данном узле. Тогда '''путь''' из корневой записи (уровень 1) до листьевого узла (уровень ''h'') уникально представляется вектором <math>(i_1, i_2, ..., i_{h-1})</math>, где <math>i_j, j=1,...,h-1</math> - это номера записей j-го уровня. Поэтому естественно принять, что путь <math>({i_1}^(1), {i_2}^(1), ..., {i_{h-1}}^(1))</math> '''меньше''' пути <math>({i_1}^(2), {i_2}^(2), ..., {i_{h-1}}^(2))</math>, если <math>{i_1}^{(1)}={i_1}^{(2)}, ..., {i_{j-1}}^{(1)}={i_{j-1}}^{(2)}</math> и  <math>{i_j}^{(1)}<{i_j}^{(2)}</math> <math>(0 \leq j \leq h-1) </math>. Очевидно, что между понятиями листа и пути существует точное соответствие, поэтому в дальнейшем мы будет использовать эти понятия взаимозаменяемо.
  
  

Версия 13:49, 15 октября 2016


1 ЧАСТЬ. Свойства и структура алгоритмов

1.1 Общее описание алгоритма

Нахождение полезных для анализа закономерностей в больших объёмах данных с недавних пор вызывает значительный интерес. В связи с этим ввелось и стало активно развиваться такое понятие как кластеризация.

Ранние работы и алгоритмы, разработанные в этой области, не уделяли достаточного внимания рассматриванию очень больших наборов данных или минимизации издержек на процессы ввода-вывода. Решением этих проблем стал алгоритм, известный под названием BIRCH.

BIRCH (balanced iterative reducing and clustering using hierarchies)- самостоятельный алгоритм, применяемый в области Data mining и использующий принципы иерархической кластеризации. Если имеется очень большой набор данных, то в пространстве он распределен, как правило, неравномерно. Кластерный анализ определяет места наибольшего и наименьшего скоплений, чтобы таким образом понять всю картину целиком. Кроме того, полученные кластеры визуализируются гораздо нагляднее, чем первоначальные данные. Задачей алгоритмов кластеризации является не только простое разбиение данных на кластеры, но и использование при этом ограниченной памяти (как правило, размер доступной памяти гораздо меньше, чем размер исходного набора данных) и минимизация времени, требуемого на операции ввода/вывода.

Для наилучшего решения этих проблем BIRCH распределяет входящие данные по кластерам динамически. Как правило, для эффективной кластеризации алгоритму требуется всего одно сканирование данных (т.е. с увеличением размера сложность увеличивается линейно). А при помощи одной (или более)дополнительных итераций можно и далее улучшать эффективность. BIRCH также является первым алгоритмом, предложенным для эффективного управления "шумами" (данными, которые не вписываются в общее представление модели).


1.1.1 Достоинства алгоритма

По сравнению с предыдущими методами BIRCH обладает следующими достоинствами:

1. BIRCH является локальным алгоритмом, то есть каждое решение о каждом элементе кластера принимается без повторного сканирования данных или уже существующих кластеров. Используются только метрики, отражающие близость элементов друг к другу.

2. BIRCH использует факт неравномерного распределения данных в пространстве и поэтому не все данные рассматриваются как одинаково важные для построения кластера. Области с большой плотностью обрабатываются как единый кластер. Данные в более разреженных областях могут удаляться (опционально).

3. BIRCH использует всю доступную память для получения наилучших из возможных подкластеров, в то же время минимизируя затраты на операции ввода/вывода. Оптимизация процесса кластеризации достигается за счет использования взвешенно-сбалансированного дерева. При этом время исполнения линейно.

4. BIRCH не требует всего набора данных заранее (при этом просматривает его всего один раз).


1.2 Математическое описание алгоритма

1.2.1 (???) Введение

Пусть в кластере имеются [math]N[/math] точек размерности [math]d[/math]: [math]{\vec{{X_i}}}[/math], где [math]i= 1,2, ...,N[/math]. Тогда центроид [math]{\vec{{X_0}}}[/math], радиус [math]R[/math] и диаметр [math]D[/math] кластера определяются следующим образом:

[math]{\vec{X_0}}=\frac{\sum_{i=1}^N\vec{X_i}}{N}[/math]

[math]R = (\frac{\sum_{i=1}^N{(\vec{X_i} - \vec{X_0})}^2}{N})^{1/2}[/math]

[math]D = (\frac{\sum_{i=1}^N\sum_{j=1}^N{(\vec{X_i} - \vec{X_j})}^2}{N(N-1)})^{1/2}[/math]

[math]R[/math] - это среднее расстояние от каждой точки до центроида. [math]D[/math] - это среднее расстояние между парами в кластере. Это две альтернативные метрики плотности кластера вокруг центроида.

Для измерения близости друг к другу двух кластеров мы введём следующие 5 метрик.

Пусть даны центроиды двух кластеров [math]\vec{X_{01}}[/math] и [math]\vec{X_{02}}[/math]. Евклидова метрика [math]D_0[/math] и метрика Манхэттена [math]D1[/math] между двумя кластерами определяются следующим образом:

[math]D_0 = ((\vec{X_{01}}-\vec{X_{02}})^2)^{1/2}[/math]

[math]D_1 = |\vec{X_{01}}-\vec{X_{02}}| = \sum_{i=1}^d |{\vec{X_{01}}}^{(i)}-{\vec{X_{02}}}^{(i)}| [/math]

Пусть в одном кластере имеются [math]N_1[/math] точек размерности [math]d[/math]: [math]{\vec{{X_i}}}[/math], где [math]i= 1,2, ...,N_1[/math], а в другом кластере

Пусть имеются два кластера, содержащих соответственно [math]N_1[/math] и [math]N_2[/math] точек размерности [math]d[/math]: [math]{\vec{X_i}}[/math], где [math]i= 1,2, ...,N_1[/math] и [math]{\vec{X_j}}[/math], где [math]i= N_1+1,N1+2, ...,N_1+N_2[/math]. Среднее расстояние [math]D_2[/math], среднее внутрикластерное расстояние [math]D_3[/math] и дисперсия [math]D_4[/math] между двумя кластерами определяются следующим образом:

[math]D_2 = (\frac{\sum_{i=1}^{N_1}\sum_{j=N_1+1}^{N_1+N_2}{(\vec{X_i} - \vec{X_j})}^2}{N_1N_2})^{1/2}[/math]
[math]D_3 = (\frac{\sum_{i=1}^{N_1+N_2}\sum_{j=1}^{N_1+N_2}{(\vec{X_i} - \vec{X_j})}^2}{(N_1+N_2)(N_1+N_2-1)})^{1/2}[/math]


[math]D_4 = \sum_{k=1}^{N_1+N_2}(\vec{X_k} - \frac{\sum_{i=1}^{N_1+N_2}\vec{X_i}}{N_1+N_2})^2 - \sum_{i=1}^{N_1}(\vec{X_i} - \frac{\sum_{i=1}^{N_1}\vec{X_i}}{N_1})^2 - \sum_{j=N_1+1}^{N_1+N_2}(\vec{X_j} - \frac{\sum_{i=N_1+1}^{N_1+N_2}\vec{X_i}}{N_2})^2[/math]

[math]D_3[/math] - это по сути [math]D[/math] для объединённого кластера.

Таким образом, величины [math]\vec{X_0}[/math], [math]R[/math] и [math]D[/math] относятся к отдельным кластерам, а [math]D_0[/math], [math]D_1[/math], [math]D_2[/math], [math]D_3[/math] и [math]D_4[/math] - к объединению двух кластеров.

1.2.2 Кластерные элементы и кластерное дерево

В основе концепции алгоритмы BIRCH лежат понятия кластерного элемента кластерного дерева (CF Tree).

1.2.2.1 Кластерный элемент

Определение. Пусть в кластере содержатся [math]N[/math] точек размерности [math]d[/math]:[math]\vec{X_i}[/math], где [math]i=1,2,...,N[/math]. Кластерный элемент (CF) - следующая тройка чисел, характеризующая информацию о кластере: [math]'''CF''' = (N, \vec{LS}, SS)[/math], где [math]N[/math] - количество элементов входнях данных, входящих в кластер, [math]\vec{LS}[/math] - линейная сумма входных данных (т.е. [math]\sum_{i=1}^{N}\vec{X_i}[/math]), [math]SS[/math] - сумма квадратов элементов входных данных (т.е. [math]\sum_{i=1}^{N}{\vec{X_i}}^2[/math])

Теорема Пусть [math]CF_1 = (N_1, \vec{LS_1}, SS_1)[/math] и [math]CF_2 = (N_1, \vec{LS_2}, SS_2)[/math] - CF векторы двух непересекающихся кластеров. Тогда при их объединении образуется кластер со следующим CF вектором:

[math]CF = CF_1 + CF_2 = (N_1+N_2, \vec{LS_1}+\vec{LS_2}, SS_1+SS_2)[/math].

Из указанных выше определения и теоремы вытекает тот факт, что при объединении кластеров CF вектор может вычисляться инкрементно и точно. Легко показать, что величины [math]\vec{X_0}[/math], [math]R[/math], [math]D[/math], [math]D_0[/math], [math]D_1[/math], [math]D_2[/math], [math]D_3[/math], [math]D_4[/math], как и обычные метрики, также могут вычисляться без труда.

Таким образом, в данном случае информацией о кластере является не весь набор точек, а вектор CF. Хранение одного только вектора может показаться неэффективным, но этого вполне достаточно для оперирования всеми необходимыми метриками, на основе которых принимаются решения в алгоритме BIRCH.


1.2.2.2 Кластерное дерево

Определение. Кластерное дерево (CF Tree) - это взвешенно сбалансированное дерево с двумя параметрами: [math]B[/math] - коэффициент разветвления, [math]T[/math] - пороговая величина. Каждый нелистьевой узел дерева имеет не более чем [math]B[/math] вхождений узлов следующей формы: [math][CF_i,child_i][/math], где [math]i=1,2,...,B[/math], "child" - указатель на i-й дочерний узел, [math]CF_i[/math] - CF вектор соответствующего подкластера.

Каждый листьевой узел имеет ссылку на два соседних узла ("prev" и "next") для того чтобы связать все узлы для эффективного сканирования.

Все листьевые узлы должны удовлетворять пороговому ограничению [math]T[/math], т.е. диаметр (радиус) не должен превосходить [math]T[/math].

Размер дерева является функцией [math]T[/math]: чем больше [math]T[/math], тем меньше дерево. (???) Что-то там про Р.

После задания размерности данных [math]d[/math], а также размерности нелистьевых и листьевых узлов, величины [math]B[/math] и [math]L[/math] определяются при помощи [math]P[/math]. Поэтому мы можем изменять [math]P[/math] для (???)

В процессе вставки новых данных подобное [math]CF[/math] дерево строится динамически. Оно использует вставку данных для кластеризации точно также как [math]B+[/math] дерево использует её для поиска. CF очень компактно, поскольку каждый листьевой узел - это не просто точка, а подкластер (который объединяет множество точек с учётом ограничения [math]T[/math]).

1.2.2.3 Операция вставки в CF дерево

Опишем алгоритм вставки записи [math]Ent[/math] в CF дерево:

1) Определение подходящего листа: Начиная с корня, алгоритм рекурсивно спускается по CF дереву, выбирая ближайший дочерний узел в соответствии с выбранной метрикой [math]D0[/math], [math]D1[/math], [math]D2[/math], [math]D3[/math] или [math]D4[/math]

2) Преобразование листа: Когда алгоритм достигает листьевого узла, он находит ближайшую листьевую запись, скажем, [math]L_1[/math], а затем проверяет, может ли [math]L_1[/math], "присоединить" [math]Ent[/math], без нарушения порогового условия. Если это так, то CF вектор для [math]L_i[/math], изменяется с отражением этого факта. Если нет, то к листу добавляется новая запись для "Ent". Если на листе есть место для этой новой записи, то шаг окончен, иначе листьевой узел должен "разделиться". Разделение узла производится при помощи выбора наиболее удалённой друг от друга пары записей как источника и перераспределение оставшихся записей в соответствии с "критерием близости".

3) Преобразование пути к листу: После вставки "Ent" в лист, мы должны обновить CF информацию для каждой нелистьевой записи по дороге к листу. При отсутствии разделения это означает простое добавление CF вектора для отражения факта добавления "Ent". Разделение же листа требует вставки новой нелистьевой записи в родительский узел для описание только что созданного листа. Если у родителя есть место для этой записи, то на всех более высоких уровнях нам нужно просто преобразовать CF векторы для отражения факта добавления Ent. В общем случае, однако, нам также придётся разделить родителя, и так далее до корня. Если разделён корень, то высота дерева увеличивается на единицу.

4) Улучшение слияния: Разделение вызвано размером страницы, который не зависит от кластеризационных свойств данных. Если во входящем потоке присутствуют искажённые данные, это может повлиять на качество кластеризации, а также уменьшить эффективность использования пространства. Дополнительный шаг объединения зачастую помогает решить эти проблемы: предположим, что произошло разделение листа, и распространение этого процесса остановилось на некотором нелистьевом узле [math]N_j[/math], то есть [math]N_j[/math] can accomodate the additional entry resulting from the split. Теперь мы сканируем узел [math]N_j[/math] для нахождения двух наиболее близких записей. Если это не пара, отвечающая разделению, мы пытаемся объединить их и поставить в соответствие два дочерних узла. Если в двух дочерних узлах записей больше, чем может содержать одна страница, мы снова разделяем результат объединения. В процессе перерасщепления, в том случае, если одна seed притягивает записей достаточно для того, чтобы заполнить таблицу, мы можем просто положить оставшиеся записи в другой ssed. В итоге, если мы объединяем подходящие записи на одной странице, м освобождаем в узле место для дальнейшего использования, создаём в узле [math]N_j[/math] место для дополнительной записи, тем самым увеличивая степень использования свободного пространства и откладывая дальнейшее расщепление; в ином случае мы улучшаем распределение записей в двух ближайших детях.

Так как каждый узел в соответствии со своим размером может содержать ограниченное число записей, он всегда соответствует обычному кластеру. Иногда два подкластера, которые должны были быть в одном кластере, разделяются между узлами. В зависимости от порядка входных данных и степени их разброса, также возможна ситуация, когда два подкластера, которые не должны находиться в одном кластере, хранятся в одном узле. Эти нечастые, но нежелательные аномалии, спровоцированные размером страницы, можно исправить при помощи глобального (или полуглобального)агоритма, который собирает лист между узлами. Другой нежелательный случай, это ситуация, когда две одинаковые точки вставляются дважды, но в разное время, две их копии могут входить в отдельные листьевые записи. Или, другими словами, иногда в ситуации разброса входных данных, точка может входить в ту листьевую запись, в которую она не должна входить. Эту проблему можно решить при помощи дальнейшего улучшения данных.


1.3 Сам алгоритм

Рисунок 1 представляет обзор алгоритма BIRCH. Главной задачей фазы 1 является сканирование всех данных и построение в памяти исходного CF дерева, используя заданное количество памяти. Это дерево старается отразить информацию о кластеризации данных настолько хорошо, насколько это позволяют ограничения по памяти. Тогда как плотно распределённые данные хорошо группируются в подкластеры, более разрозненные данные удаляются. После Фазы 1 вспомогательные вычисления в дальнейших фазах будут:

1) быстрее, потому что (а) больше не нужны операции ввода-вывода, (b) проблема кластеризации начальных данных упрощается до проблемы кластеризации подкластеров в листьевых записях;

2) точнее, потому что (а) большинство данных с низкой плотностью удалены, (b) оставшиеся данные распределены оптимально в соответствии с доступным количеством памяти

3) менее чувствительны к порядку, потому что листьевые записи исходного дерева


1.3.1 Фаза 1

Рисунок 2 детализирует Фазу 1. Она начинается с определения порогового значения, сканирования данных и добавления данных в дерево. Если память заканчивается до окончания сканирования данных, увеличивается пороговое значение и строится новое, меньшее CF дерево при помощи повторной вставки листьевых записей в старое дерево. После того как старые листьевые записи добавлены повторно, сканирование данных (и вставка в новое дерево) продолжается с той точки, где процесс был приостановлен.

1.3.2 Уменьшаемость

Пусть [math]t_i[/math] - это CF дерево с пороговым значением [math]T_i[/math]. Его высота равна [math]h[/math], а размер (количество узлов) равен [math]S_i[/math]. Задавая [math]T_{i+1}\geq T_i[/math], мы хотим использовать все листьевые записи [math]t_i[/math] для построения нового CF дерева [math]t_{i+1}[/math] с пороговым значением [math]T_{i+1}[/math] так, чтобы размер [math]t_{i+1}[/math] был не больше чем [math]S_i[/math]. Далее описан алгоритм повторного построения, а также последовательность теорем уменьшаемости.

Предположим, что внутри каждого CF дерева [math]t_i[/math] все соседние записи пронумерованы от [math]0[/math] до [math]n_k-1[/math], где [math]n_k[/math] - это число записей в данном узле. Тогда путь из корневой записи (уровень 1) до листьевого узла (уровень h) уникально представляется вектором [math](i_1, i_2, ..., i_{h-1})[/math], где [math]i_j, j=1,...,h-1[/math] - это номера записей j-го уровня. Поэтому естественно принять, что путь [math]({i_1}^(1), {i_2}^(1), ..., {i_{h-1}}^(1))[/math] меньше пути [math]({i_1}^(2), {i_2}^(2), ..., {i_{h-1}}^(2))[/math], если [math]{i_1}^{(1)}={i_1}^{(2)}, ..., {i_{j-1}}^{(1)}={i_{j-1}}^{(2)}[/math] и [math]{i_j}^{(1)}\lt {i_j}^{(2)}[/math] [math](0 \leq j \leq h-1) [/math]. Очевидно, что между понятиями листа и пути существует точное соответствие, поэтому в дальнейшем мы будет использовать эти понятия взаимозаменяемо.


[math][/math]

1.4 Вычислительное ядро алгоритма

1.5 Макроструктура алгоритма

2 ЧАСТЬ. Программная реализация алгоритма

3 Литература

[1] Википедия

3.1 Особенности реализации последовательного алгоритма