Алгоритм Пурдома
Содержание
- 1 Свойства и структура алгоритмов
- 1.1 Общее описание алгоритма
- 1.2 Математическое описание
- 1.3 Вычислительное ядро алгоритма
- 1.4 Макроструктура алгоритма
- 1.5 Описание схемы реализации последовательного алгоритма
- 1.6 Последовательная сложность алгоритма
- 1.7 Информационный граф
- 1.8 Описание ресурса параллелизма алгоритма
- 1.9 Описание входных и выходных данных
- 1.10 Свойства алгоритма
- 2 Программная реализация алгоритмов
- 2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
- 2.2 Описание локальности данных и вычислений
- 2.3 Возможные способы и особенности реализации параллельного алгоритма
- 2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
- 2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
- 2.6 Выводы для классов архитектур
- 2.7 Существующие реализации алгоритма
- 3 Литература
1 Свойства и структура алгоритмов
1.1 Общее описание алгоритма
Алгоритм Пурдома[1] находит транзитивное замыкание ориентированного графа за время O(\mu n), где \mu \le m – число рёбер, соединяющих компоненты сильной связности этого графа.
1.2 Математическое описание
Алгоритм основан на следующих свойствах:
- Если вершины v и w принадлежат одной компоненте сильной связности графа G, то его транзитивное замыкание G^+ содержит рёбра (v, w) и (w, v).
- Если вершины x и y принадлежат одной компоненте сильной связности графа G, а вершины z и t – другой, то рёбра (x, z), (x, t), (y, z), (y, t) принадлежат или не принадлежат транзитивному замыканию G^+ одновременно.
Таким образом, поиск транзитивного замыкания графа G сводится к поиску транзитивного замыкания ациклического графа \tilde G, полученного из G схлопыванием каждой компоненты сильной связности в одну вершину. Транзитивное замыкание ациклического графа вычисляется с использованием топологической сортировки вершин графа.
1.3 Вычислительное ядро алгоритма
1.4 Макроструктура алгоритма
Вычисления производятся в четыре этапа:
- Найти компоненты сильной связности исходного графа, заменить каждую компоненту на одну вершину и удалить образовавшиеся рёбра-петли.
- Выполнить топологическую сортировку полученного ациклического графа \tilde G.
- Вычислить транзитивное замыкание графа \tilde G, двигаясь от вершин с бо́льшими номерами к меньшим.
- По найденному транзитивному замыканию \tilde G восстановить транзитивное замыкание исходного графа.
Последний этап не является обязательным, если рассматривать транзитивное замыкание \tilde G как «упакованное» транзитивное замыкание G.
1.5 Описание схемы реализации последовательного алгоритма
1 этап (вычисление компонент сильной связности) может быть реализован алгоритмом Тарьяна[2], находящим компоненты сильной связности в ходе поиска в глубину.
2 этап (топологическая сортировка) может быть реализован алгоритмом Кана[3] либо последовательным применением поиска в глубину[2] для нумерации вершин в предпорядке.
3 этап (транзитивное замыкание \tilde G) выполняется следующим алгоритмом:
Входные данные: ациклический граф 'G с вершинами 'V, пронумерованными в топологическом порядке, и рёбрами E. Выходные данные: для каждой вершины v ∈ V – набор вершин T(v), так что транзитивное замыкание G состоит из рёбер (v, w), v ∈ V, w ∈ T(v). for each v ∈ V do T(v) := { v } for v ∈ V in reverse order: for each (v, w) ∈ E do T(v) := T(v) ∪ T(w)
4 этап (транзитивное замыкание G) либо выполняется следующим алгоритмом:
Входные данные граф G с вершинами V; компоненты сильной связности SCC(v) графа G; граф [math]\tilde G[/math] с вершинами [math]\tilde V[/math]; транзитивное замыкание [math]\tilde T[/math] графа [math]\tilde G[/math]. Выходные данные: для каждой вершины v ∈ V – набор вершин T(v), так что транзитивное замыкание G состоит из рёбер (v, w), v ∈ V, w ∈ T(v). for each v ∈ V do T(v) := { v } for each v ∈ [math]\tilde V[/math]: for each w ∈ [math]\tilde T(v)[/math]: T(v) := T(v) ∪ SCC(w) for each x ∈ SCC(v): T(x) := T(v) /* присваивание по ссылке */
либо транзитивное замыкание может строиться по упакованным данным \tilde T(v) одной из следующих функций:
Входные данные граф G с вершинами V; компоненты сильной связности SCC(v) графа G; отображение R(v) вершин графа G на вершины графа [math]\tilde G[/math]; граф [math]\tilde G[/math] с вершинами [math]\tilde V[/math]; транзитивное замыкание [math]\tilde T[/math] графа [math]\tilde G[/math]. function transitive_closure(v): T := { v } for each w ∈ [math]\tilde T(R(v))[/math]: T := T ∪ SCC(w) return T function is_in_transitive_closure(v, w): return R(w) ∈ [math]\tilde T(R(v))[/math]
1.6 Последовательная сложность алгоритма
Первый и второй этап выполняются с помощью поиска в глубину со сложностью O(m).
На третьем этапе основой операцией является объединение списков вершин. В случае хранения списков в отсортированном виде объединение выполняется за линейное время. Количество списков не превосходит n, а в каждом списке не более \mu + 1 вершин, где \mu – количество рёбер, соединяющих компоненты связности. Общая сложность тогда составляет O(\mu n). Альтернативным форматов хранения списка вершин является битовая маска, соответствующая сложность O(n^2).
Сложность четвёртого этапа составляет O(n^2), так как для каждой из n вершин за линейное время вычисляется список вершин из не более чем n элементов. Поскольку компоненты сильной связности не пересекаются, на данном этапе уже не требуется хранить списки в отсортированном виде.
Таким образом, общая сложность составляет O(\mu n), если не требуется явное построение транзитивного замыкания, или O(n^2) в противном случае.
1.7 Информационный граф
1.8 Описание ресурса параллелизма алгоритма
1.9 Описание входных и выходных данных
1.10 Свойства алгоритма
2 Программная реализация алгоритмов
2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
2.2 Описание локальности данных и вычислений
2.3 Возможные способы и особенности реализации параллельного алгоритма
2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
2.6 Выводы для классов архитектур
2.7 Существующие реализации алгоритма
- Boost Graph Library (функция
transitive_closure
).
3 Литература
- ↑ Purdom, Paul, Jr. “A Transitive Closure Algorithm.” Bit 10, no. 1 (March 1970): 76–94. doi:10.1007/BF01940892.
- ↑ Перейти обратно: 2,0 2,1 Tarjan, Robert. “Depth-First Search and Linear Graph Algorithms.” SIAM Journal on Computing 1, no. 2 (1972): 146–60.
- ↑ Kahn, A B. “Topological Sorting of Large Networks.” Communications of the ACM 5, no. 11 (November 1962): 558–62. doi:10.1145/368996.369025.