Участник:Dmitry/Плотностный алгоритм кластеризации: различия между версиями
Dmitry (обсуждение | вклад) |
Dmitry (обсуждение | вклад) |
||
Строка 55: | Строка 55: | ||
== Макроструктура алгоритма == | == Макроструктура алгоритма == | ||
+ | Вычисление расстояния между двумя объектами из выборки <math>D</math> осуществляется при помощи различных метрик. В большинстве случаев вычисляется метрика Евклида: <math>dist(u,v)=\sqrt{(u_1-v_1)^2+(u_2-v_2)^2+...+(u_n-v_n)^2} = \sqrt{\sum_{k=1}^n(u_k-v_k)^2}.</math> | ||
+ | |||
+ | Также возможно использование метрики Минковского, что является обобщением евклидова расстояния: | ||
+ | |||
+ | <math>dist(x,y) = \left(\sum_{i=1}^n |x_i-y_i|^p\right)^{1/p}</math>. | ||
== Схема реализации последовательного алгоритма == | == Схема реализации последовательного алгоритма == |
Версия 18:20, 1 февраля 2017
Авторы описания: Титов Д.Е.
Содержание
- 1 Свойства и структура алгоритма
- 1.1 Общее описание алгоритма
- 1.2 Математическое описание алгоритма
- 1.3 Вычислительное ядро алгоритма
- 1.4 Макроструктура алгоритма
- 1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
- 1.6 Последовательная сложность алгоритма
- 1.7 Информационный граф
- 1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
- 1.9 Входные и выходные данные алгоритма
- 1.10 Свойства алгоритма
- 2 Программная реализация алгоритма
- 2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
- 2.2 Локальность данных и вычислений
- 2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
- 2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
- 2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
- 2.6 Выводы для классов архитектур
- 2.7 Существующие реализации алгоритма
- 3 Литература
1 Свойства и структура алгоритма
1.1 Общее описание алгоритма
Под кластеризацией понимается деление заданного множества точек данных (объектов) на подгруппы, каждая из которых, насколько это возможно, однородна. В основе метода кластеризации DBSCAN лежит объединение некоторых объектов в соответствии с их внутригрупповым «соединением». Для проведения корректной процедуры кластеризации необходимо указать критерии, по которым объекты будут объединены в кластеры. Прежде всего, необходимо сказать, что кластеры представляют собой плотные области некоторых объектов в пространстве данных, разделенных между собой объектами, плотность которых значительно ниже. Расположение точек в одном кластере обусловлено их соединением, т.е. некоторой связью между собой.
1.2 Математическое описание алгоритма
Плотность точек для данной точки [math]X[/math] определяется двумя параметрами. Первым из них является [math]\varepsilon[/math] – радиус «соседства» (приближенности) точки [math]X[/math]. Тогда множество [math]M_\varepsilon(X)[/math] будет включать в себя такие точки [math]f_i[/math], [math](i=\overline{1,n})[/math], для которых следующее неравенство будет истинно:
[math]dist(X,f_i) \le \varepsilon[/math], [math](i=\overline{1,n})[/math]
Функция [math]dist(var1, var2)[/math] определяет расстояние между объектами выборки [math]D[/math]. Это расстояние может вычисляться различными способами, например, как евклидово расстояние или с помощью метрики Минковского.
Вторым параметром определения плотности точек является [math]MCP[/math] – это минимальное количество точек, которые расположены ближе всего к данной точке согласно определенному радиусу [math]\varepsilon[/math].
Точка [math]f_i[/math], [math](i=\overline{1,n})[/math] будет являться окруженной точкой (согласно [math]\varepsilon[/math] и [math]MCP[/math]) если:
[math]M_\varepsilon(X) \le MPC[/math]
Это значит, что точка [math]f_i[/math], [math](i=\overline{1,n})[/math] окруженная, если количество «соседствующих» точек выборки [math]D[/math] окажется большим, либо равным значению параметра [math]MCP[/math] (рис. 1).
Точка [math]X[/math] является прямо достижимой по плотности от точки [math]f[/math] (при соответствующих [math]\varepsilon[/math] и [math]MPC[/math]), если точка [math]X \in M(X)[/math], т.е. точка [math]X[/math] – это одна из точек [math]f[/math] для другого окружения (соседства), где [math]f[/math] – окруженная точка (рис. 2).
Достижимость по плотности – это транзитивное замыкание прямо достижимой по плотности точки. Точка [math]f[/math] достижима по плотности из точки [math]X[/math], но точка [math]X[/math] не достижима по плотности из точки [math]f[/math] (рис. 3).
Точка [math]X[/math] соединена (связана) по плотности с точкой [math]f[/math] (согласно [math]\varepsilon[/math] и [math]MCP[/math]) если существует точка [math]e[/math] такая, что обе точки [math]X[/math] и [math]f[/math] являются достижимыми от точки [math]e[/math] (согласно [math]\varepsilon[/math] и [math]MCP[/math]) (рис. 4).
Кластер, сформированный на основе размещения объектов по плотности должен удовлетворять таким свойствам: максимальность; связность.
В этом случае, под кластером понимается непустое подмножество точек [math]G[/math] из набора данных [math]D[/math], которое удовлетворяет вышеупомянутым свойствам, причем, максимальность интерпретируется таким образом: если [math]X \in G[/math] и [math]f[/math] достижима по плотности от точки [math]X[/math], тогда и [math]f \in G[/math], это значит, что обе точки принадлежат одному кластеру.
Свойство связности гласит, что каждый объект в подмножестве [math]G[/math] соединен по плотности со всеми объектами кластера (при заданных [math]\varepsilon[/math] и [math]MCP[/math]).
Все объекты из набора данных [math]D[/math] представляют собой совокупность подмножеств:
[math]D= \{ G_1, G_2,..., G_n, N \}[/math],
где [math]G_1, G_2,..., G_n[/math] – кластеры, образованные по плотности; [math]N[/math] – некоторое подмножество, объекты которого не принадлежат ни одному из подмножеств [math]G_1, G_2,..., G_n[/math].
1.3 Вычислительное ядро алгоритма
Вычислительным ядром алгоритма является поиск всех "соседствующих" точек для каждой точки [math]X[/math] входного множества [math]D[/math]. Основное время работы алгоритма используется на функцию [math]dist(var1, var2)[/math], определяющую расстояние между объектами выборки [math]D[/math] и сравнение расстояния с заданной [math]\varepsilon[/math] для того, чтобы определить "соседствующие" точки.
1.4 Макроструктура алгоритма
Вычисление расстояния между двумя объектами из выборки [math]D[/math] осуществляется при помощи различных метрик. В большинстве случаев вычисляется метрика Евклида: [math]dist(u,v)=\sqrt{(u_1-v_1)^2+(u_2-v_2)^2+...+(u_n-v_n)^2} = \sqrt{\sum_{k=1}^n(u_k-v_k)^2}.[/math]
Также возможно использование метрики Минковского, что является обобщением евклидова расстояния:
[math]dist(x,y) = \left(\sum_{i=1}^n |x_i-y_i|^p\right)^{1/p}[/math].