Уровень алгоритма

Алгоритм Флойда-Уоршелла: различия между версиями

Материал из Алговики
Перейти к навигации Перейти к поиску
[выверенная версия][досмотренная версия]
 
Строка 74: Строка 74:
 
== Программная реализация алгоритма ==
 
== Программная реализация алгоритма ==
 
=== Особенности реализации последовательного алгоритма ===
 
=== Особенности реализации последовательного алгоритма ===
=== Локальность данных и вычислений ===
 
==== Локальность реализации алгоритма ====
 
===== Структура обращений в память и качественная оценка локальности =====
 
===== Количественная оценка локальности =====
 
 
=== Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма ===
 
=== Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма ===
=== Масштабируемость алгоритма и его реализации ===
+
=== Результаты прогонов ===
==== Масштабируемость алгоритма ====
 
Возможность обрабатывать фрагменты независимо означает хорошую масштабируемость алгоритма. Сдерживающие факторы: <br>
 
1)Пропускная способность памяти при чтении данных графа.<br>
 
2)Соперничество потоков при выполнении атомарных операций с памятью. <br>
 
3)Синхронизация после каждого подшага алгоритма. <br>
 
 
 
Алгоритм Флойда-Уоршелла обладает большим потенциалом масштабируемости, так как вычисление кратчайших путей можно распределить между независимыми процессами вплоть до вычисления каждым отдельным процессом одного элемента матрицы смежности.
 
 
 
==== Масштабируемость реализации алгоритма ====
 
Проведём исследование масштабируемости параллельной реализации алгоритма. Работа выполнена с использованием оборудования Центра коллективного пользования сверхвысокопроизводительными вычислительными ресурсами МГУ имени М.В. Ломоносова.
 
Сильная масштабируемость показывает, как меняется время решения задачи с увеличением количества процессоров (или вычислительных узлов) при неизменном общем объёме задачи.
 
 
 
[[file: Pic1.jpg|thumb|center|700px|Сравнение времени параллельной работы алгоритма Флойда-Уоршелла в зависимости от количества процессоров.]]
 
 
 
[[file: Pic3.jpg|thumb|center|700px|Ускорение параллельного алгоритма Флойда-Уоршелла с ростом числа процессоров.]]
 
 
 
Как видно из представленных графиков параллельный алгоритм сильно масштабируем.
 
 
 
=== Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма ===
 
 
=== Выводы для классов архитектур ===
 
=== Выводы для классов архитектур ===
=== Существующие реализации алгоритма ===
 
 
* C++: [http://www.boost.org/libs/graph/doc/ Boost Graph Library] (функция <code>[http://www.boost.org/libs/graph/doc/floyd_warshall_shortest.html floyd_warshall_shortest]</code>).
 
* Python: [https://networkx.github.io NetworkX] (функция <code>[http://networkx.github.io/documentation/networkx-1.9.1/reference/generated/networkx.algorithms.shortest_paths.dense.floyd_warshall.html floyd_warshall]</code>).
 
* Java: [http://jgrapht.org JGraphT] (класс <code>[http://jgrapht.org/javadoc/org/jgrapht/alg/FloydWarshallShortestPaths.html FloydWarshallShortestPaths]</code>).
 
  
 
== Литература ==
 
== Литература ==

Текущая версия на 10:54, 5 июля 2022


Автор: Екатерина Шевченко

1 Свойства и структура алгоритма

1.1 Общее описание алгоритма

Алгоритм Флойда-Уоршелла[1][2][3] предназначен для решения задачи поиска всех кратчайших путей на графе. Для заданного ориентированного взвешенного графа алгоритм находит кратчайшие расстояния между всеми парами вершин за время [math]O(n^3)[/math]. Алгоритм применим к графам с произвольными, в том числе с отрицательными, весами. Таким образом, он является более общим в сравнении с алгоритмом Дейкстры, который не работает с отрицательными весами ребер. Также алгоритм распознаёт наличие отрицательных циклов.

1.2 Математическое описание алгоритма

Имеем граф [math]G=(V,E)[/math], в котором каждая вершина пронумерована от [math]1[/math] до [math]|V|[/math]. Сформируем матрицу смежности [math]D[/math]. Эта матрица имеет размер [math]|V|*|V|[/math] и каждому ее элементу [math]D_{ij}[/math] присвоен вес ребра, соединяющего вершину [math]i[/math] с вершиной [math]j[/math]. Заметим, что в силу ориентированности графа [math]G[/math] матрица [math]D[/math] может быть несимметрична.

По мере выполнения алгоритма данная матрица будет перезаписываться: в каждую из ее ячеек внесется значение, определяющее оптимальную длину пути из вершины [math]i[/math] в вершину [math]j[/math].

Полагаем диагональные элементы [math]D_{ii}[/math] равными нулю, а недиагональные элементы, соответствующие не инцидентным вершинам (не имеющим общего ребра), положим равными бесконечности или числу, заведомо большему возможного расстояния между ребрами.

Ключевая часть алгоритма состоит из трех циклов:
Для k от 1 до |V| выполнять
Для i от 1 до |V| выполнять
Для j от 1 до |V| выполнять
Если [math]{D_{ik}+D_{kj} \lt D_{ij}}[/math], то [math]{D_{ij} := D_{ik}+D_{kj}}[/math].

1.3 Вычислительное ядро алгоритма

Основной операцией алгоритма является релаксация элементов матрицы смежности: если [math]{D_{ik}+D_{kj} \lt D_{ij}}[/math], то производится присваивание [math]{D_{ij} := D_{ik}+D_{kj}}[/math].

1.4 Макроструктура алгоритма

Ключевая часть алгоритма состоит из трех циклов:
Для k от 1 до |V| выполнять
Для i от 1 до |V| выполнять
Для j от 1 до |V| выполнять
Если [math]{D_{ik}+D_{kj} \lt D_{ij}}[/math], то [math]{D_{ij} := D_{ik}+D_{kj}}[/math].

При этом вычисляются минимумы из двух чисел [math]min({D_{ik}+D_{kj}}, D_{ij})[/math] и их значения становятся новыми значениями элементов смежной матрицы.

1.5 Схема реализации последовательного алгоритма

matrix - матрица смежности, numberOfVert - число вершин в графе

   //Пробегаемся по всем вершинам и ищем более короткий путь
   //через вершину k
   for(int k = 0; k < numberOfVert; k++) {
       for(int i = 0; i < numberOfVert; i++) {
          for(int j = 0; j < numberOfVert; j++) {
               //Новое значение ребра равно минимальному между старым
               //и суммой ребер i <-> k + k <-> j (если через k пройти быстрее)
               matrix[i][j] = min(matrix[i][j], matrix[i][k] + matrix[k][j]);
           }
       }
   }

1.6 Последовательная сложность алгоритма

Время выполнения этой программы, очевидно, имеет порядок [math]O(n^3)[/math], поскольку в ней практически нет ничего, кроме вложенных друг в друга трех циклов.

1.7 Информационный граф

Рис.1. Информационная структура предельной параллелизации алгоритма Флойда-Уоршелла

На приведенном далее информационном графе нижний уровень параллелизма обозначен в горизонтальных плоскостях. Множество всех плоскостей представляет собой верхний уровень параллелизма (операции в каждой плоскости могут выполняться параллельно). Верхний уровень параллелизма заключается в параллельном подсчете дистанций для различных элементов матрицы смежности, и на рисунке отмечен разными плоскостями.

1.8 Ресурс параллелизма алгоритма

В последовательном алгоритме единственная операция - это нахождение минимума, ее нет смысла распараллеливать. Вся сложность алгоритма заключается в полном переборе «матрицы смежности». Идея параллельных схем алгоритма Флойда-Уоршелла состоит в том, чтобы модифицировать матрицу смежности одновременно несколькими процессорами. Можно выделить два основных подхода.

Первый подход. В распоряжении имеется такое количество процессоров, что можно отдать каждому ровно по одному элементу [math]D_{ij}[/math], чтобы он считал для этого элемента минимум.

Второй подход. В распоряжении ограниченное количество процессов. В этом случае грамотным решением будет отдать каждому процессору(или процессу) по одной строке матрицы смежности. Пусть каждый процесс посчитает минимумы в своей строке матрицы и отдаст результаты корневому процессу, это прилично ускорит работу алгоритма.

Для параллельного алгоритма на отдельной итерации каждый процессор выполняет обновление элементов матрицы [math]D[/math]. Всего в подзадачах [math]{n^2/p}[/math] таких элементов, число итераций алгоритма равно [math]n[/math], таким образом, показатели ускорения и эффективности параллельного алгоритма Флойда имеют вид ([math]p[/math] – число процессоров): [math]{Sp = n^3/(n^3/p) = p}[/math], [math]{Ep = n^3/(p(n^3⁄p)) = 1}[/math].

1.9 Входные и выходные данные алгоритма

Входные данные: Матрица смежности D. Перед работой алгоритма матрица D заполняется длинами рёбер графа (или запредельно большим числом M, если ребра нет).
Выходные данные: Матрица кратчайших расстояний D.

1.10 Свойства алгоритма

Алгоритм может распознавать наличие отрицательных циклов: такой цикл существует, если один из диагональных элементов матрицы расстояний становится меньше нуля.

2 Программная реализация алгоритма

2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма

2.2 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма

2.3 Результаты прогонов

2.4 Выводы для классов архитектур

3 Литература

  1. Roy, Bernard. “Transitivité Et Connexité.” Comptes Rendus De l'Académie Des Sciences 249 (1959): 216–218.
  2. Warshall, Stephen. “A Theorem on Boolean Matrices.” Journal of the ACM 9, no. 1 (January 1, 1962): 11–12. doi:10.1145/321105.321107.
  3. Floyd, Robert W. “Algorithm 97: Shortest Path.” Communications of the ACM 5, no. 6 (June 1, 1962): 345. doi:10.1145/367766.368168.