Участник:Руфина Третьякова/Хранение ненулевых элементов разреженных матриц. Умножение разреженной матрицы на вектор: различия между версиями
Строка 20: | Строка 20: | ||
=== Математическое описание алгоритма === | === Математическое описание алгоритма === | ||
− | Исходные данные: разреженная матрица <math> | + | Исходные данные: разреженная матрица <math>M^{n*n}</math>, вектор <math>x^{n*1}</math> |
Рассмотрим CSR-представление разреженных матриц | Рассмотрим CSR-представление разреженных матриц | ||
− | CSR-формат представляет матрицу | + | CSR-формат представляет матрицу <math>M</math> в виде 3-х одномерных массивов: |
массив <math>A</math> содержит ненулевые значения матрицы, | массив <math>A</math> содержит ненулевые значения матрицы, | ||
<math>JA</math> - номера столбцов ненулевых элементов., | <math>JA</math> - номера столбцов ненулевых элементов., | ||
<math>IA</math>- содержит номер с которого начинается описание элементов в массивах, | <math>IA</math>- содержит номер с которого начинается описание элементов в массивах, | ||
− | Этот формат позволяет быстро производить | + | Этот формат позволяет быстро производить перемножение матрицы <math>M</math> на вектор <math>x</math>. |
Строка 46: | Строка 46: | ||
IA = [ 0 0 2 3 4 ] | IA = [ 0 0 2 3 4 ] | ||
JA = [ 0 1 2 1 ] | JA = [ 0 1 2 1 ] | ||
− | |||
− | Вычисляемые данные: вектор <math>c | + | |
+ | Вычисляемые данные: вектор <math>M*x</math>=<math>c</math> | ||
=== Вычислительное ядро алгоритма === | === Вычислительное ядро алгоритма === |
Версия 00:20, 13 октября 2016
Умножение разреженной матрицы на вектор | |
Последовательный алгоритм | |
Последовательная сложность | [math][/math] |
Объём входных данных | [math][/math] |
Объём выходных данных | [math][/math] |
Параллельный алгоритм | |
Высота ярусно-параллельной формы | [math][/math] |
Ширина ярусно-параллельной формы | [math][/math] |
Авторы статьи: Третьякова Р. М. (группа 603), Буторина Е. В. (группа 603)
Содержание
- 1 Свойства и структура алгоритма
- 1.1 Общее описание алгоритма
- 1.2 Математическое описание алгоритма
- 1.3 Вычислительное ядро алгоритма
- 1.4 Макроструктура алгоритма
- 1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
- 1.6 Последовательная сложность алгоритма
- 1.7 Информационный граф
- 1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
- 1.9 Входные и выходные данные алгоритма
- 1.10 Свойства алгоритма
- 2 Программная реализация алгоритма
- 3 Литература
1 Свойства и структура алгоритма
1.1 Общее описание алгоритма
Разрежённая матрица — это матрица с преимущественно нулевыми элементами. В противном случае, если бо́льшая часть элементов матрицы ненулевые, матрица считается плотной. Среди специалистов нет единства в определении того, какое именно количество ненулевых элементов делает матрицу разрежённой. Разные авторы предлагают различные варианты. Огромные разрежённые матрицы часто возникают при решении таких задач, как дифференциальное уравнение в частных производных. При хранении и преобразовании разрежённых матриц в компьютере бывает полезно, а часто и необходимо, использовать специальные алгоритмы и структуры данных, которые учитывают разрежённую структуру матрицы. Операции и алгоритмы, применяемые для работы с обычными, плотными матрицами, применительно к большим разрежённым матрицам работают относительно медленно и требуют значительных объёмов памяти. Однако разрежённые матрицы могут быть легко сжаты путём записи только своих ненулевых элементов, что снижает требования к компьютерной памяти.
1.2 Математическое описание алгоритма
Исходные данные: разреженная матрица [math]M^{n*n}[/math], вектор [math]x^{n*1}[/math]
Рассмотрим CSR-представление разреженных матриц
CSR-формат представляет матрицу [math]M[/math] в виде 3-х одномерных массивов:
массив [math]A[/math] содержит ненулевые значения матрицы, [math]JA[/math] - номера столбцов ненулевых элементов., [math]IA[/math]- содержит номер с которого начинается описание элементов в массивах, Этот формат позволяет быстро производить перемножение матрицы [math]M[/math] на вектор [math]x[/math].
Например, матрица
- [math]\begin{pmatrix} 0 & 0 & 0 & 0 \\ 5 & 8 & 0 & 0 \\ 0 & 0 & 3 & 0 \\ 0 & 6 & 0 & 0 \\ \end{pmatrix}[/math]
это Шаблон:Math разреженная матрица с 4-мя ненулевыми элементами, представляемая в формате CSR
A = [ 5 8 3 6 ] IA = [ 0 0 2 3 4 ] JA = [ 0 1 2 1 ]
Вычисляемые данные: вектор [math]M*x[/math]=[math]c[/math]
1.3 Вычислительное ядро алгоритма
1.4 Макроструктура алгоритма
Псевдокод алгоритма:
Входные данные: число строк матрицы n; разреженная матрица в формате CSR: строчные указатели IA, столбцовые указателиJA, ненулевые элементы A; вектор x. Выходные данные: произведение матрицы на вектор y. Q := new priority queue for i = 1,n: for k = IA(i), IA(i+1)-1: y(i) += A(k)*x(JA(k));
1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
Метод можно описать следующим образом:
1.6 Последовательная сложность алгоритма
Для вычисления сингулярных чисел и векторов матрицы порядка n в последовательном варианте требуется:
- [math][/math] делений,
- [math][/math] сложений (вычитаний),
- [math][/math] умножений.
1.7 Информационный граф
1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
1.9 Входные и выходные данные алгоритма
1.10 Свойства алгоритма
2 Программная реализация алгоритма
2.1 Масштабируемость алгоритма и его реализации
2.2 Существующие реализации алгоритма
3 Литература
1. С. Писсанецки Технология разреженных матриц. Изд. Мир, 1988.