Участник:Александр Куваев/Алгоритм кластеризации, основанный на максимизации ожидания
Авторы описания: Куваев А.С. и Щенявская Е.В.
Содержание
- 1 Свойства и структура алгоритмов
- 1.1 Общее описание алгоритма
- 1.2 Математическое описание алгоритма
- 1.3 Вычислительное ядро алгоритма
- 1.4 Макроструктура алгоритма
- 1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
- 1.6 Последовательная сложность алгоритма
- 1.7 Информационный граф
- 1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
- 1.9 Входные и выходные данные алгоритма
- 1.10 Свойства алгоритма
- 2 Программная реализация алгоритма
- 2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
- 2.2 Локальность данных и вычислений
- 2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
- 2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
- 2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
- 2.6 Выводы для классов архитектур
- 2.7 Существующие реализации алгоритма
- 3 Литература
1 Свойства и структура алгоритмов
1.1 Общее описание алгоритма
Задача кластеризации заключается в разбиении входного множества объектов на непересекающиеся подмножества, называемые кластерами, так, чтобы каждый кластер состоял из схожих объектов, а объекты разных кластеров существенно отличались друг от друга.
Решение этой задачи принципиально неоднозначно по следующим причинам:
- результат кластеризации зависит от способа задания меры сходства объектов выборки
- не существует однозначно наилучшего критерия качества кластеризации
- число кластеров, как правило, неизвестно заранее и задается из некоторых априорных соображений (хотя существуют алгоритмы, способные определять число кластеров автоматически)
По описанной выше причине существует большое число алгоритмов кластеризации, приводящих к различным разбиениям исходного множества объектов. На этой странице представлено описание одного из таких методов — EM-алгоритма. EM-алгоритм опирается на предположение о вероятностной природе данных: элементы выборки получены случайно и независимо из смеси распределений с фиксированным числом компонент [math]k[/math]. Таким образом, плотность распределения на множестве объектов имеет следующий вид:
- [math]p(x)=\sum_{j=1}^{k}w_{j}p_{j}(x), \ \sum_{j=1}^{k}w_{j}=1, \ w_{j} \ge 0 [/math], где [math]p_{j}[/math] - плотность распределения [math]j[/math]-й компоненты смеси (кластера).
Везде в дальнейшем будем предполагать, что [math]p_{j}[/math] имеют вид многомерных нормальных плотностей с произвольной матрицей ковариации: смеси нормальных распределений позволяют аппроксимировать произвольные непрерывные функции плотности с наперед заданной точностью. Результатом работы EM-алгоритма являются оценки априорных вероятностей компонент смеси [math]w_{j}[/math], а также оценки векторов математических ожиданий и матриц ковариации для каждой компоненты. Зная параметры распределения смеси, каждому наблюдению будет сопоставляться тот кластер, вероятность принадлежности к которому будет максимальной.
EM-алгоритм позволяет значительно упростить задачу максимизации правдоподобия выборки путем искусственного введения вспомогательной матрицы скрытых переменных [math]G[/math]. Алгоритм заключается в последовательном повторении шагов E(expectation) и M(maximization):
- На шаге E на основе текущего приближения параметров смеси по формуле Байеса вычисляются ожидаемые значения скрытых переменных [math]g_{ij}[/math] — апостериорные вероятности того, что [math]i[/math]-й объект принадлежит кластеру [math]j[/math].
- На шаге M решается задача максимизации правдоподобия для нахождения следующего приближения параметров смеси на основе текущего приближения и матрицы скрытых переменных, при этом решение этой задачи выписывается в явном виде.
1.2 Математическое описание алгоритма
Пусть заданы [math]l[/math] объектов [math]x_{1},\dotsc,x_{l}[/math], каждый из которых описывается [math]n[/math] числовыми признаками. Таким образом, определена матрица объектов-признаков [math]X \in \R^{l \times n}.[/math] Предполагается, что объекты выбраны случайно и независимо из смеси [math]n[/math]-мерных нормальных распределений с фиксированным числом компонент [math]k[/math]. Плотность распределения на множестве объектов имеет вид:
- [math]p(x)=\sum_{j=1}^{k}w_{j}p_{j}(x), \ \sum_{j=1}^{k}w_{j}=1, \ w_{j} \ge 0 [/math], где [math]p_{j}[/math] - плотность распределения [math]j[/math]-й компоненты смеси.
Каждая компонента смеси описывается [math]n[/math]-мерным вектором математических ожиданий [math]\mu_{j}[/math] и матрицей ковариации [math]\Sigma_{j}[/math] порядка [math]n[/math], [math]j = 1,\dotsc,k[/math].
Исходные данные: матрица объектов-признаков [math]X[/math], число кластеров [math]k[/math], максимальное число итераций [math]imax[/math], минимальная величина изменения логарифма правдоподобия [math]\varepsilon[/math].
Вычисляемые данные: набор оценок весов, математических ожиданий и ковариационных матриц компонент смеси [math]\theta = (w_{1},...,w_{k}; \; \mu_{1},...,\mu_{k}; \; \Sigma_{1},...,\Sigma_{k})[/math], максимизирующий правдоподобие выборки.
Структура алгоритма:
- Инициализация параметров: существует большое число вариантов инициальзации параметров распределения. Один из возможных подходов — задание векторов математических ожиданий компонент случайными элементами выборки, задание матриц ковариации единичными матрицами и задание весов компонент равными [math]\frac{1}{k}.[/math]
- Последовательное выполнение шагов E и M до тех пор, пока правдоподобие выборки не стабилизируется или не будет достигнуто максимальное число итераций:
- Шаг E: вычисление значений скрытых переменных по формуле Байеса:
- [math]g_{ij} = \frac{w_{j} p_{j}(x_{i})}{\sum_{s=1}^{k} w_{s} p_{s}(x_{i})}[/math] , где [math]p_{j}(x_{i}) = \frac{1}{(2\pi)^{n/2}\sqrt{|\Sigma_{j}|}} \exp \biggl( -\frac{1}{2}(x_{i} - \mu_{j})^{T} \Sigma_{j}^{-1} (x_{i} - \mu_{j}) \biggr), \ i = 1,\dotsc,l; \ j = 1,\dotsc,k [/math]
- Шаг M: перерасчет параметров смеси на основе текущего приближения и матрицы скрытых переменных:
- [math]w_{j} = \frac{1}{l} \sum_{i=1}^{l} g_{ij}, \ j = 1,\dotsc,k;[/math]
- [math]\mu_{j} = \frac{1}{l w_{j}} \sum_{i=1}^{l} g_{ij} x_{i}, \ j = 1,\dotsc,k;[/math]
- [math]\Sigma_{j} = \frac{1}{l w_{j}} \sum_{i=1}^{l} g_{ij}(x_{i} - \mu_{j})(x_{i} - \mu_{j})^T, \ j = 1,\dotsc,k.[/math]
1.3 Вычислительное ядро алгоритма
Вычислительное ядро EM-алгоритма — процедура последовательного выполнения шагов E и M:
- На шаге E на основе текущего приближения параметров смеси вычисляются ожидаемые значения скрытых переменных
- На шаге M вычисляется следующее приближение параметров смеси на основе текущего приближения и матрицы скрытых переменных
Наиболее трудоемкой операцией с вычислительной точки зрения является шаг E, в ходе которого производится обращение ковариационных матриц, вычисление их определителей, а также многократное перемножение векторов и матриц при вычислении скрытых переменных.
1.4 Макроструктура алгоритма
Алгоритма состоит из двух итерационно проводимых макроопераций: E-шага и M-шага.
В ходе E-шага используется:
- Обращение ковариационной матрицы и вычисление ее определителя
- Умножение вектор-строки на матрицу и вектор-строки на вектор-столбец
В ходе M-шага используется:
- Умножение вектор-столбца на вектор-строку
- Взвешенное суммирование векторов и матриц
1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
- Для всех [math]j = 1,\dotsc,k[/math]:
- Инициализировать [math]w_{j}, \ \mu_{j}, \ \Sigma_{j}[/math]
- Для всех [math]iter = 1,\dotsc,imax[/math]:
- Шаг E:
- Для всех [math]j = 1,\dotsc,k[/math]:
- Вычислить [math]|\Sigma_{j}|, \ \Sigma_{j}^{-1}[/math]
- Для всех [math]i = 1,\dotsc,l[/math]:
- [math]sum = 0[/math]
- Для всех [math]j = 1,\dotsc,k[/math]:
- Вычислить [math]p_{j}(x_{i}) = \frac{1}{(2\pi)^{n/2}\sqrt{|\Sigma_{j}|}} \exp \biggl( -\frac{1}{2}(x_{i} - \mu_{j})^{T} \Sigma_{j}^{-1} (x_{i} - \mu_{j}) \biggr)[/math]
- [math]sum = sum + w_{j}p_{j}(x_{i})[/math]
- Для всех [math]j = 1,\dotsc,k[/math]:
- Вычислить [math]g_{ij} = \frac{w_{j} p_{j}(x_{i})}{sum}[/math]
- Для всех [math]j = 1,\dotsc,k[/math]:
- Шаг M:
- Для всех [math]j = 1,\dotsc,k[/math]:
- Вычислить [math]w_{j} = \frac{1}{l} \sum_{i=1}^{l} g_{ij}[/math]
- Вычислить [math]\mu_{j} = \frac{1}{l w_{j}} \sum_{i=1}^{l} g_{ij} x_{i}[/math]
- Вычислить [math]\Sigma_{j} = \frac{1}{l w_{j}} \sum_{i=1}^{l} g_{ij}(x_{i} - \mu_{j})(x_{i} - \mu_{j})^T[/math]
- Для всех [math]j = 1,\dotsc,k[/math]:
- Вычислить изменения логарифма правдоподобия [math]\Delta[/math]
- Если [math]\Delta \lt \varepsilon[/math], то досрочно выйти из цикла
- Шаг E:
- Вернуть [math]w_{j}, \mu_{j}, \Sigma_{j}, \ j = 1,\dotsc,k.[/math]
1.6 Последовательная сложность алгоритма
1.7 Информационный граф
1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
1.9 Входные и выходные данные алгоритма
Входные данные: плотная матрица объектов-признаков [math]X \in \R^{l \times n}[/math], число кластеров [math]k[/math], максимальное число итераций [math]imax[/math], минимальная величина изменения логарифма правдоподобия [math]\varepsilon[/math].
Объём входных данных: [math]ln + 3[/math]
Выходные данные: вещественный вектор весов [math]w \in \R^{k}[/math], [math]k[/math] вещественных векторов математических ожиданий [math]\mu_{j} \in \R^{n}[/math] и [math]k[/math] вещественных ковариационных матриц [math]\Sigma_{j} \in \R^{n \times n}[/math].
Объём выходных данных: [math]k(n^{2}+n+1)[/math]