Уровень алгоритма

Участник:Timokhinivan/Быстрое преобразование Фурье: различия между версиями

Материал из Алговики
Перейти к навигации Перейти к поиску
Строка 249: Строка 249:
 
=== TODO Выводы для классов архитектур ===
 
=== TODO Выводы для классов архитектур ===
 
=== TODO Существующие реализации алгоритма ===
 
=== TODO Существующие реализации алгоритма ===
 +
 +
Алгоритм быстрого преобразования Фурье относится к базовым алгоритмам вычислительной математики, а потому его реализации существуют во многих библиотеках.  Перечислим некоторые из них:
 +
 +
* [//software.intel.com/en-us/intel-mkl Intel® Math Kernel Library] — содержит в том числе и кластерную версию.  Имеет интерфейсы для C, C++ и Fortran.
 +
* [http://www.fftw.org FFTW] — содержит распределённую реализацию начиная с версии 3.3.  Имеет интерфейсы для C и Fortran.
 +
* [//www.gnu.org/software/gsl GNU Scientific Library] — имеет интерфейс для C.
 +
* [//developer.nvidia.com/cufft cuFFT] — реализация алгоритма для GPU от NVIDIA.
 +
* [http://gpuopen.com/compute-product/clfft clFFT] — реализация алгоритма на OpenCL для CPU и GPU.  Поддерживает <math>N = 2^p 3^q 5^r 7^s</math>
 +
 
== TODO Литература ==
 
== TODO Литература ==

Версия 21:25, 9 октября 2016

Warning sign font awesome.svg Данная страница в настоящее время активно редактируется участником Timokhinivan (обсуждение).
Пожалуйста, не вносите в неё никаких изменений до тех пор, пока не исчезнет это объявление. В противном случае могут возникнуть конфликты редактирования.



Быстрое преобразование Фурье
Последовательный алгоритм
Последовательная сложность [math]O(N \log N)[/math]
Объём входных данных [math]N[/math]
Объём выходных данных [math]N[/math]
Параллельный алгоритм
Высота ярусно-параллельной формы [math]O(\log N)[/math]
Ширина ярусно-параллельной формы [math]O(N)[/math]


Содержание

1 Свойства и структура алгоритмов

1.1 Общее описание алгоритма

Преобразование Фурье переводит сигнал в его спектр и обратно, и широко применяется в самых различных областях вычислительной математики — собственно спектральный анализ, сжатие данных, вычисление свёрток и т.д. В связи с этим, особый интерес представляют быстры алгоритмы для вычисления этого преобразование. На сегодняшний день, наилучшие из них имеют сложность [math]O(n \log n)[/math].

1.2 Математическое описание алгоритма

Преобразование Фурье задаётся следующей формулой:

[math] Y_k = \sum_{l = 0}^{N-1} X_l \epsilon^{kl}_N,\qquad k = \overline{0,N-1} [/math]

где [math]\epsilon_N = e^{\frac{2i\pi}{N}}[/math] — первообразный корень из 1 степени [math]N[/math].

Таким образом, преобразование Фурье является линейным и задаётся матрицей [math]F = \left\{ \epsilon^{kl}_N \right\}_{k\,l = 0}^{N-1}[/math].

1.2.1 Многомерное преобразование Фурье

Естественным обобщением описанного одномерного преобразования Фурье является многомерный вариант:

[math] X(l_1,\cdots,l_d) = \sum_{k_1 = 0}^{N_1} \cdots \sum_{k_d = 0}^{N_d} Y(k_1,\cdots,k_d) \prod_{j=1}^{d} \epsilon_{N_j}^{l_j k_j} [/math]

Многомерное преобразование Фурье эквивалентно последовательному выполнению одномерных преобразований по каждому измерению; при использовании для этого рекурсивного алгоритма, общая сложность вычислений также составляет [math]O(N\log N)[/math], [math]N = \prod_{j=1}^d N_j[/math].

1.2.2 Сведение к двумерному преобразованию

Если [math]N[/math] — составное, т.е. [math]N = mn[/math], то возможно существенно сократить вычислительные расходы за счёт сведение к двумерному преобразованию Фурье. А именно, положим [math]X(l_1, l_2) = X_{l_1 n + l_2}[/math], [math] Y(k_1, k_2) = Y_{k_1 m + k_2}[/math], где [math]l_1, k_2 = \overline{0, m-1}[/math], [math]l_2, k_1 = \overline{0, n-1}[/math].

В этом случае

[math] \begin{align} Y(k_1, k_2) &=& \sum_{l_2=0}^{n-1} (\epsilon^{k_2 l_2}_N \hat{X}(k_2, l_2)) \epsilon^{k_1 l_2}_n \\ \hat{X}(k_2, l_2) &=& \sum_{l_1=0}^{m-1} X(l_1, l_2) \epsilon^{k_2 l_1}_m \end{align} [/math]

Это даёт следующий алгоритм вычисления преобразования:

  1. Записываем исходный вектор в матрицу [math]m\times n[/math] по строкам.
  2. Применяем к каждому столбцу преобразование Фурье.
  3. Умножаем элемент в позиции [math](i,j)[/math] на [math]\epsilon^{ij}_N[/math].
  4. Применяем к каждой строке преобразование Фурье.
  5. Результат записан в получившейся матрице по столбцам.

Данный алгоритм уже даёт существенный выигрыш по сравнению с обычным умножением матрицы на вектор: [math] O(m^2 n + n^2 m) [/math] против [math]O(m^2 n^2)[/math]. Однако наилучших результатов можно добиться, если применять этот алгоритм рекурсивно на этапах 2 и 4.

Так, если [math]N = \prod_{i=1}^{K} p_i[/math], то целесообразно на каждом уровне рекурсии «отщеплять» одно [math]p_i[/math]. В этом случае задача сводится к вычислению [math] \prod_{i\neq j} p_i [/math] преобразований Фурье порядка [math]p_j[/math] для всех [math]j[/math]. При небольших [math]p_i[/math] (например, 2), это можно проделывать «в лоб».

1.2.3 TODO Преобразование Фурье с большим простым порядком

1.3 Вычислительное ядро алгоритма

На каждом уровне рекурсии наиболее дорогостоящими этапами являются рекурсивные вызовы преобразования Фурье: они требуют в сумме [math]O(mn (\log m + \log n))[/math] операций против [math]O(mn)[/math] для умножения на поправочные коэффициенты (шаг 3).

То же верно и для алгоритма в целом в случае [math]N = \prod_{i=1}^{K} p_i[/math]; а именно, суммарно наибольшие вычислительные затраты связаны с вычислением преобразований Фурье порядка [math]p_i[/math].

1.4 Макроструктура алгоритма

Фактически, макроструктура алгоритма уже описана в разделе математического описания. На каждом уровне рекурсии, алгоритм состоит из

  1. [math]n[/math] рекурсивных вызовов алгоритма.
  2. Умножение всех элементов рабочего вектора на поправочные коэффициенты.
  3. Ещё [math]m[/math] рекурсивных вызовов.

1.5 Схема реализации последовательного алгоритма

Псевдокод:

fft(X, N)
begin
  (m, n) = factor(N)

  if (n == 1) // Предполагается, что n <= m
    direct_fft(X, N) // Через умножение на матрицу

  // 1
  transpose(X, m, n) //Транспонирует X как матрицу m x n, хранящуюся по строкам
   
  // 2
  do i = 0, n - 1
    fft(X(i * m : (i + 1) * m - 1), m)

  // 3
  do i = 0, n - 1
    do j = 0, m - 1
      X(i * m + j) *= eps(i * j, N)

  // 4
  transpose(X, n, m)

  // 5
  do j = 0, m - 1
    fft(X(j * n : (j + 1) * n - 1), n)

  // 6
  transpose(X, m, n)
end

Здесь eps может как вычислять соответствующие коэффициенты, так и брать их из заранее заготовленной таблицы. Последний способ требует увеличения затрат по памяти, но позволяет существенно сэкономить на вычислениях, а потому является предпочтительным.

Кроме того, шаги 3 и 4 можно переставлять произвольным образом (с очевидными изменениями в шаге 3).

Особо следует отметить, что если порядок элементов в выходном массиве не важен, шаг 6 можно пропустить.

Так, например, если преобразование Фурье используется для вычисления свёртки векторов, то конкретный порядок элементов в их образах Фурье совершенно не важен, лишь бы он был одинаков для обоих векторов. В этом случае в прямом преобразовании можно опустить шаг 6, а в обратном — 1.

1.6 Последовательная сложность алгоритма

Непосредственно из описания алгоритма получаем, что если сложность вычисления преобразования Фурье обозначить [math]f_N[/math], то [math]f_{mn} = n f_{m} + m f_{n} + mn[/math].

Если [math]N = \prod_{i=1}^K p_i[/math], и на каждом шаге «отщеплять» от него одно [math]p_i[/math], а преобразование Фурье для [math]p_i[/math] вычислять «в лоб», то общее количество операций составит [math]O\left(N\sum_{i=1}^K p_i\right)[/math].

В частности, если [math]p_i \leq P[/math], то [math]K \leq \log_P N[/math] и для сложности получаем [math]O(NP\log_P N)[/math]. Полагая [math]P[/math] фиксированным, получаем заявленную сложность [math]O(N \log N)[/math].

1.7 Информационный граф

Рисунок 1. Информационный граф алгоритма для [math]N = 15[/math]. Исходные данные обозначены фиолетовым, результат — красным. Преобразования Фурье для [math]m = 5[/math] и [math]n = 3[/math] представлены как «чёрные ящики». Умножение на дополнительные коэффициенты представлено оранжевыми узлами.

Каждый уровень рекурсивного вызова состоит из трёх этапов: рекурсивный вызов по столбцам, умножение на поправочные коэффициенты и рекурсивного вызова по строкам. Таким образом для высоты ЯПФ имеем

[math] h(mn) = 1 + h(m) + h(n) [/math]

Для «элементарных» БПФ высота ЯПФ будет та же, что и для умножения матрицы на вектор.

Таким образом, с учётом разложения [math]N[/math], [math]h(N) = O\left(\sum_{i=1}^K p_i\right) = O(P \log_P N) = O(\log N)[/math].

1.8 Ресурс параллелизма алгоритма

Поскольку все рекурсивные вызовы преобразования Фурье на каждом из этапов совершенно независимы, кажется естественным распределить их по доступным вычислительным узлам. Умножение на поворотные коэффициенты при этом и вовсе выполняется независимо на каждом элементе рабочего вектора, и может быть беспрепятственно присоединёно к любому из этапов.

При этом, в отличие от традиционной реализации типа Кули-Тьюки, в которой на каждом этапе один из множителей берётся малым, при параллельной реализации целесообразно взять и [math]m[/math] и [math]n[/math] по возможности близкими к кратным доступному количеству вычислительных узлов, поскольку в этом случае возможно равномерно распределить работу между ними и реализовать весь алгоритм всего с одной внутренней пересылкой.

1.9 Входные и выходные данные алгоритма

В общем случае на входе и на выходе имеются комплексные векторы порядка [math]N[/math]. Однако в частных случаях, возможны более компактные представления для параметров и результатов.

Для описания этих случаев нам понадобится матрица

[math] Q = \begin{bmatrix} 1 & & & & & \\ & & & & & 1 \\ & & & & 1 & \\ & & & \cdots & & \\ & & 1 & & & \\ & 1 & & & & \end{bmatrix} [/math]
  1. Если [math]X[/math] — вещественный, то [math]Y = Q\bar{Y}[/math].
  2. Если [math]X[/math] — чисто мнимый, то [math]Y = -Q\bar{Y}[/math].
  3. Если [math]X = Q\bar{X}[/math], то [math]Y[/math] — вещественный.
  4. Если [math]X = -Q\bar{X}[/math], то [math]Y[/math] — чисто мнимый.

В каждом случае, [math]X[/math] и [math]Y[/math] требуют для своего хранения в два раза меньше памяти, чем в общем случае.

Таким образом, при наличии дополнительной информации о входном векторе, возможно сократить объём памяти используемый для хранения входных и выходных данных.

1.10 Свойства алгоритма

Обозначая матрицу преобразования [math]F[/math], имеем:

  1. [math]F = F^T[/math]
  2. [math]F^{-1} = \tfrac{1}{N} F^*[/math]
  3. [math]F^* = QF [/math]

Свойство 2 представляет особый интерес, поскольку позволяет вычислять обратное преобразование Фурье по тем же алгоритмам, что и прямое, поскольку [math]F^*[/math] представляет собой матрицу того же вида, что и [math]F[/math], но с [math]\bar{\epsilon}[/math] вместо [math]\epsilon[/math]. В сущности, свойство 3 позволяет свести задачу к исходной непосредственно, но ценой дополнительных пересылок.

Кроме того, из второго свойства следует

[math] \|F x\|_2 = \sqrt{N} \|x\|_2 [/math]

2 Программная реализация алгоритма

2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма

При реализации последовательной версии алгоритма (а равно и параллельной, поскольку на определённом уровне рекурсии алгоритм всё равно будет выполняться на каждом узле независимо) стоит иметь ввиду несколько вещей:

2.1.1 Поворотные коэффициенты

Как уже упоминалось, поворотные коэффициенты имеет смысл вычислить заранее и хранить в специальном массиве. Отдельное внимание при этом стоит обратить на передачу этого массива в рекурсивные вызовы.

В самом деле, поскольку [math]\epsilon^{l}_{n} = \epsilon^{lm}_{mn} = \epsilon^{lm}_{N}[/math], все необходимые рекурсивному вызову значения поворотных коэффициентов уже имеются в используемом в текущем вызове массиве, а потому его достаточно подготовить один раз на весь алгоритм.

Более того, если планируется вычисление множества преобразований Фурье одинакового порядка, целесообразно использовать один и тот же массив во всех случаях, и тем самым существенно сэкономить на вычислениях.

2.1.2 Нерекурсивный случай

На нижнем уровне рекурсии преобразование Фурье вычисляется путём умножения на матрицу. Поскольку этот алгоритм, вообще говоря, более пригоден для векторизации, чем рекурсивная реализация, имеет смысл не разбивать [math]N[/math] на совсем мелкие множители ([math]p_i \equiv 2[/math] в алгоритме Кули-Тьюки) а останавливаться на преобразованиях несколько большего порядка; конкретный уровень зависит от конкретной реализации и архитектуры и должен быть установлен экспериментально.

2.1.3 Пересылки

Теоретически, возможна реализация алгоритма совсем без пересылок, если предполагать, что алгоритм оперирует «разреженным» вектором, элементы которого расположены с некоторым шагом по памяти. Однако ценой такой экономии будет существенно худшая локальность обращений к данным в рекурсивных вызовах. По-видимому, выбор нужно опять-таки осуществлять экспериментально.

Эти соображения в равной степени относятся как к рабочему массиву, так и к массиву поворотных коэффициентов.

2.2 TODO Локальность данных и вычислений

2.3 TODO Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма

2.4 TODO Масштабируемость алгоритма и его реализации

2.5 TODO Динамические характеристики и особенности реализации алгоритма

2.6 TODO Выводы для классов архитектур

2.7 TODO Существующие реализации алгоритма

Алгоритм быстрого преобразования Фурье относится к базовым алгоритмам вычислительной математики, а потому его реализации существуют во многих библиотеках. Перечислим некоторые из них:

  • Intel® Math Kernel Library — содержит в том числе и кластерную версию. Имеет интерфейсы для C, C++ и Fortran.
  • FFTW — содержит распределённую реализацию начиная с версии 3.3. Имеет интерфейсы для C и Fortran.
  • GNU Scientific Library — имеет интерфейс для C.
  • cuFFT — реализация алгоритма для GPU от NVIDIA.
  • clFFT — реализация алгоритма на OpenCL для CPU и GPU. Поддерживает [math]N = 2^p 3^q 5^r 7^s[/math]

3 TODO Литература