Участник:Janyell/Хранение ненулевых элементов разреженной матрицы. Умножение разреженной матрицы на вектор
Авторы страницы: Сычева Е.А и Хахалин А.С.
Содержание
- 1 Свойства и структура алгоритмов
- 1.1 Общее описание алгоритма
- 1.2 Математическое описание алгоритма
- 1.3 Вычислительное ядро алгоритма
- 1.4 Макроструктура алгоритма
- 1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
- 1.6 Последовательная сложность алгоритма
- 1.7 Информационный граф
- 1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
- 1.9 Входные и выходные данные алгоритма
- 1.10 Свойства алгоритма
- 2 Программная реализация алгоритма
- 2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
- 2.2 Локальность данных и вычислений
- 2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
- 2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
- 2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
- 2.6 Выводы для классов архитектур
- 2.7 Существующие реализации алгоритма
- 3 Литература
1 Свойства и структура алгоритмов
1.1 Общее описание алгоритма
Разреженная матрица — матрица с большим количеством нулевых элементов.
Среди специалистов нет единства в определении того, какое именно количество ненулевых элементов делает матрицу разреженной. Матрицу порядка [math]n[/math] называют разреженной, если число ее ненулевых элементов [1]:
- есть [math]O(n)[/math]. Приведенное определение полезно только для теоретических целей типа попытки оценить асимптотическое поведение алгоритма.
- ограничено в строке, в типичном случае от 2 до 10.
- выражается как [math]n^{1+\gamma}[/math], где [math]\gamma \lt 1[/math].
- таково, что для данной матрицы, данного алгоритма и данной вычислительной машины имеет смысл извлекать выгоду из наличия в ней многих нулей.
Всякую разреженную матрицу можно обрабатывать так, как если бы она была плотной: напротив, всякую плотную, или заполненную, матрицу можно обрабатывать алгоритмами для разреженных матриц. В обоих случаях получатся правильные численные результаты, но вычислительные затраты возрастут. Приписывание матрице свойства разреженности эквивалентно утверждению о существовании алгоритма, использующего ее разреженность и делающего вычисления с ней дешевле по сравнению со стандартными алгоритмами.
Три основных идеи, которые направляли развитие большей части технологии разреженных матриц:
- хранить только ненулевые элементы. Разреженная матрица, будучи множеством чисел, не имеющим регулярности, не может быть представлена в памяти машины тем же простым способом, что и полная матрица. Поэтому возникает необходимость дополнительно хранить индексную информацию, указывающую расположение каждого элемента в регулярном массиве.
- оперировать только с ненулевыми элементами. Число операций, производимых машиной при исполнении алгоритма, пропорционально числу ненулевых элементов, а не числу всех элементов матрицы.
- сохранять разреженность. Хороший алгоритм для разреженных матриц пытается сохранить разреженность, по возможности уменьшая заполнение.
Однако многие схемы хранения допускают определенную долю нулей, и алгоритм обрабатывает их, как если бы они не были нулями. Алгоритм, хранящий и обрабатывающий меньшее число нулей, более сложен, труднее программируется и целесообразен только для достаточно больших матриц.
1.2 Математическое описание алгоритма
1.3 Вычислительное ядро алгоритма
1.4 Макроструктура алгоритма
1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
1.6 Последовательная сложность алгоритма
1.7 Информационный граф
1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
1.9 Входные и выходные данные алгоритма
1.10 Свойства алгоритма
2 Программная реализация алгоритма
2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
2.2 Локальность данных и вычислений
2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
2.6 Выводы для классов архитектур
2.7 Существующие реализации алгоритма
Для вычислений с разреженными матрицами создано несколько библиотек:
- SparseLib++ (C++)
- uBLAS (C++, в составе Boost)
- SPARSPAK (Fortran)
- CSparse (C)
и другие.
3 Литература
<references \>
- ↑ С.Писсанецки. Технология разреженных матриц. - М.: Мир, 1988