Участник:Demon smd/Нечеткий алгоритм С средних: различия между версиями
Demon smd (обсуждение | вклад) |
|||
Строка 17: | Строка 17: | ||
и усовершенствован (для случая m>1) | и усовершенствован (для случая m>1) | ||
J.C. Bezdek в 1981 г. <ref>Bezdek, James C. (1981). Pattern Recognition with Fuzzy Objective Function Algorithms. ISBN 0-306-40671-3.</ref> | J.C. Bezdek в 1981 г. <ref>Bezdek, James C. (1981). Pattern Recognition with Fuzzy Objective Function Algorithms. ISBN 0-306-40671-3.</ref> | ||
− | . В отличие от алгоритма c-means | + | . В отличие от алгоритма c-means данный метод кластеризации предполагает, что входные данные могут принадлежать более, чем одному кластеру одновременно. |
− | Алгоритм получает на вход набор | + | Алгоритм получает на вход набор кластеризуемых векторов, количество кластеров, коэффициент неопределённости m и коэффициент <math>\varepsilon > 0</math>, определяющий точность алгоритма. На выходе алгоритма получаем матрицу вероятностей принадлежности каждого входного вектора каждому кластеру. |
− | Нечеткий алгоритм С средних для каждого вектора | + | Нечеткий алгоритм С средних заключается в следующем. Изначально для каждого вектора определяется случайным образом вероятность принадлежности вектора к каждому кластеру. Далее запускается итерационный процесс, на каждой итерации которого происходит: |
− | 1) | + | 1) расчёт центров кластеров |
− | 2) | + | 2) расчёт Евклидова расстояния от каждого вектора до центра каждого кластера |
− | 3) | + | 3) расчёт и нормализация коэффициентов принадлежности векторов кластерам |
− | 4) | + | 4) расчёт значения решающей функции и сравнение этого значения со значением решающей функции на предшествующей итерации: если разница этих значений меньше установленного значения, то алгоритм прекращает работу (решающая функция возвращает сумму всех Евклидовых расстояний каждого объекта к каждому центру кластера умноженному на коэффициент принадлежности) |
=== Математическое описание алгоритма === | === Математическое описание алгоритма === | ||
Строка 34: | Строка 34: | ||
:<math> | :<math> | ||
\begin{align} | \begin{align} | ||
− | J_{m} = \sum_{i = 1}^{N}\sum_{j = 1}^{C}u_{i,j}^m\left\Vert{x_{i}-c_{j}}\right\|^2 | + | J_{m} = \sum_{i = 1}^{N}\sum_{j = 1}^{C}u_{i,j}^m\left\Vert{x_{i}-c_{j}}\right\|^2 & , & & 1 \le m \le \infty , \\ |
\end{align} | \end{align} | ||
</math> | </math> | ||
− | |||
где m - это действительное число не меньше единицы, <math>u_{i,j}</math> - коэффициент принадлежности вектора <math>x_{i}</math> к кластеру <math>c_{j}</math>, <math>x_{i}</math> - <math>i</math>-ый компонент <math>N</math>-мерного вектора <math>x</math>, <math>c_{j}</math> | где m - это действительное число не меньше единицы, <math>u_{i,j}</math> - коэффициент принадлежности вектора <math>x_{i}</math> к кластеру <math>c_{j}</math>, <math>x_{i}</math> - <math>i</math>-ый компонент <math>N</math>-мерного вектора <math>x</math>, <math>c_{j}</math> | ||
- центр <math>j</math>-ого кластера, а <math>\left\Vert{*}\right\|</math> - это любая норма, определяющая расстояние от вектора до центра кластера. | - центр <math>j</math>-ого кластера, а <math>\left\Vert{*}\right\|</math> - это любая норма, определяющая расстояние от вектора до центра кластера. | ||
Строка 51: | Строка 50: | ||
=== Вычислительное ядро алгоритма === | === Вычислительное ядро алгоритма === | ||
− | + | Ядром алгоритма является: | |
+ | * вычисление новых центров кластеров | ||
+ | * для каждого входного вектора вычисление Евклидова расстояния до центров кластеров, а также коэффициента принадлежности кластерам | ||
+ | * вычисление решающей функции | ||
=== Макроструктура алгоритма === | === Макроструктура алгоритма === | ||
Строка 132: | Строка 134: | ||
=== Ресурс параллелизма алгоритма === | === Ресурс параллелизма алгоритма === | ||
− | На каждом ярусе ярусно-параллельной формы алгоритма будет располагаться конечное число элементарных операций, например, взятие адреса, сложение или возведение в степень. Информационый граф из п.1.7 изображает свёрнутую ярусно-параллельную форму алгоритма. Как видно из информационного графа, | + | На каждом ярусе ярусно-параллельной формы алгоритма будет располагаться конечное число элементарных операций, например, взятие адреса, сложение или возведение в степень. Информационый граф из п.1.7 изображает свёрнутую ярусно-параллельную форму алгоритма. |
+ | |||
+ | Сложность алгоритма будем рассчитывать в предположении, что число вычислительных ядер стремится к бесконечности. Как видно из информационного графа, параллельная сложность вычисления центров кластеров составляет <math>O(\log_{2} C*|X|)</math>, вычисления коэффициентов принадлежности - <math>O(\log_{2} C^2*|X|)</math>, а вычисления решающей функции - не больше чем <math>O(\log_{2} C*|X|)</math>. | ||
− | Таким образом | + | Таким образом параллельная сложность итерации алгоритма составляет <math>O(\log_{2} C^4*|X|^3)</math>. |
− | Так как задачи, решаемые в | + | Так как задачи, решаемые в макроструктуре алгоритма могут быть сведены к задачам вычисления суммы элементов массива и максимального элемента массива, то на <math>i</math>-ом ярусе графа будет находиться <math>{N}\over{2^i}</math> операции, где N - количество элементов массива. |
=== Входные и выходные данные алгоритма === | === Входные и выходные данные алгоритма === | ||
Строка 157: | Строка 161: | ||
=== Масштабируемость алгоритма и его реализации === | === Масштабируемость алгоритма и его реализации === | ||
− | Как видно из предыдущих пунктов, масштабируется данный алгоритм хорошо. С увеличением количества процессоров время работы падает, а с увеличением количества входных данных и количества кластеров - растёт. На рисунках | + | Как видно из предыдущих пунктов, масштабируется данный алгоритм хорошо. С увеличением количества процессоров время работы падает, а с увеличением количества входных данных и количества кластеров - растёт. На рисунках показана масштабируемость алгоритма. |
[[File:FCMCOMP1.jpg|thumb|center|1500px|Рисунок 2. Масштабируемость алгоритма. Зависимость сложности алгоритма от количества процессоров и входных данных при фиксированном количестве кластеров.]] | [[File:FCMCOMP1.jpg|thumb|center|1500px|Рисунок 2. Масштабируемость алгоритма. Зависимость сложности алгоритма от количества процессоров и входных данных при фиксированном количестве кластеров.]] | ||
[[File:FCMCOMP2.jpg|thumb|center|1500px|Рисунок 3. Масштабируемость алгоритма. Зависимость сложности алгоритма от количества процессоров и кластеров при фиксированном количестве входных данных.]] | [[File:FCMCOMP2.jpg|thumb|center|1500px|Рисунок 3. Масштабируемость алгоритма. Зависимость сложности алгоритма от количества процессоров и кластеров при фиксированном количестве входных данных.]] |
Версия 20:15, 14 октября 2016
Нечеткий алгоритм C средних (Fuzzy C-means) | |
Последовательный алгоритм | |
Последовательная сложность | [math]O(C^2*N*D*IterNumber)[/math] |
Объём входных данных | [math]|X|*C [/math] |
Объём выходных данных | [math]|X|*C [/math] |
Параллельный алгоритм | |
Высота ярусно-параллельной формы | [math]O(\log_{2}C^4*|X|^3) * IterNumber[/math] |
Ширина ярусно-параллельной формы | [math]O(C^2*|X|)[/math] |
Авторы описания алгоритма: Д.А.Гуськов М.А.Абраменкова
Содержание
- 1 Свойства и структура алгоритма
- 1.1 Общее описание алгоритма
- 1.2 Математическое описание алгоритма
- 1.3 Вычислительное ядро алгоритма
- 1.4 Макроструктура алгоритма
- 1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
- 1.6 Последовательная сложность алгоритма
- 1.7 Информационный граф
- 1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
- 1.9 Входные и выходные данные алгоритма
- 1.10 Свойства алгоритма
- 2 Программная реализация алгоритма
- 3 Литература
1 Свойства и структура алгоритма
1.1 Общее описание алгоритма
Нечёткий алгоритм кластеризации С-средних был разработан (для случая m=2) J.C. Dunn в 1973 г. [1] и усовершенствован (для случая m>1) J.C. Bezdek в 1981 г. [2] . В отличие от алгоритма c-means данный метод кластеризации предполагает, что входные данные могут принадлежать более, чем одному кластеру одновременно. Алгоритм получает на вход набор кластеризуемых векторов, количество кластеров, коэффициент неопределённости m и коэффициент [math]\varepsilon \gt 0[/math], определяющий точность алгоритма. На выходе алгоритма получаем матрицу вероятностей принадлежности каждого входного вектора каждому кластеру.
Нечеткий алгоритм С средних заключается в следующем. Изначально для каждого вектора определяется случайным образом вероятность принадлежности вектора к каждому кластеру. Далее запускается итерационный процесс, на каждой итерации которого происходит:
1) расчёт центров кластеров
2) расчёт Евклидова расстояния от каждого вектора до центра каждого кластера
3) расчёт и нормализация коэффициентов принадлежности векторов кластерам
4) расчёт значения решающей функции и сравнение этого значения со значением решающей функции на предшествующей итерации: если разница этих значений меньше установленного значения, то алгоритм прекращает работу (решающая функция возвращает сумму всех Евклидовых расстояний каждого объекта к каждому центру кластера умноженному на коэффициент принадлежности)
1.2 Математическое описание алгоритма
Нечеткий алгоритм С средних минимизирует величину:
- [math] \begin{align} J_{m} = \sum_{i = 1}^{N}\sum_{j = 1}^{C}u_{i,j}^m\left\Vert{x_{i}-c_{j}}\right\|^2 & , & & 1 \le m \le \infty , \\ \end{align} [/math]
где m - это действительное число не меньше единицы, [math]u_{i,j}[/math] - коэффициент принадлежности вектора [math]x_{i}[/math] к кластеру [math]c_{j}[/math], [math]x_{i}[/math] - [math]i[/math]-ый компонент [math]N[/math]-мерного вектора [math]x[/math], [math]c_{j}[/math] - центр [math]j[/math]-ого кластера, а [math]\left\Vert{*}\right\|[/math] - это любая норма, определяющая расстояние от вектора до центра кластера. Нечёткое разбиение входных данных на кластеры производится итеративной оптимизацией вышеуказанной функции с обновлением коэффициента принадлежности [math]u_{i,j}[/math] и переопределением центра кластера [math]c_{j}[/math] на каждой итерации алгоритма.
1.2.1 Вычисляемые данные на каждой итерации
- Центры кластеров рассчитываются по следующей формуле: [math]c_{j} = {{\sum_{i = 1}^{n}{u_{i,j}^m} * x_{i}} \over {\sum_{i = 1}^{n}{u_{i,j}^m}}}[/math], где [math]u_{i,j}[/math] — коэффициент принадлежности [math]x_{i}[/math] вектора к кластеру [math]c_{j}[/math].
- Коэффициент принадлежности рассчитывается по формуле: [math]u_{i,j} = {1 \over \sum_{k = 1}^{C}{({\left\Vert{x_{i}-c_{j}}\right\| \over \left\Vert{x_{i}-c_{k}}\right\|})}^{2 \over m-1}}[/math]
- Решающая функция рассчитывается по формуле: [math]\max_{i,j}(|u_{i,j}^{(k)} - u_{i,j}^{(k-1)}|)[/math], где [math]k[/math] - номер итерации алгоритма
1.3 Вычислительное ядро алгоритма
Ядром алгоритма является:
- вычисление новых центров кластеров
- для каждого входного вектора вычисление Евклидова расстояния до центров кластеров, а также коэффициента принадлежности кластерам
- вычисление решающей функции
1.4 Макроструктура алгоритма
В каждой итерации алгоритма происходит 3 основных действия описанных в п. 1.2.1:
- вычисление центров кластеров
- вычисление коэффициентов принадлежности
- вычисление решающей функции
Подробное описание макроструктур в виде кода приведено в пункте 1.5
1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
Схему реализации последовательного алгоритма можно описать на C++ следующим образом:
FCM (X[], C, m, eps){
float deside = 0;
float newDeside = 0;
generateMembershipDegree(); //заполняет uPrev[][] случайными нормрованными коэффициентами
while (true){
newDeside = deside;
//вычисление центров кластеров
for (int j=0; j<C; j++){ //для каждого кластера
float numerator = 0;
float denumerator = 0;
for (int i=0; i<X.size(); i++){ //для каждого вектора
numerator+=pow(u[i][j], m) * x[i];
denumerator+=pow(u[i][j], m);
}
c[j] = numerator / denumerator;
}
//вычисление коэффициентов u[][]
for (int i=0; i<X.size(); i++) //для каждого вектора
for (int j=0; j<C; j++){ //для каждого кластера
sum = 0;
for (int k=0; k<C; k++)
sum+= pow( dist(x[i], c[j]) / dist(x[i], c[k]), 2/(m-1));
u[i][j] = 1/sum
}
//определения максимального различия между u[][] и uPrev[][]
float max = 0;
for (int i=0; i<X.size(); i++) //для каждого вектора
for (int j=0; j<C; j++){ //для каждого кластера
if (abs(uPrev[i][j]-u[i][j])>max)
max = abs(uPrev[i][j]-u[i][j]);
if (eps <= max)
for (int i=0; i<X.size(); i++) //для каждого вектора
for (int j=0; j<C; j++){ //для каждого кластера
uPrev[i][j]=u[i][j];
else
break;
}
return u;
}
1.6 Последовательная сложность алгоритма
Последовательная сложность всего алгоритма складывается из сложности операций на каждой итерации умноженную на количество итераций. Так как в данном алгоритме количество итераций не является фиксированным и зависит от:
- параметра [math]\varepsilon[/math]
- набора входных векторов [math]x[/math]
- выбора начальных коэффициентов [math]u[/math]
то в данном пункте будет приведена сложность одной итерации относительно количества входных векторов. Как видно из предыдущего пункта, для вычисления центров кластеров требуется [math]O(2*C*|X|)[/math] операций, для определения коэффициентов [math]u[/math] - [math]O(C^2*|X|)[/math] операций, а для вычисления решающей функции - [math]O(2*C*|X|)[/math] операций, где [math]|X|[/math] - число входных векторов, а [math]C[/math] - количество кластеров.
Таким образом итоговая сложность одной итерации составляет [math]O(C^2*|X|)[/math].
1.7 Информационный граф
Как видно из пункта 1.5, на каждом действии каждой итерации алгоритма все операции, выполняющиеся в цикле, не зависят друг от друга и могут быть распаралелены. Это показано на Рисунке 1.
1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
На каждом ярусе ярусно-параллельной формы алгоритма будет располагаться конечное число элементарных операций, например, взятие адреса, сложение или возведение в степень. Информационый граф из п.1.7 изображает свёрнутую ярусно-параллельную форму алгоритма.
Сложность алгоритма будем рассчитывать в предположении, что число вычислительных ядер стремится к бесконечности. Как видно из информационного графа, параллельная сложность вычисления центров кластеров составляет [math]O(\log_{2} C*|X|)[/math], вычисления коэффициентов принадлежности - [math]O(\log_{2} C^2*|X|)[/math], а вычисления решающей функции - не больше чем [math]O(\log_{2} C*|X|)[/math].
Таким образом параллельная сложность итерации алгоритма составляет [math]O(\log_{2} C^4*|X|^3)[/math].
Так как задачи, решаемые в макроструктуре алгоритма могут быть сведены к задачам вычисления суммы элементов массива и максимального элемента массива, то на [math]i[/math]-ом ярусе графа будет находиться [math]{N}\over{2^i}[/math] операции, где N - количество элементов массива.
1.9 Входные и выходные данные алгоритма
1.9.1 Входные данные алгоритма
- [math]x_{i}[/math] - набор входных векторов
- [math]C[/math] - количество кластеров
- [math]m[/math] - коэффициент неопределённости
- [math]\varepsilon \gt 0[/math] - коэффициент, определяющий точность алгоритма.
1.9.2 Выходные данные алгоритма
- [math]u[/math] - матрица принадлежности векторов кластерам
1.10 Свойства алгоритма
Увеличение скорости работы алгоритма при распараллеливании на бесконечном количестве процессоров составляет [math]O({{C^2*|X|}\over{\log_{2} (C^4*|X|^3)}})[/math]. Например, для разбиения 1000 элементов на 10 кластеров производительность параллельного алгоритма будет в 2315 раз больше, а на 20 кластеров - уже в 8477 раз.
2 Программная реализация алгоритма
2.1 Масштабируемость алгоритма и его реализации
Как видно из предыдущих пунктов, масштабируется данный алгоритм хорошо. С увеличением количества процессоров время работы падает, а с увеличением количества входных данных и количества кластеров - растёт. На рисунках показана масштабируемость алгоритма.
2.2 Существующие реализации алгоритма
Существует множество реализаций данного алгоритма. Рассмотрим некоторые из них:
- Например, тут: https://habrahabr.ru/post/208496/ [3] приведено краткое описание алгоритма и приведена его реализация на php. В данной статье довольно подробно расписан каждый шаг алгоритма и приведён соответствующий ему фрагмент кода.
- Тут: http://num-meth.srcc.msu.ru/zhurnal/tom_2012/v13r207.html [4] приводится реализация алгоритма для PostgreSQL, а также прилагается скрипт внедрения алгоритма.
3 Литература
<references \>
- ↑ Dunn, J. C. (1973-01-01). "A Fuzzy Relative of the ISODATA Process and Its Use in Detecting Compact Well-Separated Clusters". Journal of Cybernetics. 3 (3): 32–57. doi:10.1080/01969727308546046. ISSN 0022-0280.
- ↑ Bezdek, James C. (1981). Pattern Recognition with Fuzzy Objective Function Algorithms. ISBN 0-306-40671-3.
- ↑ Нестер А. "Алгоритм нечёткой кластеризации fuzzy c-means на PHP". [html](https://habrahabr.ru/post/208496/)
- ↑ Миниахметов Р.М., Цымблер М.Л. "Интеграция алгоритма кластеризации Fuzzy c-Means в PostgreSQL". [html](http://num-meth.srcc.msu.ru/zhurnal/tom_2012/v13r207.html)