Участник:Бротиковская Данута/Алгоритм k-means
Алгоритм k средних (k means) | |
Последовательный алгоритм | |
Последовательная сложность | [math]O(n^3)[/math] |
Объём входных данных | [math]\frac{n (n + 1)}{2}[/math] |
Объём выходных данных | [math]\frac{n (n + 1)}{2}[/math] |
Параллельный алгоритм | |
Высота ярусно-параллельной формы | [math]O(n)[/math] |
Ширина ярусно-параллельной формы | [math]O(n^2)[/math] |
Авторы страницы Данута Бротиковская и Денис Зобнин
Содержание
- 1 Свойства и структура алгоритма
- 1.1 Общее описание алгоритма
- 1.2 Математическое описание алгоритма
- 1.3 Вычислительное ядро алгоритма
- 1.4 Макроструктура алгоритма
- 1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
- 1.6 Последовательная сложность алгоритма
- 1.7 Информационный граф
- 1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
- 1.9 Входные и выходные данные алгоритма
- 1.10 Свойства алгоритма
- 2 Программная реализация алгоритма
- 2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
- 2.2 Локальность данных и вычислений
- 2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
- 2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
- 2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
- 2.6 Выводы для классов архитектур
- 2.7 Существующие реализации алгоритма
- 3 Литература
1 Свойства и структура алгоритма
1.1 Общее описание алгоритма
Алгоритм k средних (k means) -- наиболее популярный метод кластеризации. Был изобретен в 1950-х годах математиком Гуго Штейнгаузом и почти одновременно Стюартом Ллойдом. Особую популярность приобрел после публикации работы МакКуина в 1967. Цель алгоритма заключается в разделении N наблюдений на K кластеров таким образом, чтобы каждое наблюдение придележало ровно одному кластеру, расположенному на наименьшем расстоянии от наблюдения.
1.2 Математическое описание алгоритма
Дан набор из [math]n[/math] d-мерных векторов [math]X=\{\mathbf{x}_1, \mathbf{x}_2, ..., \mathbf{x}_n\}[/math]. Алгоритм k средних разбивает набор [math]X[/math] на [math]k, k\lt =n[/math] наборов [math]S=\{S_1, S_2, ..., S_k\}, S_i \cap S_j= \varnothing, i \ne j, [/math] таким образом, чтобы минимизировать сумму квадратов расстояний от каждой точки кластера до его центра. Другими словами:
[math]\arg\min_{S} \sum\limits_{i=1}^k \sum\limits_{x \in S_i} \lVert \mathbf{x}- \mathbf{\mu}_i \rVert^2[/math],
где [math]\mathbf{\mu}_i[/math]- центры кластеров, [math]i=\overline{1,k}[/math]
Шаги алгоритма:
-
Начальный шаг: инициализация кластеров
Выбирается произвольное множество точек [math]\mu_i, i=\overline{1,k}[/math], рассматриваемых как начальные центры кластеров.
-
Распределение векторов по кластерам
[math]\forall \mathbf{x}_i \in X, i=\overline{1,n}: \mathbf{x}_i \in S_j \iff j=\arg\min_{k}||\mathbf{x}_i-\mathbf{\mu}_k||^2[/math]
-
Пересчет центров кластеров
[math] \forall i=\overline{1,k}: \widetilde{\mu_i} = \cfrac{1}{||S_i||}\sum_{x\in S_i}x[/math]
-
Проверка условия останова:
if [math]\exist i\in \overline{1,k}: \mu_i \ne \widetilde{\mu_i}[/math] then goto 2; else stop
1.3 Вычислительное ядро алгоритма
Вычислительным ядром являются шаги 2 и 3 приведенного выше алгоритма: распределение векторов по кластерам и пересчет центров кластеров.
Распределение векторов по кластерам предполагает вычисление расстояний между каждым вектором [math]\mathbf{x}_i \in X, i= \overline{1,n}[/math] и центрами кластера [math]\mathbf{\mu}_j, j= \overline{1,k}[/math]. Таким образом, данный шаг предполагает [math]k*N[/math] вычислений расстояний между d-мерными векторами.
Пересчет центров кластеров предполагает [math]k[/math] вычислений центров масс [math]\mathbf{\mu}_i[/math] множеств [math]S_i, i=\overline{1,k}[/math], представленных выражением в шаге 3 представленного выше алгоритма.
1.4 Макроструктура алгоритма
1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
algorithm k-means is 1. Инициализировать центры кластеров [math]\mathbf{\mu}_i^{(1)}, i=\overline{1,k}[/math] 2. [math]t \leftarrow 1[/math] 3. Распределение по кластерам
[math]S_i^{(t)}=\{\mathbf{x}_p: \lVert\mathbf{x}_p-\mathbf{\mu}_i^{(t)}\rVert^2 \leq \lVert\mathbf{x}_p-\mathbf{\mu}_j^{(t)}\rVert^2 \quad \forall j=\overline{1,k}\},[/math]
где каждый вектор [math]\mathbf{x}_p[/math] соотносится единственному кластеру [math]S^{(t)}[/math] 4. Обновление центров кластеров
[math]\mathbf{\mu}_i^{(t+1)} = \frac{1}{|S^{(t)}_i|} \sum_{\mathbf{x}_j \in S^{(t)}_i} \mathbf{x}_j [/math]
5. if [math]\exist i \in \overline{1,k}: \mathbf{\mu}_i^{(t)} \ne \mathbf{\mu}_i^{(t+1)}[/math] then goto 3; else stop
1.6 Последовательная сложность алгоритма
1.7 Информационный граф
1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
1.9 Входные и выходные данные алгоритма
Входные данные
- Целое положительное число [math]k[/math]– количество кластеров.
- Матрица из [math]n*d[/math] элементов – координат векторов (наблюдений).
Объем входных данных
1 целое число + [math]n*d[/math] вещественных чисел (при условии, что координаты – вещественные числа).
Выходные данные
Целые положительные числа – номера кластеров, соотвествующие каждому вектору (при условии, что нумерация кластеров начинается с 1).
Объем выходных данных
[math]n[/math] целых положительных чисел.
1.10 Свойства алгоритма
2 Программная реализация алгоритма
2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
2.2 Локальность данных и вычислений
2.2.1 Локальность реализации алгоритма
2.2.1.1 Структура обращений в память и качественная оценка локальности
2.2.1.2 Количественная оценка локальности
2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
2.4.1 Масштабируемость алгоритма
2.4.2 Масштабируемость реализации алгоритма
2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
2.6 Выводы для классов архитектур
2.7 Существующие реализации алгоритма
3 Литература
- MacQueen, James. "Some methods for classification and analysis of multivariate observations." Proceedings of the fifth Berkeley symposium on mathematical statistics and probability. Vol. 1. No. 14. 1967.
- Steinhaus, Hugo. "Sur la division des corp materiels en parties." Bull. Acad. Polon. Sci 1.804 (1956): 801.
- Lloyd, S. P. "Least square quantization in PCM. Bell Telephone Laboratories Paper. Published in journal much later: Lloyd, SP: Least squares quantization in PCM." IEEE Trans. Inform. Theor.(1957/1982).