Поиск в ширину (BFS): различия между версиями
[непроверенная версия] | [непроверенная версия] |
Elijah (обсуждение | вклад) |
Elijah (обсуждение | вклад) |
||
Строка 88: | Строка 88: | ||
=== Последовательная сложность алгоритма === | === Последовательная сложность алгоритма === | ||
+ | |||
+ | Алгоритм имеет последовательную сложность <math>O(m + n)</math>, где <math>n</math> и <math>m</math> - число вершин и ребер графа соответственно: алгоритм инициализирует начальный массив расстояний - <math>O(n)</math> операций, а затем обходит каждую вершину один единственный раз - <math>O(m)</math> операций. | ||
+ | |||
=== Информационный граф === | === Информационный граф === | ||
Версия 11:05, 8 августа 2017
Алгоритм DCSC поиска компонент сильной связности | |
Последовательный алгоритм | |
Последовательная сложность | [math]O(n + m)[/math] |
Объём входных данных | [math]O(m + n)[/math] |
Объём выходных данных | [math]O(n)[/math] |
Параллельный алгоритм | |
Высота ярусно-параллельной формы | [math]N/A, \max O(V) [/math] |
Ширина ярусно-параллельной формы | [math]N/A, \max O(E) [/math] |
Основные авторы описания: И.В.Афанасьев
Содержание
- 1 Свойства и структура алгоритма
- 1.1 Общее описание алгоритма
- 1.2 Математическое описание алгоритма
- 1.3 Вычислительное ядро алгоритма
- 1.4 Макроструктура алгоритма
- 1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
- 1.6 Последовательная сложность алгоритма
- 1.7 Информационный граф
- 1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
- 1.9 Входные и выходные данные алгоритма
- 1.10 Свойства алгоритма
- 2 Программная реализация алгоритма
- 2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
- 2.2 Локальность данных и вычислений
- 2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
- 2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
- 2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
- 2.6 Выводы для классов архитектур
- 2.7 Существующие реализации алгоритма
- 3 Литература
1 Свойства и структура алгоритма
1.1 Общее описание алгоритма
Поиск в ширину (англ. Breadth-First Search, BFS) позволяет вычислить кратчайшие расстояния (в терминах количества рёбер) от выделенной вершины ориентированного графа до всех остальных вершин, и/или построить корневое направленное дерево, расстояния в котором совпадают с расстояниями в исходном графе. Кроме того, поиск в ширину позволяет решать задачу проверки достижимости (существуют ли пути между вершиной источником и остальными вершинами графа). Впервые алгоритм поиска в ширину описан в работах Мура[1] и Ли[2].
Алгоритм основан на обходе вершин графа "по слоям". На каждом шаге есть множество "передовых" вершин, для смежных к которым производится проверка, относятся ли они к еще не посещенным. Все еще не посещенные вершины добавляются в новое множество "передовых" вершин, обрабатываемых на следующем шаге. Изначально в множество "передовых" вершин входит только вершина-источник, от которой и начинается обход.
В последовательном случае алгоритм имеет алгоритмическую сложность [math]O(n + m)[/math], где [math]n[/math] - число вершин в графе, [math]m[/math] - число ребер в графе.
1.2 Математическое описание алгоритма
Пусть задан граф [math]G = (V, E)[/math] без весов, и с выделенной вершиной-источником [math]u[/math]. Путем [math]P(u,v)[/math] между вершинами [math]u[/math] и [math]v[/math] называется множество ребер [math](u, v_1), (v_1, v_2), ... (v_{n-1}, v)[/math]. Длиной пути [math]d(u,v)[/math] обозначим число ребер в данном пути между вершинами [math]u[/math] и [math]v[/math]. Поиск в ширину находит кратчайшие пути [math]d(u,v)[/math] от вершины [math]u[/math] до всех остальных вершин графа описанным далее образом.
В начале работы алгоритма расстояние до вершины-источника [math]d(u)=0[/math], до остальных вершин [math]d(v) = \infty, \forall v \neq u [/math]. Так же в начале работы алгоритм инициализируются множество [math]F = \{u\}[/math].
Далее на каждом шаге алгоритм строится множество вершин [math]P = {w} [/math], таких, что для [math]\forall v \in F \exists (v, w) \in E | d(w) = \infty [/math], при том обновляются расстояния [math]d(w)=d(v)+1[/math] для [math]\forall w \in P [/math]. Затем производится переход на следующий шаг до тех пор, пока [math]P \neq \emptyset[/math], при том в начале каждого шага множество F заменяется на P.
1.3 Вычислительное ядро алгоритма
Вычислительным ядром алгоритма является обход вершин, смежной к выбранной вершине [math]v[/math] с последующем добавлением еще не посещенных вершин в множество [math]P[/math]. Данная операция выполняться на каждом шаге для каждой вершины [math]v \in F[/math].
1.4 Макроструктура алгоритма
Алгоритм последовательно уточняет значения функции [math]d(v)[/math].
Структуру можно описать следующим образом:
1. Инициализация: всем вершинам присваивается предполагаемое расстояние [math]d(v)=\infty[/math], кроме вершины-источника, для которой [math]d(u)=0[/math] .
2. Помещение вершины источника [math]v[/math] в множество "передовых" вершин [math]F[/math].
3. Обход вершин множества [math]F[/math].
а) Инициализация множества [math]P=\emptyset[/math].
б) Для каждой вершины [math]v \in F[/math] обход всех вершин [math]w | \exists (v, w)[/math] (смежных с ней), c помещением в множество [math]P[/math] таких вершин [math]w | d(w)=\infty[/math].
в) Замена множества [math]F[/math] на [math]P[/math] и переход на шаг 3 в случае, если множество [math]F \neq \emptyset[/math].
1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
Простейшая версия алгоритма поиск в ширину может быть реализована при помощи очередей на языке C++ следующим образом. Код приведен в предположении, что граф хранится в формате сжатого списка смежности: для каждой вершины в массиве vertices_to_edges_ptrs хранятся индекс начала и индекс конца списка смежных с ней вершин из массива dst_ids.
// init distances
for(int i = 0; i < vertices_count; i++)
_result[i] = MAX_INT;
// init queue and first vertex
std::queue<int> vertex_queue;
vertex_queue.push(_source_vertex);
_result[_source_vertex] = 1;
// do bfs
while(vertex_queue.size() > 0)
{
int cur_vertex = vertex_queue.front();
vertex_queue.pop();
long long first = vertices_to_edges_ptrs[cur_vertex];
long long last = vertices_to_edges_ptrs[cur_vertex + 1];
for(long long i = first; i < last; i++)
{
int dst_id = dst_ids[i];
if(_result[dst_id] == MAX_INT)
{
_result[dst_id] = _result[src_id] + 1;
vertex_queue.push(dst_id);
}
}
}
1.6 Последовательная сложность алгоритма
Алгоритм имеет последовательную сложность [math]O(m + n)[/math], где [math]n[/math] и [math]m[/math] - число вершин и ребер графа соответственно: алгоритм инициализирует начальный массив расстояний - [math]O(n)[/math] операций, а затем обходит каждую вершину один единственный раз - [math]O(m)[/math] операций.
1.7 Информационный граф
Информационный граф
1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
1.9 Входные и выходные данные алгоритма
1.10 Свойства алгоритма
2 Программная реализация алгоритма
2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
2.2 Локальность данных и вычислений
2.2.1 Локальность реализации алгоритма
2.2.1.1 Структура обращений в память и качественная оценка локальности
2.2.1.2 Количественная оценка локальности
2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
2.4.1 Масштабируемость алгоритма
2.4.2 Масштабируемость реализации алгоритма
2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
2.6 Выводы для классов архитектур
2.7 Существующие реализации алгоритма
- Распределённый алгоритм поиска вширь является вычислительным ядром бенчмарка Graph500.
- C++: Boost Graph Library (функции
breadth_first_search
,breadth_first_visit
). - C++, MPI: Parallel Boost Graph Library (функция
breadth_first_search
). - Java: WebGraph (класс
ParallelBreadthFirstVisit
), многопоточная реализация. - Python: NetworkX (функция
bfs_edges
). - Python/C++: NetworKit (класс
networkit.graph.BFS
).