Участник:Danyanya/Алгоритм Ланцоша для точной арифметики (без переортогонализации)
Алгоритм Ланцоша для точной арифметики (без переортогонализации) | |
Последовательный алгоритм | |
Последовательная сложность | [math]O(k*n^2)[/math] |
Объём входных данных | [math]\frac{n*(n + 1)}{2}[/math] |
Объём выходных данных | [math]k*(n + 1)[/math] |
Параллельный алгоритм | |
Высота ярусно-параллельной формы | [math]O(k* \log(n))[/math] |
Ширина ярусно-параллельной формы | [math]O(n^2)[/math] |
Основные авторы описания: Д.Р.Слюсарь (1.1, 1.2, 1.3, 1.4, 1.5, 1.6, 1.7, 2.7), М.А.Григорьев (1.2, 1.7, 1.8, 1.9, 2.7, 3)
Содержание
- 1 Свойства и структура алгоритма
- 1.1 Общее описание алгоритма
- 1.2 Математическое описание алгоритма
- 1.3 Вычислительное ядро алгоритма
- 1.4 Макроструктура алгоритма
- 1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
- 1.6 Последовательная сложность алгоритма
- 1.7 Информационный граф
- 1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
- 1.9 Входные и выходные данные алгоритма
- 1.10 Свойства алгоритма
- 2 Программная реализация алгоритма
- 2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
- 2.2 Локальность данных и вычислений
- 2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
- 2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
- 2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
- 2.6 Выводы для классов архитектур
- 2.7 Существующие реализации алгоритма
- 3 Литература
1 Свойства и структура алгоритма
1.1 Общее описание алгоритма
Алгоритм Ланцоша поиска собственных значений был опубликован Корнелием Ланцошем в 1950 году [1]. Этот итерационный алгоритм применим только к эрмитовым матрицам [math]A[/math]. Метод позволяет за [math]k[/math] итераций вычислять [math]k[/math]-ое приближение собственных значений и собственных векторов исходной матрицы [math]A[/math].
В данной статье рассмотрен упрощенный вариант алгоритма Ланцоша, подразумевающий отсутствие влияния ошибок округления на вычислительный процесс.
Данный алгоритм является неустойчивым, вследствие чего на практике применяется модифицированный алгоритм Ланцоша с полной переортогонализацией предложенный в 1970 Ojalvo и Newman[2].
1.2 Математическое описание алгоритма
На вход алгоритма подается эрмитова матрица [math]A = A^\dagger[/math] (в вещественном случае матрица симметрична) ,
- [math] A = \begin{pmatrix} a_{11} & a_{12} & a_{13} & \cdots & a_{1\ n-1} & a_{1\ n} \\ a_{12} & a_{22} & a_{23} & \cdots & a_{2\ n-1} & a_{2\ n} \\ a_{13} & a_{23} & a_{33} & \cdots & a_{3\ n-1} & a_{3\ n} \\ \vdots & \vdots & \ddots & \ddots & \ddots & \vdots \\ a_{1\ n-1} & \cdots & \cdots & a_{n-2\ n-1} & a_{n-1\ n-1} & a_{n-1\ n} \\ a_{1\ n} & \cdots & \cdots & a_{n-2\ n} & a_{n-1\ n} & a_{n\ n} \\ \end{pmatrix} [/math]
Алгоритм Ланцоша соединяет в себя метод Ланцоша построения крыловского подпространства с процедурой Релея-Ритца[1]. Иными словами, из оргонормированных векторов Ланцоша [3] на каждой итерации строится матрица [math]Q_k = [q_1, q_2, \dots, q_k][/math] размерности [math]n \times k[/math]. В качестве приближенных собственных значений матрицы [math]A[/math] берутся числа Ритца, т.е. собственные значения симметричной трехдиагональной матрицы [math]T_k = Q^T_k A Q[/math]:
[math] T_k = \begin{pmatrix} \alpha_1 & \beta_1 & 0 & \dots & 0 \\ \beta_1 & \alpha_2 & \beta_2 & \dots & 0 \\ 0 & \beta_2 & \ddots & \ddots & \vdots \\ \vdots & \vdots & \ddots & \ddots & \beta_{k-1} \\ 0 & \dots & \dots & \beta_{k-1} & \alpha_k \end{pmatrix} [/math]
На выходе алгоритма получается собственные векторы и вектор собственных значений матрицы [math]T_k[/math], с помощью которых и будет найдены искомые собственные векторы исходной матрицы [math]A[/math].
1.3 Вычислительное ядро алгоритма
Вычислительным ядром на каждой итерации является вычисление произведения исходной матрицы [math]A[/math] на вектор [math]q_i[/math] с предыдущей итерации
- [math]z = Aq_i[/math]
1.4 Макроструктура алгоритма
Исходя из предложенной последовательной реализации метода, макрооперациями в алгоритме являются:
- Процедура итеративного построения трехдиагональной симметричной матрицы, включающая:
- умножение матрицы на вектор (состоит из умножения вектора на число и сложения векторов);
- скалярное произведение векторов;
- линейная комбинация векторов (сложение/умножение на вещественные числа);
- вычисление нормы (скалярное произведение векторов и вычисление квадратного корня);
- Вычисление собственных значений и собственных векторов полученной в ходе работы трехдиагональной симметричной матрицы.
При этом, первая макрооперация (построение трехдиагональной матрицы) выполняется строго последовательно. Единственное, что можно распараллелить - это умножение матрицы на вектор. Однако это операция достаточно легковесная, если оперировать, например, разреженной матрицей.
Вычисление собственных значений полученной матрицы на практике выполняется с помощью QR-алгоритма и выходит за рамки описанного алгоритма.
1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
Исходные данные: симметричная матрица [math]A[/math], случайный вектор [math]b[/math].
Вычисляемые данные: собственные вектора матрицы [math]T_k[/math] являющиеся столбцами матрицы [math]Q_k V[/math], и матрица собственных значений [math]\Lambda[/math], где [math]V, \Lambda[/math] из спектрального разложения [math]T_k = V\Lambda V^T[/math].
Алгоритм [4] на псевдокоде:
[math] \begin{align} q_1 = & b/ \|b\|_2,\; \beta_0 = 0,\; q_0 = 0\\ for \; & i = 1 \; to \; k \\ & z = Aq_i\\ & \alpha_i = q^T_i z\\ & z = z - \alpha_i q_i - \beta_{i-1}q_{i-1}\\ & \beta_i = \|z\|_2\\ & If \; \beta_i == 0 \; then \\ & \; \; \; \; exit\\ & else \\ & \; \; \; \; q_{i+1} = z / \beta_i \\ end \; & for \end{align} [/math]
После этого вычисляются собственные значения и собственные вектора симметричной трехдиагональной матрицы [math]T_k[/math] наиболее удобным образом.
1.6 Последовательная сложность алгоритма
Последовательная сложность алгоритма рассчитана на основе приведенной выше реализации алгоритма. Исходя из псевдокода последовательно выполняются следующие операции:
- Умножение квадратной матрицы [math]n * n[/math] на вектор длины [math]n[/math]. Требует [math]n * n[/math] умножений и сложений;
- Скалярное произведение векторов длины [math]n[/math]. Требует [math]n[/math] умножений и сложений;
- Сложение векторов длины [math]n[/math]. Требует [math]n[/math] сложений;
- Умножение вектора длины [math]n[/math] на скаляр. Требует [math]n[/math] умножений;
- Нахождение квадратичной нормы вектора длины [math]n[/math]. Требует [math]n[/math] умножений и сложений + извлечения квадратного корня;
- Нахождение собственных значений и векторов трехдиагональной симметричной матрицы размера [math] k \times k [/math]. Наиболее эффективный метод метода «Разделяй-и-властвуй» в среднем требует [math]~O(k^{2.3})[/math] операций.
Суммарное число операций в алгоритме без учета вычисления собственных значений в трехдиагональной памяти:
- [math] k*n^2 + n * (4 * k + 1) [/math] операций умножения;
- [math] k*(n^2+3*n-2) + n-1[/math] операций сложения/вычитания;
- [math] n*(k + 1) [/math] операций деления;
- [math] k + 1 [/math] операций вычислений квадратного корня.
Таким образом, в худшем случае, алгоритм Ланцоша имеет сложность [math] O(k * n^2) [/math] и односится к квадратичным алгоритмам.
1.7 Информационный граф
Информационный граф алгоритма можно разбить на две части:
- Граф алгоритма с отображением входных и выходных данных.
- Граф линейного оператора.
1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
Важно заметить, что итерации алгоритма выполняются строго последовательно, а распараллеливание возможно только внутри итераций.
- Умножение [math]A^{n * n}[/math] на вектор длины [math]n[/math] требует [math]n[/math] ярусов умножений и сложенийж
- При этом сложение элементов вектора длины [math]n[/math] можно выполнить за [math]\log(n)[/math] [2];
- Остальные операции в рамках итерации выполняются последовательно (вычисление значений векторов может быть выполнено за 1 ярус):
- Ресурс параллелизма алгоритма вычисления собственных значений зависит от используемого алгоритма.
Исходя из вышеизложенного, алгоритм Ланцоша обладает [math]O(k * \log n)[/math]-ой сложностью по высоте ЯПФ и [math]O(n^2)[/math]-ой по ширине ЯПФ.
1.9 Входные и выходные данные алгоритма
Входные данные: симметричная вещественная матрица [math]A[/math], случайный вектор [math]b[/math], число итераций [math]k[/math].
Объём входных данных: [math]n * (n + 1) + 1 [/math].
Выходные данные: вектор собственных значений [math]\Lambda[/math], матрица собственных векторов [math]E[/math].
Объём выходных данных: [math]k * (n + 1)[/math].
1.10 Свойства алгоритма
- Сложность последовательного алгоритма [math]O(k*n^2)[/math];
- По классификации по высоте ЯПФ Алгоритм Ланцоша является алгоритмом со сложностью [math]O(k * \log n)[/math], при классификации по ширине ЯПФ его сложность [math]O(n^2)[/math];
- Таким образом, отношение последовательной сложности к параллельной [math]\frac{kn^2}{k \log{n}}[/math];
- Вычислительная мощность алгоритма Ланцоша без переортогонализации из последовательной сложности алгоритма [math]\frac{k*(2*n^2+8*n-1)+3*n}{n^2+2*k}[/math]. При [math]k[/math] много меньше [math]n[/math] вычислительная мощность ≈ [math] 2*k[/math];
- Алгоритм Ланцоша без переортогонализации не является детерминированным из-за того, что возможно выполнение меньшего числа итераций алгоритма, из-за того, что все собственные значения уже вычислены;
- Также алгоритм Ланцоша быстро сходится при вычислении собственных значений матрицы [math]A[/math], находящихся на границе ее спектра (в [math]T_{j}[/math] в первую очередь появляются максимальные по модулю собственные значения);
- Из-за использования точной арифметики алгоритм Ланшоца может найти кратные собственные значения, которые на деле оными не являются;
- Нестабильность алгоритма (эффект ложной сходимости) присуще плавающей арифметике, из-за ошибок округления в которой на очередном этапе может быть построен линейно зависимый от исходных новый вектор, что повлечет невозможность дальнейшего приближения собственных значений.
2 Программная реализация алгоритма
2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
2.2 Локальность данных и вычислений
2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
Для исследования масшабируемости алгоритма была написана реализация[3] на языке C++ с использованием MPI. Реализация была протестирована на суперкомпьютере Ломоносов[4].
Были исследованы:
- время выполнения программы в зависимости от размера входных данных (матрицы);
- время выполнения в зависимости от размера параллельных нод.
Дополнительно было измерено время работы исходя из оптимизационных флагов компилятора GCC [5].
Параметры запуска алгоритма:
- размер матрицы от 20000 до 150000 с шагом 2500;
- количество процессоров от 8 до 128 с шагом 8.
На рисунке 2.4.1 ...
На рисунке 2.4.2 ...
Как видно из графиков выше,
2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
2.6 Выводы для классов архитектур
2.7 Существующие реализации алгоритма
В настоящее время существует множество реализаций алгоритма Ланцоша итеративного поиска собственных значений, как входящих в официальные дистрибутивы для вычислений (ARPACK), так и неофициальных реализаций, выложенных на Github. Среди них:
1. The IETL Project [5]
2. MatLab [6]
3. ARPACK [7]
4. Julia Math [8]
Также существуют официальные реализации на других языках (например R).
Что касается встроенной возможности параллелизма - самыми стабильными в этом плане являются ARPACK, а также IETL.
3 Литература
- ↑ Lanczos, C. "An iteration method for the solution of the eigenvalue problem of linear differential and integral operators", J. Res. Nat’l Bur. Std. 45, 255-282 (1950).
- ↑ Ojalvo, I.U. and Newman, M., "Vibration modes of large structures by an automatic matrix-reduction method", AIAA J., 8 (7), 1234–1239 (1970).
- ↑ https://ru.wikipedia.org/wiki/Биортогонализация_Ланцоша
- ↑ Деммель Д. Вычислительная линейная алгебра
- ↑ http://www.comp-phys.org/software/ietl/
- ↑ https://www.mathworks.com/matlabcentral/newsreader/view_thread/10554
- ↑ http://www.caam.rice.edu/software/ARPACK/
- ↑ https://github.com/JuliaMath/IterativeSolvers.jl