Участник:Dmarkin/Алгоритм кластеризации, основанный на минимальном покрывающем дереве
Автор описания: Маркин Дмитрий Валерьевич, группа 611
Содержание
- 1 Свойства и структура алгоритмов
- 1.1 Общее описание алгоритма
- 1.2 Математическое описание алгоритма
- 1.3 Вычислительное ядро алгоритма
- 1.4 Макроструктура алгоритма
- 1.5 Схема реализации последовательного алгоритма
- 1.6 Последовательная сложность алгоритма
- 1.7 Информационный граф
- 1.8 Ресурс параллелизма алгоритма
- 1.9 Входные и выходные данные алгоритма
- 1.10 Свойства алгоритма
- 2 Программная реализация алгоритма
- 2.1 Особенности реализации последовательного алгоритма
- 2.2 Локальность данных и вычислений
- 2.3 Возможные способы и особенности параллельной реализации алгоритма
- 2.4 Масштабируемость алгоритма и его реализации
- 2.5 Динамические характеристики и эффективность реализации алгоритма
- 2.6 Выводы для классов архитектур
- 2.7 Существующие реализации алгоритма
- 3 Литература
1 Свойства и структура алгоритмов
1.1 Общее описание алгоритма
Кластеризация (или кластерный анализ) — это задача разбиения множества объектов на группы, называемые кластерами. Внутри каждой группы должны оказаться «похожие» объекты, а объекты разных группы должны быть как можно более отличны.
Алгоритм кластеризации на k кластеров, основанный на построении минимального остовного дерева (MST):
- По исходным данным строится граф. Каждый объект представляется в виде вершины графа, каждые две вершины соединяются ребром. Вычисляется вес ребра при помощи выбранной метрики (например, евклидовой);
- Для полученного графа строится минимальное остовное дерево при помощи одного из алгоритмов (наиболее распространены: Алгоритм Крускала, Алгоритм Борувки, Алгоритм Прима)
- Удаляется k-1 ребро минимального остовного дерева с максимальным весом и получаются k компонент связности.
1.2 Математическое описание алгоритма
Имеем [math]N[/math] объектов [math]x[/math], которые представляют собой элемент метрического пространства с метрикой [math]d(x_i,x_j)=\sqrt{\sum^{n}_{k=1} {(x_{ik}-x_{jk})^2}}[/math].
На первом шаге строим граф [math]G=(V,E)[/math] с множеством вершин [math]V[/math] ([math]|V|=N[/math]) и множеством ребер [math]E[/math] ([math]|E|=\frac{N*(N-1)} {2}[/math]).