Алгоритм Пурдома: различия между версиями
[непроверенная версия] | [непроверенная версия] |
Daryin (обсуждение | вклад) |
Daryin (обсуждение | вклад) |
||
Строка 25: | Строка 25: | ||
=== Описание схемы реализации последовательного алгоритма === | === Описание схемы реализации последовательного алгоритма === | ||
+ | |||
+ | '''1 этап''' (''вычисление компонент сильной связности'') может быть реализован [[Алгоритм Тарьяна поиска компонент сильной связности|алгоритмом Тарьяна]]<ref name=DFS>Tarjan, Robert. “Depth-First Search and Linear Graph Algorithms.” SIAM Journal on Computing 1, no. 2 (1972): 146–60.</ref>, находящим компоненты сильной связности в ходе [[Поиск в глубину (DFS)|поиска в глубину]]. | ||
+ | |||
+ | '''2 этап''' (''топологическая сортировка'') может быть реализован алгоритмом Кана<ref>Kahn, A B. “Topological Sorting of Large Networks.” Communications of the ACM 5, no. 11 (November 1962): 558–62. doi:10.1145/368996.369025.</ref> либо последовательным применением [[Поиск в глубину (DFS)|поиска в глубину]]<ref>Tarjan, Robert. “Depth-First Search and Linear Graph Algorithms.” SIAM Journal on Computing 1, no. 2 (1972): 146–60.</ref> для нумерации вершин в предпорядке. | ||
+ | |||
+ | '''3 этап''' (''транзитивное замыкание'' <math>\tilde G</math>) выполняется следующим алгоритмом: | ||
+ | |||
+ | '''Входные данные''': | ||
+ | ациклический граф 'G'' с вершинами 'V'', пронумерованными в топологическом порядке, и рёбрами ''E''. | ||
+ | '''Выходные данные''': | ||
+ | для каждой вершины ''v'' ∈ ''V'' – набор вершин ''T''(''v''), | ||
+ | так что транзитивное замыкание ''G'' состоит из рёбер (''v'', ''w''), ''v'' ∈ ''V'', ''w'' ∈ ''T''(''v''). | ||
+ | |||
+ | '''for each''' ''v'' ∈ ''V'' '''do''' ''T''(''v'') := { ''v'' } | ||
+ | '''for''' ''v'' ∈ ''V'' '''in reverse order''': | ||
+ | '''for each''' (''v'', ''w'') ∈ ''E'' '''do''' ''T''(''v'') := ''T''(''v'') ∪ ''T''(''w'') | ||
+ | |||
+ | '''4 этап''' (''транзитивное замыкание'' <math>G</math>) либо выполняется следующим алгоритмом: | ||
+ | |||
+ | '''Входные данные''' | ||
+ | граф ''G'' с вершинами ''V''; | ||
+ | компоненты сильной связности ''SCC''(''v'') графа ''G''; | ||
+ | граф <math>\tilde G</math> с вершинами <math>\tilde V</math>; | ||
+ | транзитивное замыкание <math>\tilde T</math> графа <math>\tilde G</math>. | ||
+ | '''Выходные данные''': | ||
+ | для каждой вершины ''v'' ∈ ''V'' – набор вершин ''T''(''v''), | ||
+ | так что транзитивное замыкание ''G'' состоит из рёбер (''v'', ''w''), ''v'' ∈ ''V'', ''w'' ∈ ''T''(''v''). | ||
+ | |||
+ | '''for each''' ''v'' ∈ ''V'' '''do''' ''T''(''v'') := { ''v'' } | ||
+ | '''for each''' ''v'' ∈ <math>\tilde V</math>: | ||
+ | '''for each''' ''w'' ∈ <math>\tilde T(v)</math>: | ||
+ | ''T''(''v'') := ''T''(''v'') ∪ ''SCC''(''w'') | ||
+ | '''for each''' ''x'' ∈ ''SCC''(''v''): | ||
+ | ''T''(''x'') := ''T''(''v'') ''/* присваивание по ссылке */'' | ||
+ | |||
+ | либо транзитивное замыкание может строиться по упакованным данным <math>\tilde T(v)</math> одной из следующих функций: | ||
+ | |||
+ | '''Входные данные''' | ||
+ | граф ''G'' с вершинами ''V''; | ||
+ | компоненты сильной связности ''SCC''(''v'') графа ''G''; | ||
+ | отображение ''R''(''v'') вершин графа ''G'' на вершины графа <math>\tilde G</math>; | ||
+ | граф <math>\tilde G</math> с вершинами <math>\tilde V</math>; | ||
+ | транзитивное замыкание <math>\tilde T</math> графа <math>\tilde G</math>. | ||
+ | |||
+ | '''function''' transitive_closure(''v''): | ||
+ | ''T'' := { ''v'' } | ||
+ | '''for each''' ''w'' ∈ <math>\tilde T(R(v))</math>: | ||
+ | ''T'' := ''T'' ∪ ''SCC''(''w'') | ||
+ | '''return''' ''T'' | ||
+ | |||
+ | '''function''' is_in_transitive_closure(''v'', ''w''): | ||
+ | '''return''' ''R''(''w'') ∈ <math>\tilde T(R(v))</math> | ||
+ | |||
=== Последовательная сложность алгоритма === | === Последовательная сложность алгоритма === | ||
=== Информационный граф === | === Информационный граф === |
Версия 12:31, 14 июня 2015
Содержание
- 1 Свойства и структура алгоритмов
- 1.1 Общее описание алгоритма
- 1.2 Математическое описание
- 1.3 Вычислительное ядро алгоритма
- 1.4 Макроструктура алгоритма
- 1.5 Описание схемы реализации последовательного алгоритма
- 1.6 Последовательная сложность алгоритма
- 1.7 Информационный граф
- 1.8 Описание ресурса параллелизма алгоритма
- 1.9 Описание входных и выходных данных
- 1.10 Свойства алгоритма
- 2 Программная реализация алгоритмов
- 2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
- 2.2 Описание локальности данных и вычислений
- 2.3 Возможные способы и особенности реализации параллельного алгоритма
- 2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
- 2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
- 2.6 Выводы для классов архитектур
- 2.7 Существующие реализации алгоритма
- 3 Литература
1 Свойства и структура алгоритмов
1.1 Общее описание алгоритма
Алгоритм Пурдома[1] находит транзитивное замыкание ориентированного графа за время [math]O(\mu n)[/math], где [math]\mu \le m[/math] – число рёбер, соединяющих компоненты сильной связности этого графа.
1.2 Математическое описание
Алгоритм основан на следующих свойствах:
- Если вершины [math]v[/math] и [math]w[/math] принадлежат одной компоненте сильной связности графа [math]G[/math], то его транзитивное замыкание [math]G^+[/math] содержит рёбра [math](v, w)[/math] и [math](w, v)[/math].
- Если вершины [math]x[/math] и [math]y[/math] принадлежат одной компоненте сильной связности графа [math]G[/math], а вершины [math]z[/math] и [math]t[/math] – другой, то рёбра [math](x, z)[/math], [math](x, t)[/math], [math](y, z)[/math], [math](y, t)[/math] принадлежат или не принадлежат транзитивному замыканию [math]G^+[/math] одновременно.
Таким образом, поиск транзитивного замыкания графа [math]G[/math] сводится к поиску транзитивного замыкания ациклического графа [math]\tilde G[/math], полученного из [math]G[/math] схлопыванием каждой компоненты сильной связности в одну вершину. Транзитивное замыкание ациклического графа вычисляется с использованием топологической сортировки вершин графа.
1.3 Вычислительное ядро алгоритма
1.4 Макроструктура алгоритма
Вычисления производятся в четыре этапа:
- Найти компоненты сильной связности исходного графа, заменить каждую компоненту на одну вершину и удалить образовавшиеся рёбра-петли.
- Выполнить топологическую сортировку полученного ациклического графа [math]\tilde G[/math].
- Вычислить транзитивное замыкание графа [math]\tilde G[/math], двигаясь от вершин с бо́льшими номерами к меньшим.
- По найденному транзитивному замыканию [math]\tilde G[/math] восстановить транзитивное замыкание исходного графа.
Последний этап не является обязательным, если рассматривать транзитивное замыкание [math]\tilde G[/math] как «упакованное» транзитивное замыкание [math]G[/math].
1.5 Описание схемы реализации последовательного алгоритма
1 этап (вычисление компонент сильной связности) может быть реализован алгоритмом Тарьяна[2], находящим компоненты сильной связности в ходе поиска в глубину.
2 этап (топологическая сортировка) может быть реализован алгоритмом Кана[3] либо последовательным применением поиска в глубину[4] для нумерации вершин в предпорядке.
3 этап (транзитивное замыкание [math]\tilde G[/math]) выполняется следующим алгоритмом:
Входные данные: ациклический граф 'G с вершинами 'V, пронумерованными в топологическом порядке, и рёбрами E. Выходные данные: для каждой вершины v ∈ V – набор вершин T(v), так что транзитивное замыкание G состоит из рёбер (v, w), v ∈ V, w ∈ T(v). for each v ∈ V do T(v) := { v } for v ∈ V in reverse order: for each (v, w) ∈ E do T(v) := T(v) ∪ T(w)
4 этап (транзитивное замыкание [math]G[/math]) либо выполняется следующим алгоритмом:
Входные данные граф G с вершинами V; компоненты сильной связности SCC(v) графа G; граф [math]\tilde G[/math] с вершинами [math]\tilde V[/math]; транзитивное замыкание [math]\tilde T[/math] графа [math]\tilde G[/math]. Выходные данные: для каждой вершины v ∈ V – набор вершин T(v), так что транзитивное замыкание G состоит из рёбер (v, w), v ∈ V, w ∈ T(v). for each v ∈ V do T(v) := { v } for each v ∈ [math]\tilde V[/math]: for each w ∈ [math]\tilde T(v)[/math]: T(v) := T(v) ∪ SCC(w) for each x ∈ SCC(v): T(x) := T(v) /* присваивание по ссылке */
либо транзитивное замыкание может строиться по упакованным данным [math]\tilde T(v)[/math] одной из следующих функций:
Входные данные граф G с вершинами V; компоненты сильной связности SCC(v) графа G; отображение R(v) вершин графа G на вершины графа [math]\tilde G[/math]; граф [math]\tilde G[/math] с вершинами [math]\tilde V[/math]; транзитивное замыкание [math]\tilde T[/math] графа [math]\tilde G[/math]. function transitive_closure(v): T := { v } for each w ∈ [math]\tilde T(R(v))[/math]: T := T ∪ SCC(w) return T function is_in_transitive_closure(v, w): return R(w) ∈ [math]\tilde T(R(v))[/math]
1.6 Последовательная сложность алгоритма
1.7 Информационный граф
1.8 Описание ресурса параллелизма алгоритма
1.9 Описание входных и выходных данных
1.10 Свойства алгоритма
2 Программная реализация алгоритмов
2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
2.2 Описание локальности данных и вычислений
2.3 Возможные способы и особенности реализации параллельного алгоритма
2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
2.6 Выводы для классов архитектур
2.7 Существующие реализации алгоритма
- Boost Graph Library (функция
transitive_closure
).
3 Литература
- ↑ Purdom, Paul, Jr. “A Transitive Closure Algorithm.” Bit 10, no. 1 (March 1970): 76–94. doi:10.1007/BF01940892.
- ↑ Tarjan, Robert. “Depth-First Search and Linear Graph Algorithms.” SIAM Journal on Computing 1, no. 2 (1972): 146–60.
- ↑ Kahn, A B. “Topological Sorting of Large Networks.” Communications of the ACM 5, no. 11 (November 1962): 558–62. doi:10.1145/368996.369025.
- ↑ Tarjan, Robert. “Depth-First Search and Linear Graph Algorithms.” SIAM Journal on Computing 1, no. 2 (1972): 146–60.