DevbunovaViliana / Метод главных компонент (PСA): различия между версиями
[непроверенная версия] | [непроверенная версия] |
Строка 75: | Строка 75: | ||
=== Ресурс параллелизма алгоритма === | === Ресурс параллелизма алгоритма === | ||
+ | Если посмотреть на блок-схему алгоритма, то видно, что он строго последовательный на макроуровне, но отдельно взятые операции можно распараллелить. Причем они могут быть распараллелены покоординатно (так как имеют независимость итераций в некоторых циклах): умножение матриц, деление вектора на константу, умножение вектора на константу, транспонирование матрицы, вычитание матриц, умножение матрицы на число. | ||
=== Входные и выходные данные алгоритма === | === Входные и выходные данные алгоритма === |
Версия 23:46, 1 декабря 2020
Автор: Девбунова Вилиана Олеговна, студент ММП ВМК МГУ (417)
Содержание
- 1 Свойства и структура алгоритма
- 1.1 Общее описание алгоритма
- 1.2 Математическое описание алгоритма
- 1.3 Вычислительное ядро алгоритма
- 1.4 Макроструктура алгоритма
- 1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
- 1.6 Последовательная сложность алгоритма
- 1.7 Информационный граф
- 1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
- 1.9 Входные и выходные данные алгоритма
- 1.10 Свойства алгоритма
- 2 Программная реализация алгоритма
- 2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
- 2.2 Локальность данных и вычислений
- 2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
- 2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
- 2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
- 2.6 Выводы для классов архитектур
- 2.7 Существующие реализации алгоритма
- 3 Литература
1 Свойства и структура алгоритма
1.1 Общее описание алгоритма
Метод Главных Компонент (англ. Principal Components Analysis, PCA) — один из основных способов уменьшить размерность данных, потеряв наименьшее количество информации. Изобретен К. Пирсоном (англ.Karl Pearson) в 1901 г. Применяется во многих областях, таких как распознавание образов, компьютерное зрение, сжатие данных и т. п. Вычисление главных компонент сводится к вычислению собственных векторов и собственных значений ковариационной матрицы исходных данных или к сингулярному разложению матрицы данных.
Иногда метод главных компонент называют преобразованием Кархунена-Лоэва (англ. Karhunen-Loeve)или преобразованием Хотеллинга (англ. Hotelling transform). Другие способы уменьшения размерности данных — это метод независимых компонент, многомерное шкалирование, а также многочисленные нелинейные обобщения: метод главных кривых и многообразий, поиск наилучшей проекции (англ. Projection Pursuit), нейросетевые методы «узкого горла», самоорганизующиеся карты Кохонена и др.
1.2 Математическое описание алгоритма
Задача анализа главных компонент имеет много версий, вот базовые из них:
- аппроксимировать данные линейными многообразиями меньшей размерности;
- найти подпространства меньшей размерности, в ортогональной проекции на которые разброс данных максимален;
- найти подпространства меньшей размерности, в ортогональной проекции на которые среднеквадратичное расстояние между точками максимально;
- для данной многомерной случайной величины построить такое ортогональное преобразование координат, в результате которого корреляции между отдельными координатами обратятся в нуль.
Мы будем рассматривать только один вариант.
1.3 Вычислительное ядро алгоритма
Мы будем реализовывать PCA с помощью нахождения подпространства меньшей размерности, в ортогональной проекции на которые среднеквадратичное расстояние между точками максимально. Для вычисления собственных значений и соответствующих им собственных векторов будем использовать метод степенных итераций
1.3.1 Алгоритм вычисления собственных значений метод степенных итераций
Метод степенных итераций - это итерационный метод вычисления собственных значений и собственных векторов вещественной матрицы. Алгоритм вычисляет вектор [math]e[/math], содержащий собственные значения , и матрицу [math]E[/math], содержащую соответствующие собственные векторы, т. е. [math]e_i[/math]-собственное значение, а столбец [math]E_i[/math]-ортонормированный собственный вектор для [math]e_i[/math], для [math]i = 1,...,n[/math].
1.3.2 Задача нахождения подпространства меньшей размерности
Будем искать подпространство меньшей размерности, в ортогональной проекции на которые среднеквадратичное расстояние между точками максимально. Будем использовать жадную стратегию: Будем подбирать единичные вектора [math]E_i[/math], такие что норма проекций на этот вектор будет максимальна.
- 1.[math]||M E_1||^2 → max_{E_1}[/math]
- 2. [math] |M E_2||^2 → max_{E_2}[/math] и [math]E_1[/math] ортогонален [math]E_2[/math]
- 3. и т.д.
Запишем задачу Лагранжа: [math]\frac{d}{dE_1}(E_1^TM^TME_1 - \lambda(E_1^TE_1 -1) = 0[/math]
[math]M^TME_1 - \lambda E_1 = 0[/math] Значит, задача сводится к последовательному нахождению собственных векторов, отвечающих максимальным собственным значениям матрицы [math]M^TM[/math]
Алгоритм:
- 1. Вычислить эрмитов матрицу (найти сопряженную транспонированную), [math]M^T[/math] из матрицы [math]M[/math].
- 2. Вычислить умножение [math]M^TM[/math]
- 3. Вычислить собственные значения и собственные векторы [math]M^TM[/math], используя аметод степенных итераций.
- 4. Отсортировать собственные значения и соответствующие столбцы собственных векторов в порядке убывания собственных значений. И взять первые [math]k[/math] собственных векторов, отвечающих максимальным собственным значениям.
1.3.3 Анализ основных компонентов (PCA)
Анализ главных компонент, или сокращенно PCA, - это математическая процедура, которая преобразует набор (возможно коррелированных) переменных в меньшее число некоррелированных переменных, которые называют главными компонентами. Цель анализа главных компонент состоит в том, чтобы уменьшить размерность (количество признаков) набора данных, но сохранить как можно больше исходной изменчивости в данных. На первый основной компонент приходится большая часть изменчивости данных, на второй основной компонент приходится большая часть оставшейся изменчивости и т. д. PCA можно рассматривать как метод проекции, при котором данные с [math]n[/math]-признаками проецируются на подпространство с [math]n[/math] (или меньшим количеством) признаков, сохраняя при этом большую часть информации. Мы будем внешне задавать размерность признанного пространства, которое хотим получить [math]k[/math].
1.4 Макроструктура алгоритма
Макроструктура алгоритма:
- 1. Вычислить [math]M^T[/math] из матрицы [math]M[/math].
- 2. Вычислить умножение [math]M^TM[/math]
- 3. В цикле до сходимости вычислять:
[math] E_{k+1} = \frac{M^TME_k}{\|M^TME_k\|} [/math] -- сойдется к собственному вектору, отвечающему максимальному значению, тогда последовательность [math]\lambda_{k+1} = \frac{(E_k,M^TME_k)}{(E_k,E_k)}[/math] сойдется к максимальному собственному значению.
- 4. Теперь вместо выражения [math]M^TM[/math] в пункте 3 используем
[math] M^TM - \lambda_k E_k E_k^T[/math]
- 5. Повторяем пункт 3 и 4 столько раз, какой размерности хотим получить новое пространство.
1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
1.6 Последовательная сложность алгоритма
Оценим сложности операций. Пусть [math]n[/math] -- количество объектов в выборке, [math]d[/math] -- размерность пространства признаков, [math]k[/math] -- размерность итогового пространства (но так как основной смысл задачи -- это понижение размерности, то [math]k \lt \lt n[/math] и [math]k \lt \lt d[/math], поэтому мы не будем учитывать его при подсчете асимптотической сложности), тогда: нахождение транспонированной матрицы [math]O(n*d)[/math], перемножение [math]M^TM[/math]имеет сложность [math]O(n*d^2)[/math], случайная генерация вектора [math]O(d)[/math], вычисление [math]E_k[/math] состоит из перемножения матрицы на вектор, что занимает [math]O(d^2)[/math], вычисление нормы вектора [math]O(d)[/math] и покомпонентного деление вектора на константу [math]O(d)[/math]. Подсчет [math]\lambda_k[/math] использует уже посчитанное для [math]E_k[/math] умножение матрицы на вектор, дополнительно происходит два раза скалярное произведение над векторами [math]O(d)[/math], и поэлементное деление вектора на константу [math]O(d)[/math]. Вычисление [math]\lambda_k E_k E_k^T[/math] занимает [math]O(d^2)[/math], вычитание матриц имеет сложность [math]O(d^2)[/math].
1.7 Информационный граф
Так как алгоритм очень объемный и его не возможно представить в 3-ех мерном пространстве, то изобразим информационный граф самой частой операции в алгоритме: умножение матрицы на вектор. Информационный граф операции умножения матрицы на вектор Одной из самых сложных операций в алгоритме является операция перемножения матриц, ее информационный граф выглядит следующим образом: Информационный граф перемножения матриц
1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
Если посмотреть на блок-схему алгоритма, то видно, что он строго последовательный на макроуровне, но отдельно взятые операции можно распараллелить. Причем они могут быть распараллелены покоординатно (так как имеют независимость итераций в некоторых циклах): умножение матриц, деление вектора на константу, умножение вектора на константу, транспонирование матрицы, вычитание матриц, умножение матрицы на число.
1.9 Входные и выходные данные алгоритма
1.10 Свойства алгоритма
2 Программная реализация алгоритма
2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
2.2 Локальность данных и вычислений
2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
2.6 Выводы для классов архитектур
2.7 Существующие реализации алгоритма
3 Литература
[1] Wikipedia contributors. Principal component analysis. In Wikipedia, The Free Encyclopedia from https://en.wikipedia.org/wiki/Principal_component_analysis