Участник:Galkina/Метод Якоби вычисления собственных значений симметричной матрицы
Эта работа ждет рассмотрения преподавателем Дата последней правки страницы: 15.10.2016 Авторы этой статьи считают, что задание выполнено. |
Метод Якоби вычисления собственных значений симметричной матрицы | |
Последовательный алгоритм | |
Последовательная сложность | [math]O(n^3)[/math] |
Объём входных данных | [math]\frac{n (n + 1)}{2}[/math] |
Объём выходных данных | [math]n[/math] |
Параллельный алгоритм | |
Высота ярусно-параллельной формы | [math]O(n^2)[/math] |
Ширина ярусно-параллельной формы | [math]O(n)[/math] |
Авторы описания: А.С.Галкина, И.А.Плахов
Содержание
- 1 Свойства и структура алгоритма
- 1.1 Общее описание алгоритма
- 1.2 Математическое описание алгоритма
- 1.3 Вычислительное ядро алгоритма
- 1.4 Макроструктура алгоритма
- 1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
- 1.6 Последовательная сложность алгоритма
- 1.7 Информационный граф
- 1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
- 1.9 Входные и выходные данные алгоритма
- 1.10 Свойства алгоритма
- 2 Программная реализация алгоритма
- 2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
- 2.2 Локальность данных и вычислений
- 2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
- 2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
- 2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
- 2.6 Выводы для классов архитектур
- 2.7 Существующие реализации алгоритма
- 3 Литература
1 Свойства и структура алгоритма
1.1 Общее описание алгоритма
Метод Якоби — итерационный алгоритм для вычисления собственных значений и собственных векторов вещественной симметричной матрицы. Карл Густав Якоб Якоби, в честь которого назван этот метод, предложил его в 1846 году[1], хотя использоваться он начал только в 1950-х годах с появлением компьютеров[2]. Суть алгоритма заключается в том, чтобы по заданной симметрической матрице [math]A = A_0[/math] построить последовательность ортогонально подобных матриц [math]A_1,A_2,\dotsc,A_m[/math], сходящуюся к диагональной матрице, на диагонали которой стоят собственные значения. Для построения этой последовательности применяется специально подобранная матрица поворота [math]J_i[/math], такая что норма наддиагональной части [math]of\!f(A)=\sqrt{\sum\limits_{1 \le j \lt k \le n} a_{jk}^2}[/math] уменьшается при каждом повороте матрицы [math]A[/math]. Вычисление останавливается, когда угол поворота становится близок к нулю, либо когда максимальный внедиагональный элемент становится меньше заранее выбранного порогового значения.
1.2 Математическое описание алгоритма
Исходные данные: симметрическая матрица [math]A[/math] (элементы [math]a_{ij}[/math]).
Вычисляемые данные: диагональная матрица [math]\Lambda[/math] (элементы [math]\lambda_{ij}[/math]).
Матрица [math]A_{i+1}[/math] получается из [math]A_i[/math] по формуле [math]A_{i+1}={J_i}^TA_iJ_i[/math], где [math]J_i[/math] — ортогональная матрица, называемая вращением Якоби. При подходящем выборе [math]J_i[/math] матрица [math]A_m[/math] для больших m будет близка к диагональной матрице [math]\Lambda[/math].
Матрица [math]J_i[/math] выбирается так, чтобы сделать нулями пару внедиагональных элементов матрицы [math]A_{i+1}[/math][3].
[math]j[/math]
[math]k[/math]
[math] J_i = \begin{matrix} \\ \\ \\ j \\ \\ k \\ \\ \\ \\ \end{matrix} [/math] [math] \begin{bmatrix} & 1 & & & & & & & & \\ & & 1 & & & & & & & \\ & & & \ddots & & & & & & \\ & & & & \cos(\theta) & & -\sin(\theta) & & & \\ & & & & & \ddots & & & & \\ & & & & \sin(\theta) & & \cos(\theta) & & & \\ & & & & & & & \ddots & & \\ & & & & & & & & 1 & \\ & & & & & & & & & 1 \\ \end{bmatrix} [/math]
Обозначим [math]s = \sin \theta[/math] и [math]c = \cos \theta[/math]. Тогда матрица [math]A_{i+1}[/math] состоит из следующих элементов:
- [math]\begin{align} a_{jj}^{(i+1)} &= c^2\, a_{jj}^{(i)} - 2\, s c \,a_{jk}^{(i)} + s^2\, a_{kk}^{(i)} \\ a_{kk}^{(i+1)} &= s^2 \,a_{jj}^{(i)} + 2 s c\, a_{jk}^{(i)} + c^2 \, a_{kk}^{(i)} \\ a_{jk}^{(i+1)} &= a_{kj}^{(i+1)} = (c^2 - s^2 ) \, a_{jk}^{(i)} + s c \, (a_{kk}^{(i)} - a_{jj}^{(i)} ) \\ a_{jm}^{(i+1)} &= a_{mj}^{(i+1)} = c \, a_{jm}^{(i)} - s \, a_{km}^{(i)} & m \ne j,k \\ a_{km}^{(i+1)} &= a_{mk}^{(i+1)} = s \, a_{jm}^{(i)} + c \, a_{km}^{(i)} & m \ne j,k \\ a_{ml}^{(i+1)} &= a_{ml}^{(i)} &m,l \ne j,k \end{align}[/math]
Можно выбрать [math]\theta[/math] так, чтобы [math]a_{jk}^{(i+1)} = 0[/math] и [math]a_{kj}^{(i+1)} = 0[/math]. Отсюда получим равенство
- [math] \frac{a_{jj}^{(i)} - a_{kk}^{(i)}}{2 a_{jk}^{(i)}} = \frac{c^2 - s^2}{2sc} = \frac{\cos 2\theta}{\sin 2\theta} = \operatorname{tg}(2\theta) \equiv \tau [/math].
Положим [math]t = \frac{s}{c} = \operatorname{ctg}(\theta)[/math] и заметим, что [math]t^2 - 2t\tau + 1 = 0[/math]. Решая квадратное уравнение, находим [math]t = \frac{\operatorname{sign}(\tau)}{|\tau| + \sqrt{1+\tau^2}}, c = \frac{1}{\sqrt{1+t^2}}, s = tc[/math].
Выбор параметров [math]j[/math] и [math]k[/math] производится путем построчного циклического обхода внедиагональных элементов матрицы [math]A[/math].
1.3 Вычислительное ядро алгоритма
Рассматривая отдельную итерацию, можно считать, что вычислительное ядро составляют множественные вычисления элементов матрицы [math]a_{jm}^{(i+1)} = a_{mj}^{(i+1)}[/math] и [math]a_{km}^{(i+1)} = a_{mk}^{(i+1)}[/math], [math]m \ne j,k[/math] в процессе применения матрицы поворота [math]J_i[/math] к матрице [math]A[/math]:
- [math]\begin{align} a_{jm}^{(i+1)} &= a_{mj}^{(i+1)} = c \, a_{jm}^{(i)} - s \, a_{km}^{(i)} & m \ne j,k \\ a_{km}^{(i+1)} &= a_{mk}^{(i+1)} = s \, a_{jm}^{(i)} + c \, a_{km}^{(i)} & m \ne j,k, \end{align}[/math]
каждое из которых повторяется по [math] (n-2) [/math] раза, а также вычисление элементов [math]a_{jj}^{(i+1)} [/math] и [math]a_{kk}^{(i+1)} [/math]:
- [math]\begin{align} a_{jj}^{(i+1)} &= c^2\, a_{jj}^{(i)} - 2\, s c \,a_{jk}^{(i)} + s^2\, a_{kk}^{(i)} \\ a_{kk}^{(i+1)} &= s^2 \,a_{jj}^{(i)} + 2 s c\, a_{jk}^{(i)} + c^2 \, a_{kk}^{(i)} \end{align}[/math]
1.4 Макроструктура алгоритма
Основную часть метода составляет процедура применения вращения к матрице [math]A[/math], которая в дальнейшем будет обозначена как Jakobi-Rotation[math](A,j,k)[/math].
Эту процедуру, в свою очередь, можно разделить на две логические части:
- Определение угла поворота [math]\theta[/math] по элементам матрицы [math]a_{jj}[/math], [math]a_{kk}[/math] и [math]a_{jk}[/math];
- Поворот матрицы [math]A[/math] (изменяются лишь строки и столбцы, соответствующие индексам [math]j[/math] и [math]k[/math]).
1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
Алгоритм можно описать следующим образом[4]:
repeat выбрать пару индексов j,k обратиться к процедуре Jakobi-Rotation[math](A,j,k)[/math] пока [math]A[/math] не достаточно близка к диагональной матрице
Существует несколько способов выбора пары [math]j,k[/math]. Наиболее простой и быстрый способ — построчный циклический обход внедиагональных элементов матрицы [math]A[/math]:
repeat for [math]j=1[/math] to [math]n-1[/math] for [math]k=j+1[/math] to [math]n[/math] выполнить процедуру Jakobi-Rotation[math](A,j,k)[/math] end for end for пока [math]A[/math] не достаточно близка к диагональной матрице
Процедура Jakobi-Rotation[math](A,j,k)[/math] — это следующий алгоритм:
if [math]|a_{jk}|[/math] не слишком мал [math]\begin{align} \tau &= \frac{a_{jj}-a_{kk}}{2\,a_{jk}} \\ t &= \frac{sign(\tau)}{|\tau|+\sqrt{1+\tau^2}} \\ c &= \frac{1}{\sqrt{1+t^2}} \\ s &= c\,t \\ A &= R^T(j,k,\theta)\cdot A\cdot R(j,k,\theta), \qquad J_i = R(j,k,\theta),\ c = \cos \theta,\ s = \sin \theta \end{align}[/math] end if
1.6 Последовательная сложность алгоритма
Для осуществления одной итерации метода Якоби для матрицы размера [math](n\times n)[/math] требуется выполнить:
Для вычислительного ядра —
- [math] 4n+4 [/math] умножений,
- [math] 2n+2 [/math] сложений.
Для остальной части алгоритма —
- [math] 3 [/math] умножения,
- [math] 3 [/math] деления,
- [math] 5 [/math] сложений (вычитаний),
- [math] 2 [/math] извлечения квадратного корня.
Умножения и сложения (вычитания) составляют основную часть алгоритма.
Так как выбор индексов [math]j[/math] и [math]k[/math] осуществляется путем перебора внедиагональных элементов матрицы, для полного прохода потребуется [math]\frac{n(n-1)}{2}[/math] итераций.
Таким образом, при классификации по последовательной сложности метод Якоби вычисления собственных значений симметричной матрицы относится к алгоритмам с кубической сложностью.
1.7 Информационный граф
Граф алгоритма состоит из трёх групп вершин.
Первой группе вершин (J) соответствует вычисление значений c и s.
Второй группе вершин (А) соответствует вычисление значений элементов [math]a_{jm}^{(i+1)} = a_{mj}^{(i+1)}[/math] и [math]a_{km}^{(i+1)} = a_{mk}^{(i+1)}[/math], [math]m \ne j,k[/math].
Третьей группе вершин (B) соответствует вычисление значений элементов [math]a_{jj}^{(i+1)} [/math] и [math]a_{kk}^{(i+1)} [/math].
1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
Для выполнения одной итерации требуется последовательно выполнить следующие действия:
- вычислить [math]\tau[/math] (2 операции сложения, 1 операция деления)
- вычислить [math]t[/math] (1 операция сравнения, 1 операция взятия модуля, 2 операции сложения, 1 операция умножения, 1 операция деления, 1 операция извлечения квадратного корня)
- вычислить [math]c[/math] (1 операция сложения, 1 операция умножения, 1 операция деления, 1 операция извлечения квадратного корня) и [math]s[/math] (1 операция умножения)
После этого выполняется ярус, отвечающий за применение поворота к матрице [math]A[/math] с параллельным выполнением [math]2(n-2)[/math] операций вычисления элементов матрицы [math]a_{jm}^{(i+1)} = a_{mj}^{(i+1)}[/math] и [math]a_{km}^{(i+1)} = a_{mk}^{(i+1)}[/math], [math]m \ne j,k[/math] , а также 2 операций вычисления элементов [math]a_{jj}^{(i+1)} [/math] и [math]a_{kk}^{(i+1)} [/math]. Наибольшее количество операций содержится в вычислении последних двух элементов (по 6 умножений и 3 сложения).
Суммарное количество итераций зависит от входных данных и заданного значения погрешности. Один "цикл" (полный проход по внедиагональным элементам) осуществляется за [math]N = \frac{n(n-1)}{2}[/math] итераций. Асимптотически метод сходится квадратично[5]. Как правило, для сходимости метода Якоби требуется от 5 до 10 циклов, что хуже, чем у конкурирующих алгоритмов[6].
Таким образом, при классификации по высоте ЯПФ метод Якоби относится к алгоритмам со сложностью [math]O(n^2)[/math] , а при классификации по ширине ЯПФ — к алгоритмам со сложностью [math]O(n)[/math].
1.9 Входные и выходные данные алгоритма
Входные данные: матрица [math]A[/math] (элементы [math]a_{ij}[/math]). Дополнительные ограничения:
- [math]A[/math] – симметрическая матрица, т. е. [math]a_{ij}= a_{ji}, i, j = 1, \ldots, n[/math].
Объём входных данных: [math]\frac{n (n + 1)}{2}[/math] (в силу симметричности достаточно хранить только диагональ и над/поддиагональные элементы). В разных реализациях эта экономия хранения может быть выполнена разным образом.
Выходные данные: вектор собственных значений [math]\Lambda[/math] (элементы [math]\lambda_{ii}[/math]).
Объём выходных данных: [math] n [/math].
1.10 Свойства алгоритма
Метод Якоби является самым медленным из имеющихся алгоритмов вычисления собственных значений симметричной матрицы. Тем не менее, он способен вычислять малые собственные числа и отвечающие им собственные векторы с гораздо большей точностью, чем другие методы[7]. Кроме того, он не предполагает первоначального приведения матрицы к трехдиагональной форме.
Соотношение последовательной и параллельной сложности в случае неограниченных ресурсов для метода Якоби является линейным, вычислительная мощность алгоритма также линейна.
Метод Якоби не детерминирован, так как является итерационным алгоритмом с выходом по точности: число итераций зависит от входных данных и порогового значения.
Дуги информационного графа, исходящие из вершин, соответствующих вычислениям значений [math]c[/math] и [math]s[/math], образуют пучки рассылок линейной мощности.
2 Программная реализация алгоритма
2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
2.2 Локальность данных и вычислений
2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
2.6 Выводы для классов архитектур
2.7 Существующие реализации алгоритма
Существует библиотека JACOBI_EIGENVALUE, реализующая последовательный вариант метода Якоби на языках программирования С, С++, FORTRAN77, FORTRAN90, MATLAB, Python. Данная библиотека распространяется по лицензии GNU LESSER GENERAL PUBLIC LICENSE.
Существует также параллельная реализация метода на платформе CUDA.
3 Литература
<references \>
- ↑ Jacobi, C.G.J. (1846). «Über ein leichtes Verfahren, die in der Theorie der Säkularstörungen vorkommenden Gleichungen numerisch aufzulösen» (German). Crelle's Journal 30: 51–94.
- ↑ Golub, G.H. (2000). «Eigenvalue computation in the 20th century». Journal of Computational and Applied Mathematics 123 (1-2): 35–65. DOI:10.1016/S0377-0427(00)00413-1.
- ↑ Дж. Деммель «Вычислительная линейная алгебра» (стр. 244-245)
- ↑ Дж. Деммель «Вычислительная линейная алгебра» (стр. 246-248)
- ↑ J. H. Wilkinson. The Algebraic Eigenvalue Problem. Oxford University Press, UK, 1965. (стр 270)
- ↑ Дж. Деммель «Вычислительная линейная алгебра» (стр. 248)
- ↑ Дж. Деммель «Вычислительная линейная алгебра» (стр. 244)