Уровень алгоритма

Классическая монотонная прогонка, повторный вариант: различия между версиями

Материал из Алговики
Перейти к навигации Перейти к поиску
[досмотренная версия][досмотренная версия]
 
(не показано 5 промежуточных версий 3 участников)
Строка 1: Строка 1:
 +
{{level-a}}
 +
 
{{algorithm
 
{{algorithm
 
| name              = Повторная прогонка для трёхдиагональной матрицы,<br /> точечный вариант
 
| name              = Повторная прогонка для трёхдиагональной матрицы,<br /> точечный вариант
Строка 8: Строка 10:
 
}}
 
}}
  
Основные авторы описания: [[Участник:Frolov|А.В.Фролов]]
+
Основные авторы описания: [[Участник:Frolov|А.В.Фролов]].
  
 
== Свойства и структура алгоритма ==
 
== Свойства и структура алгоритма ==
Строка 130: Строка 132:
 
       end
 
       end
 
</source>
 
</source>
 
=== Локальность данных и вычислений ===
 
 
Как видно по графу алгоритма, локальность данных по пространству хорошая - все аргументы, которые необходимы для операций, вычисляются "рядом". Однако по времени локальность вычислений не столь хороша. Если данные задачи не помещаются в кэш, то вычисления в "верхнем левом углу" СЛАУ будут выполняться с постоянными промахами кэша. Отсюда может следовать одна из рекомендаций прикладникам, использующим прогонку, - нужно организовать все вычисления так, чтобы прогонки были "достаточно коротки" для помещения данных в кэш.
 
 
При этом, однако, повторная прогонка относится к таким последовательным алгоритмам, в которых локальность вычислений настолько велика, что является даже излишней<ref>Фролов А.В., Антонов А.С., Воеводин Вл.В., Теплов А.М. Сопоставление разных методов решения одной задачи по методике проекта Algowiki // Параллельные вычислительные технологии (ПаВТ'2016): труды международной научной конференции (г. Архангельск, 28 марта - 1 апреля 2016 г.). Челябинск: Издательский центр ЮУрГУ, 2016. С. 347-360.</ref>. Из-за того, что данные, необходимые для выполнения основных операций прогонки, вычисляются в непосредственно предшествующим им операциях, возможность использования суперскалярности вычислительных ядер процессоров практически сводится на нет, что ухудшает эффективность выполнения прогонки даже на современных однопроцессорных и одноядерных системах. Последнее показано сравнением времени исполнения монотонной повторной прогонки и встречной монотонной прогонки<ref>Фролов Н.А., Фролов А.В. Экспериментальные исследования влияния степени локальности алгоритмов на их быстродействие на примере решения трёхдиагональных СЛАУ // Труды 59й научной конференции МФТИ (21–26 ноября 2016 г., гг. Москва-Долгопрудный).</ref>, которая благодаря наличию двух ветвей вычислений даёт выигрыш по времени около 20% в сравнении с первой даже на персональных компьютерах (см. Рисунок 2).
 
 
[[File:Repvstrprog.png|thumb|center|800px|Рисунок 2. Отношение времени исполнения повторной встречной и монотонных прогонок. По оси асбсцисс отложено <math>m</math> (порядок СЛАУ равен <math>2^m - 1</math>), по оси ординат - отношение времени, затраченного на исполнение встречной повторной прогонки, к времени, затраченному на выполнение монотонной повторной прогонки. Цветами выделены графики для разных систем (Pentium D + Windows XP, Core i5 + Windows 8, Core i7 + Windows 7), на всех их использована одна и та же сборка кода компилятором GNU Fortran.]]
 
  
 
=== Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма ===
 
=== Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма ===
Строка 143: Строка 137:
 
Как видно из анализа графа алгоритма, его (без существенных модификаций) практически невозможно распараллелить. Поэтому есть два способа использования прогонок для параллельных вычислительных систем: либо разбивать задачу, где используются прогонки, так, чтобы их было достаточно много, например, так, чтобы на каждую из прогонок приходился 1 процессор (1 ядро), либо использовать вместо прогонки её параллельные варианты (циклическую редукцию, последовательно-параллельные варианты и т.п.).
 
Как видно из анализа графа алгоритма, его (без существенных модификаций) практически невозможно распараллелить. Поэтому есть два способа использования прогонок для параллельных вычислительных систем: либо разбивать задачу, где используются прогонки, так, чтобы их было достаточно много, например, так, чтобы на каждую из прогонок приходился 1 процессор (1 ядро), либо использовать вместо прогонки её параллельные варианты (циклическую редукцию, последовательно-параллельные варианты и т.п.).
  
=== Масштабируемость алгоритма и его реализации ===
+
Алгоритм прогонки является настолько простым, что, несмотря на его "дежурное" присутствие в стандартных пакетах программ решения задач линейной алгебры, большинство использующих его исследователей-прикладников часто пишут соответствующий фрагмент программы самостоятельно. Однако надо отметить, что, как правило, метод прогонки в пакетах реализуют не в его "чистом виде", а в виде пары "разложение на две двухдиагональные матрицы" и "решение СЛАУ с предварительно факторизованной трёхдиагональной матрицей". Так обстоит дело, например, в пакете SCALAPACK и его предшественниках.
 
 
О масштабируемости самой прогонки, как полностью непараллельного алгоритма, говорить не имеет смысла. Однако необходимо отметить, что анализ масштабируемости параллельных вариантов прогонки должен проводиться относительно однопроцессорной реализации описанного классического варианта прогонки, а не относительно однопроцессорных расчетов для её параллельных вариантов.
 
 
 
=== Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма ===
 
 
 
В силу существенно последовательной природы алгоритма и его избыточной локальности, исследование его динамических характеристик представляется малоценным.
 
  
 +
=== Результаты прогонов ===
 
=== Выводы для классов архитектур ===
 
=== Выводы для классов архитектур ===
  
 
Повторная монотонная прогонка - метод для архитектуры классического, фон-неймановского типа, устаревший даже для эффективной загрузки одноядерных систем, поддерживающих суперскалярность, где проигрывает повторной встречной прогонке. Для распараллеливания решения СЛАУ с трёхдиагональной матрицей следует использовать какой-либо её параллельный заменитель, например, наиболее распространённую [[Повторный метод циклической редукции|циклическую редукцию]] или уступающий ей по критическому пути графа, но имеющий более регулярную структуру графа новый [[Последовательно-параллельный вариант решения трёхдиагональной СЛАУ с LU-разложением и обратными подстановками|последовательно-параллельный вариант]].
 
Повторная монотонная прогонка - метод для архитектуры классического, фон-неймановского типа, устаревший даже для эффективной загрузки одноядерных систем, поддерживающих суперскалярность, где проигрывает повторной встречной прогонке. Для распараллеливания решения СЛАУ с трёхдиагональной матрицей следует использовать какой-либо её параллельный заменитель, например, наиболее распространённую [[Повторный метод циклической редукции|циклическую редукцию]] или уступающий ей по критическому пути графа, но имеющий более регулярную структуру графа новый [[Последовательно-параллельный вариант решения трёхдиагональной СЛАУ с LU-разложением и обратными подстановками|последовательно-параллельный вариант]].
 
=== Существующие реализации алгоритма ===
 
 
Алгоритм прогонки является настолько простым, что, несмотря на его "дежурное" присутствие в стандартных пакетах программ решения задач линейной алгебры, большинство использующих его исследователей-прикладников часто пишут соответствующий фрагмент программы самостоятельно. Однако надо отметить, что, как правило, метод прогонки в пакетах реализуют не в его "чистом виде", а в виде пары "разложение на две двухдиагональные матрицы" и "решение СЛАУ с предварительно факторизованной трёхдиагональной матрицей". Так обстоит дело, например, в пакете SCALAPACK и его предшественниках.
 
  
 
== Литература ==
 
== Литература ==
Строка 163: Строка 148:
 
<references />
 
<references />
  
[[En:Two-sided elimination method, pointwise version]]
+
[[En:Repeated Thomas algorithm, pointwise version]]
 
[[Категория:Алгоритмы с низким уровнем параллелизма]]
 
[[Категория:Алгоритмы с низким уровнем параллелизма]]
 
[[Категория:Законченные статьи]]
 
[[Категория:Законченные статьи]]

Текущая версия на 11:05, 14 июля 2022




Повторная прогонка для трёхдиагональной матрицы,
точечный вариант
Последовательный алгоритм
Последовательная сложность [math]5n-4[/math]
Объём входных данных [math]4n-2[/math]
Объём выходных данных [math]n[/math]
Параллельный алгоритм
Высота ярусно-параллельной формы [math]5n-4[/math]
Ширина ярусно-параллельной формы [math]1[/math]


Основные авторы описания: А.В.Фролов.

1 Свойства и структура алгоритма

Рисунок 1. Граф алгоритма повторной прогонки при n=7 без отображения входных и выходных данных. / - деление, f - операция a+bc.

1.1 Общее описание алгоритма

Повторная прогонка - один из вариантов метода исключения неизвестных, применяемого к решению СЛАУ[1][2] вида [math]Ax = b[/math], где как минимум один раз уже была решена прогонкой другая СЛАУ с той же матрицей

[math] A = \begin{bmatrix} a_{11} & a_{12} & 0 & \cdots & \cdots & 0 \\ a_{21} & a_{22} & a_{23}& \cdots & \cdots & 0 \\ 0 & a_{32} & a_{33} & \cdots & \cdots & 0 \\ \vdots & \vdots & \ddots & \ddots & \ddots & 0 \\ 0 & \cdots & \cdots & a_{n-1 n-2} & a_{n-1 n-1} & a_{n-1 n} \\ 0 & \cdots & \cdots & 0 & a_{n n-1} & a_{n n} \\ \end{bmatrix}, x = \begin{bmatrix} x_{1} \\ x_{2} \\ \vdots \\ x_{n} \\ \end{bmatrix}, b = \begin{bmatrix} b_{1} \\ b_{2} \\ \vdots \\ b_{n} \\ \end{bmatrix} [/math]

Часто, однако, при изложении сути методов решения трёхдиагональных СЛАУ[3] элементы правой части и матрицы системы обозначают и нумеруют по-другому, например СЛАУ может иметь вид ([math]N=n-1[/math])

[math] A = \begin{bmatrix} c_{0} & -b_{0} & 0 & \cdots & \cdots & 0 \\ -a_{1} & c_{1} & -b_{1} & \cdots & \cdots & 0 \\ 0 & -a_{2} & c_{2} & \cdots & \cdots & 0 \\ \vdots & \vdots & \ddots & \ddots & \ddots & 0 \\ 0 & \cdots & \cdots & -a_{N-1} & c_{N-1} & -b_{N-1} \\ 0 & \cdots & \cdots & 0 & -a_{N} & c_{N} \\ \end{bmatrix}\begin{bmatrix} y_{0} \\ y_{1} \\ \vdots \\ y_{N} \\ \end{bmatrix} = \begin{bmatrix} f_{0} \\ f_{1} \\ \vdots \\ f_{N} \\ \end{bmatrix} [/math]

или, если записывать отдельно по уравнениям, то

[math]c_{0} y_{0} - b_{0} y_{1} = f_{0}[/math],

[math]-a_{i} y_{i-1} + c_{i} y_{i} - b_{i} y_{i+1} = f_{i}, 1 \le i \le N-1[/math],

[math]-a_{N} y_{N-1} + c_{N} y_{N} = f_{N}[/math].

Здесь рассматривается тот вариант прогонки, когда обрабатывается вся СЛАУ сверху вниз и обратно - так называемая правая прогонка. Суть метода состоит в исключении из уравнений неизвестных, сначала - сверху вниз - под диагональю, а затем - снизу вверх - над диагональю. Вариант, когда СЛАУ "проходится" наоборот, снизу вверх и обратно вниз - левая прогонка - принципиально ничем не отличается от рассматриваемого, поэтому нет смысла включать его отдельное описание.

Рисунок 2. Граф алгоритма повторной прогонки с заранее выполненным предвычислением обратных чисел при n=7 без отображения входных и выходных данных. m - умножение на предвычисленное обратное число, f - операция a+bc.

1.2 Математическое описание алгоритма

В приведённых выше обозначениях в повторной прогонке сначала выполняют её прямой ход - вычисляют коэффициенты

[math]\beta_{1} = f_{0}/c_{0}[/math],

[math]\beta_{i+1} = (f_{i}+a_{i}\beta_{i})/(c_{i}-a_{i}\alpha_{i})[/math], [math]\quad i = 1, 2, \cdots , N[/math].

(при этом отношения [math]1/c_{0}[/math] и [math]1/(c_{i}-a_{i}\alpha_{i})[/math] уже предвычислены при решении первой системы первой прогонкой) после чего вычисляют решение с помощью обратного хода

[math]y_{N} = \beta_{N+1}[/math],

[math]y_{i} = \alpha_{i+1} y_{i+1} + \beta_{i+1}[/math], [math]\quad i = N-1, N-2, \cdots , 1, 0[/math].

В литературе[3] указывается, что данные формулы эквивалентны использованию предвычисленного при полной прогонке одного из вариантов [math]LU[/math]-разложения матрицы системы для последующего решения двухдиагональных систем посредством прямой и обратной подстановок.

1.3 Вычислительное ядро алгоритма

Вычислительное ядро алгоритма можно считать состоящим из двух частей - прямого и обратного хода прогонки. Как в прямом ходе, так и в обратном, вычислительное ядро составляют последовательности операций умножения (в прямом ходе их две за шаг; в принципе, можно воспользоваться ассоциативностью и вычислять сразу оба произведения, но "промежуточный" результат нужен для обратного хода) и сложения/вычитания.

1.4 Макроструктура алгоритма

В дополнение к возможности представления макроструктуры алгоритма как совокупности прямого и обратного хода, прямой ход также может быть разложен на две макроединицы - треугольного разложения матрицы и прямого хода решения двухдиагональной СЛАУ, которые выполняются "одновременно", т.е. параллельно друг другу. При этом решение двухдиагональной СЛАУ использует результаты треугольного разложения.

1.5 Схема реализации последовательного алгоритма

Последовательность исполнения метода следующая:

1. Инициализируется прямой ход прогонки:

[math]\beta_{1} = f_{0}(1/c_{0}) [/math]

2. Последовательно для всех [math]i[/math] от [math]1[/math] до [math]N-1[/math] выполняются формулы прямого хода:

[math]\beta_{i+1} = (f_{i}+a_{i}\beta_{i})(1/(c_{i}-a_{i}\alpha_{i}))[/math].

3. Инициализируется обратный ход прогонки:

[math]y_{N} = (f_{N}+a_{N}\beta_{N})(1/(c_{N}-a_{N}\alpha_{N}))[/math]

4. Последовательно для всех [math]i[/math] с убыванием от [math]N-1[/math] до [math]0[/math] выполняются формулы обратного хода: [math]y_{i} = \alpha_{i+1} y_{i+1} + \beta_{i+1}[/math].

1.6 Последовательная сложность алгоритма

Для выполнения повторной прогонки в трёхдиагональной СЛАУ из [math]n[/math] уравнений с [math]n[/math] неизвестными в последовательном варианте требуется:

  • [math]2n-2[/math] сложений/вычитаний,
  • [math]3n-2[/math] умножений.

Таким образом, при классификации по последовательной сложности, повторная прогонка относится к алгоритмам с линейной сложностью.

1.7 Информационный граф

Информационный граф повторной прогонки в случае первой прогонки без предвычислений обратных чисел на рис.1. Информационный граф повторной прогонки в случае первой прогонки с предвычислениями обратных чисел - на рис.2. Как следует из анализа графа, он является полностью последовательным. Из рисунка видно, что не только математическая суть обработки элементов векторов, но даже структура графа алгоритма и направление потоков данных в нём вполне соответствуют названиям "прямой и обратный ход".

1.8 Описание ресурса параллелизма алгоритма

Для выполнения повторной прогонки в трёхдиагональной СЛАУ из [math]n[/math] уравнений с [math]n[/math] неизвестными в параллельном варианте требуется последовательно выполнить следующие ярусы:

  • [math]3n - 2[/math] ярусов умножений и [math]2n - 2[/math] сложений/вычитаний (в ярусах - по [math]1[/math] операции).

Таким образом, при классификации по высоте ЯПФ, прогонка относится к алгоритмам со сложностью [math]O(n)[/math]. При классификации по ширине ЯПФ её сложность будет равна [math]1[/math] (чисто последовательный алгоритм).

1.9 Входные и выходные данные алгоритма

Входные данные: Предварительно обработанная полной прогонкой трёхдиагональная матрица [math]A[/math] (элементы [math]a_{ij}[/math]), вектор [math]b[/math] (элементы [math]b_{i}[/math]).

Объём входных данных: [math]4n-2[/math].

Выходные данные: вектор [math]x[/math] (элементы [math]x_{i}[/math]).

Объём выходных данных: [math]n[/math].

1.10 Свойства алгоритма

Соотношение последовательной и параллельной сложности, как хорошо видно, равно [math]1[/math].

При этом вычислительная мощность алгоритма как отношение числа операций к суммарному объему входных и выходных данных также является константой.

Алгоритм в рамках выбранной версии полностью детерминирован.

Обычно прогонка используется для решения СЛАУ с диагональным преобладанием. В этом случае гарантируется устойчивость алгоритма.

2 Программная реализация алгоритма

2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма

В зависимости от способа хранения матрицы СЛАУ (в виде одного массива с [math]3[/math] строками или в виде [math]3[/math] разных массивов) и способа хранения вычисляемых коэффициентов (на месте уже использованных элементов матрицы либо отдельно) возможны различные реализации алгоритма.

Приведем пример подпрограммы на языке Fortran, реализующей прогонку, где все элементы матрицы хранятся в одном массиве, причём соседние элементы матричной строки размещаются рядом, а вычисляемые в процессе первой прогонки коэффициенты --- на месте элементов исходной матрицы.

      subroutine progmr (a,x,N)
      real a(3,0:N), x(0:N)
      x(0)=x(0)*a(2,0) ! beta 1
      do 10 i=1,N-1
        x(i)=(x(i)-a(1,i)*x(i-1))*a(2,i) ! beta i+1
  10  continue

      x(N)=(x(N)-a(1,N)*x(N-1))*a(2,N) ! y N
      do 20 i=N-1,0,-1
        x(i)=a(3,i)*x(i+1)+x(i) ! y i
  20  continue
      return
      end

2.2 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма

Как видно из анализа графа алгоритма, его (без существенных модификаций) практически невозможно распараллелить. Поэтому есть два способа использования прогонок для параллельных вычислительных систем: либо разбивать задачу, где используются прогонки, так, чтобы их было достаточно много, например, так, чтобы на каждую из прогонок приходился 1 процессор (1 ядро), либо использовать вместо прогонки её параллельные варианты (циклическую редукцию, последовательно-параллельные варианты и т.п.).

Алгоритм прогонки является настолько простым, что, несмотря на его "дежурное" присутствие в стандартных пакетах программ решения задач линейной алгебры, большинство использующих его исследователей-прикладников часто пишут соответствующий фрагмент программы самостоятельно. Однако надо отметить, что, как правило, метод прогонки в пакетах реализуют не в его "чистом виде", а в виде пары "разложение на две двухдиагональные матрицы" и "решение СЛАУ с предварительно факторизованной трёхдиагональной матрицей". Так обстоит дело, например, в пакете SCALAPACK и его предшественниках.

2.3 Результаты прогонов

2.4 Выводы для классов архитектур

Повторная монотонная прогонка - метод для архитектуры классического, фон-неймановского типа, устаревший даже для эффективной загрузки одноядерных систем, поддерживающих суперскалярность, где проигрывает повторной встречной прогонке. Для распараллеливания решения СЛАУ с трёхдиагональной матрицей следует использовать какой-либо её параллельный заменитель, например, наиболее распространённую циклическую редукцию или уступающий ей по критическому пути графа, но имеющий более регулярную структуру графа новый последовательно-параллельный вариант.

3 Литература

  1. Воеводин В.В. Вычислительные основы линейной алгебры. М.: Наука, 1977.
  2. Воеводин В.В., Кузнецов Ю.А. Матрицы и вычисления. М.: Наука, 1984.
  3. 3,0 3,1 Самарский А.А., Николаев Е.С. Методы решения сеточных уравнений. М.: Наука, 1978.