Участник:Mansur/Алгоритм K-means++: различия между версиями
Mansur (обсуждение | вклад) |
Mansur (обсуждение | вклад) |
||
(не показаны 4 промежуточные версии этого же участника) | |||
Строка 2: | Строка 2: | ||
=== Общее описание алгоритма === | === Общее описание алгоритма === | ||
− | '''k-means++'''<ref>Arthur, D.; Vassilvitskii, S. (2007). "k-means++: the advantages of careful seeding" (PDF). Proceedings of the eighteenth annual ACM-SIAM symposium on Discrete algorithms. Society for Industrial and Applied Mathematics Philadelphia, PA, USA. pp. 1027–1035.</ref> — улучшенная версия алгоритма кластеризации k-means. Суть улучшения заключается в нахождении более «хороших» начальных значений центроидов кластеров. Задача k-means состоит в том, чтобы найти центры кластеров, которые минимизируют внутриклассовую дисперсию, т.е. сумму квадратов расстояний от каждой кластеризуемой точки данных до ее | + | '''''k-means++'''''<ref>Arthur, D.; Vassilvitskii, S. (2007). "k-means++: the advantages of careful seeding" (PDF). Proceedings of the eighteenth annual ACM-SIAM symposium on Discrete algorithms. Society for Industrial and Applied Mathematics Philadelphia, PA, USA. pp. 1027–1035.</ref> — улучшенная версия алгоритма кластеризации k-means. Суть улучшения заключается в нахождении более «хороших» начальных значений центроидов кластеров. Задача k-means состоит в том, чтобы найти центры кластеров, которые минимизируют внутриклассовую дисперсию, т.е. сумму квадратов расстояний от каждой кластеризуемой точки данных до ее центроида кластера (центра, который находится ближе всего к ней), то есть разбить <math>n</math> наблюдений на <math>k</math> кластеров таким образом, чтобы каждое наблюдение принадлежало ровно одному кластеру, расположенному на наименьшем расстоянии от наблюдения. Хотя найти точное решение задачи о k-средних для произвольных входных данных NP-сложно, <ref>Drineas, P.; Frieze, A.; Kannan, R.; Vempala, S.; Vinay, V. (2004). "Clustering Large Graphs via the Singular Value Decomposition". Machine Learning. 56 (1–3): 9–33. doi:10.1023/B:MACH.0000033113.59016.96</ref> стандартный подход к нахождению приближенного решения широко используется и часто быстро находит разумные решения. |
− | Однако алгоритм k- | + | Однако алгоритм k-means имеет, по крайней мере, два основных теоретических недостатка: |
− | + | # Было показано, что наихудшее время выполнения алгоритма является супер-полиномиальным по размеру входных данных.<ref>Arthur, D.; Vassilvitskii, S. (2006). "How slow is the k-means method?". Proceedings of the twenty-second annual symposium on Computational geometry. ACM New York, NY, USA. pp. 144–153. | |
</ref> | </ref> | ||
− | + | # Найденное приближение может быть сколь угодно плохим по отношению к целевой функции по сравнению с оптимальной кластеризацией. | |
− | === Математическое описание алгоритма === | + | === Математическое описание алгоритма === |
− | # Случайным образом | + | '''Дано''': |
− | # Для каждой точки данных | + | * набор из <math display=block>n</math> наблюдений <math display=block>X={x_1,x_2,...,x_n},x_i \in R^d, i=1,...,n;</math> |
− | # Выбрать следующий центроид из точек данных таким образом, чтобы вероятность выбора точки в качестве центроида была прямо пропорциональна ее расстоянию от ближайшего, ранее выбранного центроида | + | * <math display=block>k</math> - требуемое число кластеров, <math display=block>k \in N, k \leq n.</math> |
− | # Повторять шаги 2 и 3 до тех пор, пока не будут отобраны k центроидов. | + | * |
+ | Требуется: | ||
+ | |||
+ | Разделить множество наблюдений <math display=block>X</math> на <math display=block>k</math> кластеров <math display=block>S_1,S_2,...,S_k:</math> | ||
+ | |||
+ | * <math display=block>S_i ∩ S_j = ∅, i ≠ j</math> | ||
+ | * <math display=block>\bigcup_{i=1}^{k}S_i = X</math> | ||
+ | * | ||
+ | Действие алгоритма: | ||
+ | |||
+ | Алгоритм k-means++ разбивает набор <math display=block>X</math> на <math display=block>k</math> наборов <math display=block>S_1,S_2,...,S_k</math>, таким образом, чтобы минимизировать сумму квадратов расстояний от каждой точки кластера до его центроида(центр масс кластера). Введем обозначение, <math display=block>S={S_1,S_2,...,S_k}</math>. Тогда действие алгоритма k-means++ равносильно поиску: | ||
+ | |||
+ | <math display=block>\arg\min_{S} \sum\limits_{i=1}^k \sum\limits_{\mathbf{x} \in S_i} \rho(\mathbf{x}, \mathbf{\mu}_i )^2</math>, | ||
+ | где <math display="block">{\mu_i} = \frac{1}{|S_i|}\sum_{\mathbf x \in S_i} \mathbf x, </math> – центры кластеров, <math display=block>i=1,...,k,\rho(x,μ_i)</math> – расстояние между <math>x</math> и <math>μ_i</math> | ||
+ | |||
+ | '''Алгоритм:''' | ||
+ | |||
+ | '''''Инициализация:''''' <math></math> | ||
+ | # Случайным образом выбрать первый центроид <math>\mu_1</math> из точек данных. | ||
+ | # Для каждой точки данных x вычислить ее расстояние <math>D(x)</math> от ближайшего, ранее выбранного центроида. | ||
+ | # Выбрать следующий центроид из точек данных таким образом, чтобы вероятность выбора точки в качестве центроида была прямо пропорциональна квадрату ее расстоянию <math>D^2(x)</math> от ближайшего, ранее выбранного центроида: <math>\frac{D^2(x)}{\sum_{x}D^2(x)}</math>(т.е. точка, имеющая максимальное расстояние от ближайшего центроида, с наибольшей вероятностью будет выбрана следующей в качестве центроида) | ||
+ | # Повторять шаги 2 и 3 до тех пор, пока не будут отобраны k центроидов: <math>\mu_i^{(0)} = \mu_i, \quad i=1,...,k</math>. | ||
+ | Теперь, когда начальные центроиды выбраны, нужно использовать стандартную кластеризацию k-means: | ||
+ | |||
+ | 1. <b>Распределение векторов по кластерам:</b> | ||
+ | <p><b>Шаг</b> <math>t: \forall \mathbf{x}_i \in X, \ i=1,...,n: j=\arg\min_{k}\rho(\mathbf{x}_i,\mathbf{\mu}_k^{(t-1)})^2 \Longrightarrow \mathbf{x}_i \in S_j</math></p> | ||
+ | 2. <b>Пересчет центров кластеров:</b> | ||
+ | <p><b>Шаг </b> <math>t: \forall i=1,...,k: \mu_i^{(t)} = \cfrac{1}{|S_i|}\sum_{x\in S_i}x</math></p> | ||
+ | 3. <b>Проверка условия останова:</b> | ||
+ | <p></p> | ||
+ | * '''если''' <math>\exists i\in \overline{1,k}: \mu_i^{(t)} \ne \mu_i^{(t-1)}</math> '''тогда''' | ||
+ | ** <math>t = t + 1</math>; | ||
+ | ** переход к шагу пересчета; | ||
+ | * '''иначе:''' | ||
+ | ** '''останова''' | ||
+ | </li> | ||
=== Вычислительное ядро алгоритма === | === Вычислительное ядро алгоритма === | ||
Строка 54: | Строка 89: | ||
== Литература == | == Литература == | ||
<references /> | <references /> | ||
− | |||
− |
Текущая версия на 23:53, 30 октября 2023
Содержание
- 1 Свойства и структура алгоритмов
- 1.1 Общее описание алгоритма
- 1.2 Математическое описание алгоритма
- 1.3 Вычислительное ядро алгоритма
- 1.4 Макроструктура алгоритма
- 1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
- 1.6 Последовательная сложность алгоритма
- 1.7 Информационный граф
- 1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
- 1.9 Входные и выходные данные алгоритма
- 1.10 Свойства алгоритма
- 2 Программная реализация алгоритма
- 2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
- 2.2 Локальность данных и вычислений
- 2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
- 2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
- 2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
- 2.6 Выводы для классов архитектур
- 2.7 Существующие реализации алгоритма
- 3 Литература
1 Свойства и структура алгоритмов
1.1 Общее описание алгоритма
k-means++[1] — улучшенная версия алгоритма кластеризации k-means. Суть улучшения заключается в нахождении более «хороших» начальных значений центроидов кластеров. Задача k-means состоит в том, чтобы найти центры кластеров, которые минимизируют внутриклассовую дисперсию, т.е. сумму квадратов расстояний от каждой кластеризуемой точки данных до ее центроида кластера (центра, который находится ближе всего к ней), то есть разбить [math]n[/math] наблюдений на [math]k[/math] кластеров таким образом, чтобы каждое наблюдение принадлежало ровно одному кластеру, расположенному на наименьшем расстоянии от наблюдения. Хотя найти точное решение задачи о k-средних для произвольных входных данных NP-сложно, [2] стандартный подход к нахождению приближенного решения широко используется и часто быстро находит разумные решения.
Однако алгоритм k-means имеет, по крайней мере, два основных теоретических недостатка:
- Было показано, что наихудшее время выполнения алгоритма является супер-полиномиальным по размеру входных данных.[3]
- Найденное приближение может быть сколь угодно плохим по отношению к целевой функции по сравнению с оптимальной кластеризацией.
1.2 Математическое описание алгоритма
Дано:
- набор из [math]n[/math] наблюдений [math]X={x_1,x_2,...,x_n},x_i \in R^d, i=1,...,n;[/math]
- [math]k[/math] - требуемое число кластеров, [math]k \in N, k \leq n.[/math]
Требуется:
Разделить множество наблюдений [math]X[/math] на [math]k[/math] кластеров [math]S_1,S_2,...,S_k:[/math]
- [math]S_i ∩ S_j = ∅, i ≠ j[/math]
- [math]\bigcup_{i=1}^{k}S_i = X[/math]
Действие алгоритма:
Алгоритм k-means++ разбивает набор [math]X[/math] на [math]k[/math] наборов [math]S_1,S_2,...,S_k[/math], таким образом, чтобы минимизировать сумму квадратов расстояний от каждой точки кластера до его центроида(центр масс кластера). Введем обозначение, [math]S={S_1,S_2,...,S_k}[/math]. Тогда действие алгоритма k-means++ равносильно поиску:
[math]\arg\min_{S} \sum\limits_{i=1}^k \sum\limits_{\mathbf{x} \in S_i} \rho(\mathbf{x}, \mathbf{\mu}_i )^2[/math], где [math]{\mu_i} = \frac{1}{|S_i|}\sum_{\mathbf x \in S_i} \mathbf x, [/math] – центры кластеров, [math]i=1,...,k,\rho(x,μ_i)[/math] – расстояние между [math]x[/math] и [math]μ_i[/math]
Алгоритм:
Инициализация: [math][/math]
- Случайным образом выбрать первый центроид [math]\mu_1[/math] из точек данных.
- Для каждой точки данных x вычислить ее расстояние [math]D(x)[/math] от ближайшего, ранее выбранного центроида.
- Выбрать следующий центроид из точек данных таким образом, чтобы вероятность выбора точки в качестве центроида была прямо пропорциональна квадрату ее расстоянию [math]D^2(x)[/math] от ближайшего, ранее выбранного центроида: [math]\frac{D^2(x)}{\sum_{x}D^2(x)}[/math](т.е. точка, имеющая максимальное расстояние от ближайшего центроида, с наибольшей вероятностью будет выбрана следующей в качестве центроида)
- Повторять шаги 2 и 3 до тех пор, пока не будут отобраны k центроидов: [math]\mu_i^{(0)} = \mu_i, \quad i=1,...,k[/math].
Теперь, когда начальные центроиды выбраны, нужно использовать стандартную кластеризацию k-means:
1. Распределение векторов по кластерам:
Шаг [math]t: \forall \mathbf{x}_i \in X, \ i=1,...,n: j=\arg\min_{k}\rho(\mathbf{x}_i,\mathbf{\mu}_k^{(t-1)})^2 \Longrightarrow \mathbf{x}_i \in S_j[/math]
2. Пересчет центров кластеров:
Шаг [math]t: \forall i=1,...,k: \mu_i^{(t)} = \cfrac{1}{|S_i|}\sum_{x\in S_i}x[/math]
3. Проверка условия останова:
- если [math]\exists i\in \overline{1,k}: \mu_i^{(t)} \ne \mu_i^{(t-1)}[/math] тогда
- [math]t = t + 1[/math];
- переход к шагу пересчета;
- иначе:
- останова
1.3 Вычислительное ядро алгоритма
1.4 Макроструктура алгоритма
1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
1.6 Последовательная сложность алгоритма
1.7 Информационный граф
1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
1.9 Входные и выходные данные алгоритма
1.10 Свойства алгоритма
2 Программная реализация алгоритма
2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
2.2 Локальность данных и вычислений
2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
2.6 Выводы для классов архитектур
2.7 Существующие реализации алгоритма
3 Литература
- ↑ Arthur, D.; Vassilvitskii, S. (2007). "k-means++: the advantages of careful seeding" (PDF). Proceedings of the eighteenth annual ACM-SIAM symposium on Discrete algorithms. Society for Industrial and Applied Mathematics Philadelphia, PA, USA. pp. 1027–1035.
- ↑ Drineas, P.; Frieze, A.; Kannan, R.; Vempala, S.; Vinay, V. (2004). "Clustering Large Graphs via the Singular Value Decomposition". Machine Learning. 56 (1–3): 9–33. doi:10.1023/B:MACH.0000033113.59016.96
- ↑ Arthur, D.; Vassilvitskii, S. (2006). "How slow is the k-means method?". Proceedings of the twenty-second annual symposium on Computational geometry. ACM New York, NY, USA. pp. 144–153.